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memory - MPI Fortran 代码 : how to share data on node via openMP?

我正在编写一个已经使用MPI的Fortan代码。现在,我面临一种情况,一组数据增长得非常大,但每个进程都相同,所以我希望每个节点只将它存储在内存中一次,并且一个节点上的所有进程都访问相同的数据。为每个进程存储一次会超出可用RAM。是否有可能使用openMP实现类似的目标?每个节点的数据共享是我唯一想要的,不需要其他每个节点的并行化,因为这已经通过MPI完成。 最佳答案 如果仅用于共享数据block,则无需实现混合MPI+OpenMP代码。你实际上要做的是:1)将世界通信器分成跨越同一主机/节点的组。如果你的MPI库实现了MPI-3.

c++ - 如何使用 MPI_Type_create_subarray?

很明显,它的论点是:intMPI_Type_create_subarray(intndims,intarray_of_sizes[],intarray_of_subsizes[],intarray_of_starts[],intorder,MPI_Datatypeoldtype,MPI_Datatype*newtype);但是,我无法理解此方法如何接收我们要拆分的原始数组以及它返回新子数组的位置(因为此方法应返回一个整数)。换句话说,我只是想看看这个方法在C++中的简单实现,我在网上找不到。 最佳答案 MPI_Type_create

c++ - 使用 MPI 通过命令行传递参数

我正在使用MPI调用来使用c++在多个进程上运行一个过程。我的Main函数中的前几行如下所示:intmain(intargc,char*argv[]){intcomm_sz;intmy_rank;MPI_Init(&argc,&argv);MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD,&comm_sz);MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD,&my_rank);x=atoi(argv[4]);y=atoi(argv[5]);现在当我使用执行和运行我的程序时mpiexec-n1program1010我希望为x和y分配值10和10,因为它们是传递的第4和第5

c++ - 共享内存、MPI 和排队系统

我的unix/windowsC++应用程序已经使用MPI进行了并行化:作业被拆分到N个cpus中,每个block并行执行,非常高效,非常好的速度扩展,作业做得很好。但有些数据在每个流程中重复出现,并且由于技术原因,这些数据不能轻易地通过MPI进行拆分(...)。例如:5Gb静态数据,为每个进程加载完全相同的数据可以在MPI中分布的4Gb数据,使用的CPU越多,每个CPU的RAM越小。在4CPU作业中,这意味着至少需要20Gb的RAM负载,大部分内存都“浪费”了,这太糟糕了。我正在考虑使用共享内存来减少整体负载,“静态”block每台计算机只会加载一次。所以,主要问题是:是否有任何标准的

c++ - 通过 MPI 发送和接收二维数组

我要解决的问题如下:我在大型二维矩阵中计算的C++串行代码。为了优化这个过程,我希望分割这个大的2D矩阵并使用MPI在4个节点(比如)上运行。节点之间发生的唯一通信是在每个时间步结束时共享边值。每个节点与其邻居共享边数组数据A[i][j]。基于对MPI的阅读,我有以下方案要实现。if(myrank==0){for(i=0tox)for(y=0toy){C++CODEIMPLEMENTATION....MPI_SEND(A[x][0],A[x][1],A[x][2],Destination=1.....)MPI_RECEIVE(B[0][0],B[0][1]......Sender=1.

python - 安装 mpi4py 时出错

我正在尝试使用pipinstallmpi4py安装mpi4py,但出现以下错误:error:Cannotfind'mpi.h'header.Checkyourconfiguration!!!在我之前的同一份错误报告中,clang:error:linkercommandfailedwithexitcode1(use-vtoseeinvocation)问题可能是什么?谢谢! 最佳答案 正如错误所说,缺少库。我通过安装libopenmpi-dev包解决了它sudoapt-getinstalllibopenmpi-dev然后使用pip安装m

python - 使用 mpi 而不是多处理模块时,python 中的并行应用程序变得更慢

最近,当我使用多处理模块和mpi4py作为通信工具测量并行应用程序的性能时,我观察到了一种奇怪的效果。该应用程序对数据集执行进化算法。大多数操作都是按顺序完成的,但评估除外。在应用了所有进化算子之后,所有个体都需要接收新的适应度值,这是在评估期间完成的。基本上它只是对浮点数(python的)列表执行的数学计算。在评估之前,数据集被mpi的scatter或python的Pool.map分散,然后是并行评估,然后数据通过mpi的收集或再次通过Pool.map机制返回。我的基准测试平台是一个运行Ubuntu11.10的虚拟机(virtualbox),在Corei7(4/8核)上运行OpenM

c++ - 学习 MPI for C++ 的最佳教程是什么?

已结束。这个问题是off-topic.它目前不接受答案。想要改进这个问题?Updatethequestion所以它是on-topic堆栈溢出。关闭10年前。社区审核了是否要重新打开此问题4个月前并关闭:不适合此网站我们不允许提出有关书籍、工具、软件库等建议的问题。您可以编辑问题,以便用事实和引用来回答它。Improvethisquestion我计划将MPI用于我的C++代码。我已经在我的电脑上安装了MPICH2。但是我对MPI了解不多,希望能找到一些资料来阅读。希望各位高手给我推荐一些好的Material。任何建议将不胜感激。 最佳答案

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关于异步 MPI_Irecv 的 c:MPI_Waital 错误

MPI_WaitallerrorforasynchronousMPI_Irecv我使用了2个MPI_Irecv,然后是2个MPI_Send,然后是MPI_Waital,用于MPI_Irecv,如下所示。经过几次计算,我再次编写了相同的代码块。但似乎MPI进程在第一块代码本身中失败了。我的通信是这样的,一个矩阵被水平分割,因为没有MPI进程,并且通信只发生在矩阵边界之间,矩阵网格下方发送"开始"/第一行到矩阵网格上方和矩阵网格上方发送'end'/最后一行到矩阵网格下方。123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536M