文章目录TreeTools能做什么安装常用功能对系统发育树指定根查看是否是roottree按照叶子名称指定root按照Node名称root将roottree保存取消root按照tiplabel或者node删除某些树枝转换成newick文本格式TreeTools全部函数系统发育树是生物学最常涉及到的内容，有多种软件（MEGA、iQtree、raxML等）以及多种算法（贝叶斯、最大似然法、邻接法等）生成多种格式（newick、nexus、phylip）的系统发育树。我们常常通过iTOL、ggtree进行可视化或者其他操作，这里介绍一个可以批量对树进行编辑、删除操作的R包-TreeTools。Tre