我正在尝试子类化pysam'sTabixfile类并在实例化时添加额外的属性。classMyTabixfile(pysam.Tabixfile):def__init__(self,filename,mode='r',*args,**kwargs):super().__init__(filename,mode=mode,*args,**kwargs)self.x='foo'当我尝试实例化我的MyTabixfile子类时，我得到一个TypeError:object.__init__()takesnoparameters:>>>mt=MyTabixfile('actn2-oligos-for
我应该如何在没有gil的Cython函数中使用print？例如:fromlibc.mathcimportlog,fabscpdefdoublef(doublea,doubleb)nogil:cdefdoublec=log(fabs(a-b))printcreturnc编译时报错:ErrorcompilingCythonfile:...printc^------------------------------------------------------------Pythonprintstatementnotallowedwithoutgil...我知道如何使用C库而不是它们的pyt
我包装了大量的C++函数，如果底层套接字连接丢失，这些函数会引发异常。虽然我已经想出如何包装我的“获取连接”功能以重新建立连接和/或尝试列表中的其他可用服务器，但我无法找到一个解决方案来创建一个try..except包装器以提供给80+C++函数。#--client.pxd---cdefexternfrom"rpc/RpcService.h":cdefcppclassRpcServiceClient:voidgetProject(ProjectT&,Guid&id)nogilexcept+cdefexternfrom"client.h":cdefcppclassClient:RpcSe
当传递一个numpy日期时间数组(或足以创建日期时间的详细信息)时，我正在尝试使用Cython加快日期时间之间的比较。首先，我试图了解Cython将如何加速整数之间的比较。testArrayInt=np.load("testArray.npy")Python方法:defprocessInt(array):compareSuccess=0#numberthatisgreaterthantestValue=1#valuetocompareagainstforcounterinrange(testArrayInt.shape[0]):iftestValue>testArrayInt[coun
我正在尝试将一些python代码移植到cython，但我遇到了一些小问题。下面是代码的代码片段(简化示例)。cimportnumpyasnpcimportcython@cython.boundscheck(False)#turnofbounds-checkingforentirefunction@cython.wraparound(False)@cython.nonecheck(False)defInterpolation(cells,intnmbcellsx):cdefnp.ndarray[float,ndim=1]cellecdefintcellnonzerocdefinti,lf
我已经下载了Pandas源代码，现在正在尝试调试它。我修改了Makefile:sparse:pandas/src/sparse.pyxpython-dbgsetup.pybuild_ext--inplace--pyrex-gdbbuild:clean_pycpython-dbgsetup.pybuild_ext--inplace--pyrex-gdbdevelop:build-python-dbgsetup.pydevelop--pyrex-gdb我还有一个非常简单的脚本:fromnumpyimportasarrayfrompandasimportalgosv=[4171.0,0.0]
我正尝试在O'reillyCythonbook之后将Cython代码嵌入到C中第8章。我在Cython的documentation上找到了这一段但还是不知道该怎么办:IftheCcodewantingtousethesefunctionsispartofmorethanonesharedlibraryorexecutable,thenimport_modulename()functionneedstobecalledineachofthesharedlibrarieswhichusethesefunctions.Ifyoucrashwithasegmentationfault(SIGS
我有一个python2.7的Python脚本，这样说:print("HelloWorld!")接下来，我使用以下方法将其转换为C:pythoncython.py--embedhelloworld.py然后我尝试静态编译它:gcc-IC:\Python27\include-LC:\Python27\libshelloworld.c-Wl,-Bstatic-lpython27-Wl,-Bdynamic但是gcc只是创建了一个使用python27.dll运行时的二进制文件。如何创建静态链接到运行时的二进制文件？ 最佳答案 如果您在Linu
我想用尽可能少的副本快速填充从C递增接收的一长串结构。如果我的结构只有主要数据类型，如下所示:cdefpackedstructoh_hi:intluckycharunlucky然后下面的工作正常:DEFMAXPOWER=1000000cdefoh_hi*hi2u=malloc(sizeof(oh_hi)*MAXPOWER)cdefoh_hi[:]hi2me=hi2u但是一旦我改变我的结构来保存一个字符数组:cdefpackedstructoh_hi:intluckycharunlucky[10]之前的memoryview转换编译但运行时给出:ValueError:Expected1di
当我遇到这个非常奇怪的行为时，我正在为numpy编写一个新的随机数生成器，它根据任意分布生成随机数:这是test.pyx#cython:boundscheck=False#cython:wraparound=FalseimportnumpyasnpcimportnumpyasnpcimportcythondefBareBones(np.ndarray[double,ndim=1]a,np.ndarray[double,ndim=1]u,r):returnudefUntypedWithLoop(a,u,r):cdefinti,j=0foriinrange(u.shape[0]):j+=i
