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python - MPI Newbie - 关于 'mpirun' 工作原理和进程管理的一些问题

首先,我不是专业的程序员,但我必须为我的项目编写代码(尽管我对C++和python有一定的熟练程度)。当我遇到困难时,我经常来这里,大多数时候从这里得到很好的解决方案,但现在我有关于MPI编程的基本问题,否则在我了解它的概念之前我无法真正继续。这是我对问题的描述,我想为科学计算的算法创建代码。代码可以分为两部分。A.)矩阵vector乘法和矩阵求逆。这部分相对简单,我什至有自己的MPI代码用于这部分B.)调用外部MPI-ready程序进行更复杂的计算(这部分应该也很简单,因为它只是调用UNIX命令行)。我遇到的问题是如何将这两个部分连接在一起?我的算法是这样的,forkinspecif

c++ - 通过 boost :MPI got error 发送一个简单的 boost 图形对象

我正在通过修改“/apps/boost_1_56_0/libs/graph/test”中的代码“serialize.cpp”并尝试通过boostMPI通过网络发送一个boostgraph对象来进行测试。它编译得很好,但是当我使用mpirun运行可执行文件时,我得到了这个错误:terminatecalledafterthrowinganinstanceof'boost::archive::archive_exception'what():inputstreamerror.我想我正在读取一个空缓冲区,但不确定如何修复它。#include#include#include#include#in

c++ - MPI 在 C++ 中发送具有 vector 属性的结构

我想发送一个具有vector属性的结构。typedefstruct{intid;vectorneighbors;}Node;我知道我必须创建一个MPI派生数据类型,如thisanswer,但我不知道在我的情况下该怎么做,因为我在结构中有一个vector。 最佳答案 如果你想保持高水平并发送对象,那么Boost.MPI是个不错的选择。使用Boost.MPI,您可以为结构指定高级序列化。您不能(正确地)静态确定vector数据成员的偏移量。拼凑出一个有效的类型当然是可能的。但这也是搬起石头砸自己脚的好方法。您会在代码中引入假设(例如,v

c++ - 毫秒 mpi 错误 : unable to allocate launching block

我使用msmpi在VS2015中创建了简单的控制台程序。#include#include#includeintmain(intargc,char**argv){intrank=0,size=0;MPI_Init(&argc,&argv);/*startsMPI*/MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD,&rank);/*getcurrentprocessid*/MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD,&size);if(rank==0){charhelloStr[]="HelloWorld";//MPI_Send(helloStr,_countof(

c++ - MPI程序的段错误

我正在用C++编写一个使用MPI的程序。我的代码的简化版本是#include#include#include#include#defineRNumber3000000//Numberofloopstogousingnamespacestd;classLObject{/*Somethinghere*/public:voidFillArray(long*RawT){/*Doessomething*/for(inti=0;i程序编译正常,但在执行时给出了段错误。消息是===============================================================

c++ - MVAPICH 在 MPI_Send 上挂起大于急切阈值的消息

在c++/mpi(mvapich)中有一个简单的程序,发送一个float类型的数组。当我使用MPI_Send、MPI_Ssend、MPI_Rsend时,如果数据的大小超过急切阈值(在我的程序中为64k),则在调用MPI_Send期间我的程序挂起。如果数组小于阈值,程序运行正常。源代码如下:#include"mpi.h"#include#includeintmain(intargc,char*argv[]){intmype=0,size=1;MPI_Init(&argc,&argv);MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD,&mype);MPI_Comm_size(MP

c++ - MPI - 随着进程数量的增加没有加速

我正在编写程序来测试数字是否为素数。一开始我计算分配给每个进程的数字,然后将这个数量发送给进程。接下来,执行计算并将数据发送回保存结果的进程0。下面的代码有效,但是当我增加进程数时,我的程序不会加速。在我看来,我的程序不能并行运行。怎么了?这是我在MPI的第一个项目,因此欢迎任何建议。我使用mpich2,并在IntelCorei7-950上测试我的程序。主要.cpp:if(rank==0){intworkers=(size-1);readFromFile(path);intelements_per_proc=(N+(workers-1))/workers;intrest=N%eleme

c++ - MPI非阻塞调用后的障碍,没有簿记?

我正在做一堆MPI_Iallreduce非阻塞通信。我已将这些Iallreduce调用添加到我的代码中的几个不同位置。每隔一段时间,我想暂停并等待所有Iallreduce调用完成。具有MPI_Request簿记功能的版本1——有效:MPI_Requestrequests[];MPI_Iallreduce(...,requests[0]);...MPI_Iallreduce(...,requests[n-1]);for(inti=0;i但是,我在一个相当大的代码库中工作,我不想编写额外的代码来跟踪所有这些MPI_Request对象。我想执行以下操作:版本2没有MPI_Request簿记—

c++ - 什么相当于 MPI 中的套接字编程的 select()?

在套接字编程中,我们有select()允许我们同时检查多个套接字的功能。我想知道MPI库中是否也有这样的功能?在以下代码的第一个for循环中,我将多个非阻塞发送和接收请求从一个节点发送到每个其他节点。在第二个for循环中,我不想按顺序等待每个节点,而是想开始处理首先发送其数据的节点的数据。我想知道有什么办法吗?for(id=0;id根据给定的答案,我尝试修改我的代码,但在运行时我仍然遇到段错误。请帮我找出错误。for(id=0;id 最佳答案 最接近的等价物是MPI_Waitsome,您提供一个请求列表,它会在至少一个请求完成后立即

c++ - MPI 中发送消息数量未知时,如何接收?

我正在用MPI编程。我想发送一些东西到另一个处理器并在那里接收它,但我不知道我会发送多少消息。事实上,发送到另一个处理器的消息数量取决于我在程序中读取的文件,所以我不知道我应该在另一端写多少接收。我应该使用哪种方法和哪种功能? 最佳答案 您仍然可以使用发送和接收,但您还需要添加一种新的消息,告诉接收进程不会有新消息。通常这是通过使用不同的标签发送来处理的。所以你的程序看起来像这样:if(sender){while(data_to_send==true){MPI_Send(data,size,datatype,receiving_ra