Conda简介Conda是一个开源的包管理系统和环境管理系统,可在Windows、macOS和Linux上运行。Conda可快速安装、运行和更新包及其依赖项。Conda可以轻松地在计算机上创建、保存、加载和切换环境。它是为Python程序而创造的,但它可以打包和分发任何语言的软件。简单来说,conda可以让我们一行命令安装更新卸载程序,以及进行环境管理。下图是一个实际的例子。我用conda创建了两个虚拟环境:R4和R41,分别用于运行4.0和4.1的R。而且在各自对应的环境中,安装了相应版本的R包。下图是vscode界面,我可以很方便的在多个版本间切换,同时创建多个R控制台,极大提高了效率。(
由于xx原因,需要用Alphafold2的conda版本的本地版本。所以花了两三天终于把alphafold2的conda本地版本给安装上了,主要是下载数据比较麻烦和费时间,总是有数据下载不全又要重新下载,docker版本的话有些配置实在难搞,折腾了一两个小时之后果断放弃使用conda版本。不过无论是哪个版本,都要先把数据下好,所以可以先把数据启动下载,然后在下载过程之中再去折腾alphfold的软件本体。虽然alphafold官方提供了一个能够全部下载的脚本,但是那个脚本太坑,下载完两个(bfd和params)就会断掉。所以还是要读一下下载脚本的内容,然后学着一个个下载。最麻烦的就是两个数据:
一、git基本命令创建SSHKey生成Ed25519密钥ssh-keygen-o-a100-ted25519-f~/.ssh/id_ed25519-C"you@example.com"参数说明:-o:使用新的OpenSSH格式来存储私钥,当使用ed25519格式时,默认会启用此选项-a:进行几轮KDF。值越大则密码验证越慢,也能更好的抗暴力破解。-t:创建的key的类型,我们使用ed25519-f:生成的文件名-C:可选注释,通常写自己的邮箱配置用户信息gitconfig--globaluser.name"myname"gitconfig--globaluser.emailxxxx@examp
数据库版本:9.6.6注意:PostgreSQL中的不同类型的权限有SELECT,INSERT,UPDATE,DELETE,TRUNCATE,REFERENCES,TRIGGER,CREATE,CONNECT,TEMPORARY,EXECUTE和USAGE。1.登录PG数据库以管理员身份postgres登陆,然后通过 #psql-Upostgres #sudo-i-upostgres $psql xc_hzh_linan #登录xc_hzh_linan数据库 $psql-Upostgrestest #以postgres用户身份,登录test数据库 psql-h
git命令学习 1.创建一个本地版本库$mkdirgittutorcn(创建文件夹)$cdgittutorcn(进入目录)$gitinit(初始化git)$gitremoteaddorigin远程仓库链接地址(将本地仓库和远程仓库关联)2.克隆库$gitclonehttps://git.oschina.net/xxxxx/xxxx.git(git连接)3.添加到版本库gitaddfilename(文件名)gitadd. (添加当前目前所有文件到版本库)4.提交代码 gitcommit$gitcommit-m"这里是log日志"$gitcommit-a-m"这里是log日志" #有文件修改的话,
天河二号超级计算机1.服务器集群服务器集群就是指将很多服务器集中起来一起进行同一种服务,在客户端看来就像是只有一个服务器,集群可以利用多个计算机进行并行计算从而获得很高的计算速度,也可以用多个计算机做备份,从而使得任何一个机器坏了整个系统还是能正常运行。集群是一组独立的计算机(节点)的集合体,节点间通过高性能的互连网络连接;各节点除了可以作为一个单一的计算资源供交互式用户使用外,还可以协同工作并表现为一个单一的、集中的计算资源供并行计算任务使用。1.1.集群系统基本信息集群配制的刀片计算节点的CPU,GPU配制情况系统配备的并行文件系统,各组刀片机之间的网络连接系统配制的登陆管理节点,部署的集
1.miniconda官网:https://conda.io/miniconda.html;#miniconda下载安装2.anaconda官网:https://anaconda.org/;#Wherepackages,notebooks,projectsandenvironmentsareshared.3.condaactivatebase;#激活base环境;4.condadeactivate;#离开base环境;5..activate;#激活conda环境;6.condaenvlist;#查看conda当前存在哪些环境;7.condalist;#查看conda当前环境安装了哪些软件和包;
目录一.Conda简介二.Conda常用指令1.虚拟环境管理2.模块/包管理一.Conda简介Conda是一个开源的包管理系统和环境管理系统,可在Windows、macOS和Linux上运行。Conda可快速安装、运行和更新包及其依赖项,因此可以轻松地在计算机上创建、保存、加载和切换环境。它本是为Python程序而创造的,因为Python的版本比较多,并且它的库也非常广泛,同时库和库之间存在很多依赖关系,所以在库的安装和版本的管理上很麻烦,因此设计Conda作为一个管理版本和Python环境的工具,但它业可以打包和管理任何语言的软件。conda包含在Anaconda里的,因此安装了Anacon
文章目录1.下载repo:2.获取工程repo信息3.下载代码4.创建并切换本地分支5.repoforall6.repoupload7.repolist8.repoinfo9.repohelp1.下载repo:使用下面命令,具体版本号参考前面网页中显示的最新版本号。curlhttp://git-repo.googlecode.com/files/repo-1.19>~/bin/repo修改执行权限chmoda+x~/bin/repo2.获取工程repo信息本地创建一个工程目录,并进去以下命令下载指定分支(branch)repoinit-ugit://172.16.1.31/manifest.g
Docker安装及常用命令整理1、Docker简介2、Docker环境安装2.1、移除以前docker相关包2.2、配置yum源2.3、安装docker2.4、启动2.5、配置加速3、Docker镜像常用命令3.1、搜索镜像3.2、下载镜像3.3、列出镜像3.4、删除镜像3.5、打包镜像3.6、导入镜像3.7、容器打包3.8、导入容器3.9、推送镜像3.10、新建并启动容器3.11、列出容器3.12、停止容器3.13、强制停止容器3.14、启动容器3.15、进入容器3.16、退出容器3.17、删除容器3.18、查看容器的日志3.19、修改容器的启动方式3.20、同步宿主机时间到容器3.21、查