有谁知道从MPI中读取/写入文件到我的hdfs的好方法吗?我已经进行了大量的挖掘工作,试图弄清楚这一点,只需要一个大致的方向即可。 最佳答案 MPI标准中有一整章是关于MPII/O的。我将从那里开始阅读。MPI实现有这个实现,通常使用ROMIO。您也可以看看那个。 关于hadoop-MPI读写HDFS,我们在StackOverflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/23943803/
我目前正致力于在MR-MPI(MPI上的MapReduce)上实现机器学习算法。我也在尝试了解其他MapReduce框架,尤其是Hadoop,所以以下是我的基本问题(我是MapReduce框架的新手,如果我的问题没有意义,我深表歉意)。问题:由于MapReduce可以在并行文件系统(GPFS)、HDFS、MPI等许多事物之上实现,等等。映射步骤之后是整理操作,然后是缩减操作。对于整理操作,我们需要跨节点进行一些数据移动。在这方面,我想知道HDFS、GPFS和MPI中的数据移动机制(节点之间)有什么区别。如果你能给我一些很好的解释,我很感激,并且可以给我一些很好的引用,这样我就可以深入了
我知道一些机器学习算法,例如随机森林,本质上应该并行实现。我做作业发现有这三种并行编程框架,所以我想知道这三种并行性之间的主要区别是什么?特别是,如果有人能给我指出一些研究来比较它们之间的区别,那就太完美了!请列出每种并行度的优缺点,谢谢 最佳答案 MPI是并行的消息传递范例。在这里,您有一台根机器,它在其MPI世界中的所有机器上生成程序。系统中的所有线程都是独立的,因此它们之间唯一的通信方式是通过网络消息。网络带宽和吞吐量是影响MPI实现性能的最关键因素之一。想法:如果每台机器只有一个线程,并且上面有多个内核,则可以使用OpenM
PhyloBayes-MPI的github地址:https://github.com/bayesiancook/pbmpigithub上面的东西下载以后不知道咋安装,啥啥都没有?还好有conda。!!!最简安装方法20230405提前安装好mambamambacreate-nphylobayes-cbiocondaphylobayes-mpicondaactivatephylobayesmpirun-np4pb_mpi-h旧探索过程PhyloBayes-MPI的anaconda地址:https://anaconda.org/bioconda/phylobayes-mpi1.>安装PhyloBa
MPI_Scatterv()函数的displs参数被称为“整数数组(长度组大小)”。条目i指定位移(相对于从中获取传出数据以处理i的sendbuf)。假设我有sendcounts参数intsendcounts[7]={3,3,3,3,4,4,4};我的推理方式是displs数组应该始终以值0开始,因为第一个条目相对于sendbuf的位移为0,所以在我上面的例子,displs应该是这样的:intdispls[7]={0,3,6,9,13,17,21};这样对吗?我知道这是一个微不足道的问题,但出于某种原因,网络根本没有帮助。那里没有很好的例子,因此我的问题。
我想在一个函数中使用多进程,我该怎么做。如您所知,MPI_Init需要两个参数:“intargc,char**argv”。这是否意味着我必须在函数定义中添加这两个参数?我的要求是我想并行化函数中的一个步骤,而不是主程序中的一个步骤。例如,func(mat&A,vec&x){somecomputationonA;autoB=sub_mat(A,0,10);B*x;//Iwanttoparallelizethiscomputation}main(){matA;vecx;func(A,x);}我只想在B*x中使用MPI,但我不知道如何初始化MPI?顺便说一句,如果我可以初始化MPIintfu
我正在使用CLion。我的CMakeLists.txt看起来像这样:cmake_minimum_required(VERSION3.2)project(MPI)add_executable(MPImain.cpp)#RequireMPIforthisproject:find_package(MPIREQUIRED)set(CMAKE_CXX_COMPILE_FLAGS${CMAKE_CXX_COMPILE_FLAGS}${MPI_COMPILE_FLAGS})set(CMAKE_CXX_LINK_FLAGS${CMAKE_CXX_LINK_FLAGS}${MPI_LINK_FLAGS}
我在下面写了一个示例代码:#include#includedoublex;intmain(intargc,char**argv){MPI_Init(&argc,&argv);MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD,&rank);MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD,&size);if(rank==0)x=10.1;MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD);printf("%f\n",x);MPI_Finalize();return0;}您可能会注意到,该程序实际上定义了一个名为x的全局变量,第零个线程试图为其分配一些值。当我在具有4个
我是MPI编程的新手,仍在学习,我成功地通过定义结构创建了派生数据类型。现在我想在我的结构中包含Vector并希望跨流程发送数据。例如:structStructure{//ConstructorStructure():X(nodes),mass(nodes),ac(nodes){//codetocalculatethemassandaccelerations}//DestructorStructure(){}//Variablesdoubleradius;doublevolume;vectormass;vectorarea;//andsomeothervariables//Method
我正在并行化一个已存在的应用程序,该应用程序将gTest与MPI结合使用。在MPI程序中,首先要做的是通过调用来初始化环境MPI_Init(int*argc,char***argv)在MPI程序结束时,根进程也应该调用MPI_Finalize。我如何使用GoogleTest为此类应用程序编写单元测试?特别是,在gTest修改它们之前,我如何从测试中访问argc和argv。现在我在做:intargc=0;char**argv=NULL;boost::mpi::environmentenv(argc,argv);TEST(component_test,test_name){//stuffu