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dna-sequence

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swift - 嵌套通用约束 : Constrain the T of a generic item inside a generic sequence extension that is constrained to that generic type

在Swift中,我们可以对序列等通用项编写扩展:extensionSequencewhereIterator.Element:ObservableType{}这将保证扩展仅适用于(在本例中)RxSwiftobservables的序列。但是,如果元素约束是另一个泛型,那么您能否约束该泛型?例如:extensionSequencewhereIterator.Element:ObservableTypewhereE:MyType{}在上面的伪代码(不起作用)中,意图是说:此扩展应该适用于Observable的序列,其中Observable是类型为MyType的Observable,例如[可观

arrays - “数组”不可用 : please construct an Array from your lazy sequence: Array(. ..) 错误

刚更新到swift2.0,我遇到了错误。我收到的错误是:'array'不可用:请从您的惰性序列构造一个数组:Array(...)我的代码是:ifletcredentialStorage=session.configuration.URLCredentialStorage{letprotectionSpace=NSURLProtectionSpace(host:URL!.host!,port:URL!.port?.integerValue??0,`protocol`:URL!.scheme,realm:URL!.host!,authenticationMethod:NSURLAuthen

ios - 参数类型 'Range<Int>' 不符合预期类型 'Sequence' Swift3

嗨,我在Swift3之后遇到错误。我该如何解决这个错误?这些方法提供不重复的随机数。funcuniqueRandoms(_count:Int,inRangerange:Range,blacklist:[Int]=[])->[Int]{varr=[Int](range).filter{!blacklist.contains($0)}.shuffle()returnArray(r[0..Array{varnewArray=selfforiin0..谢谢 最佳答案 使用range的lowerBound和upperBound属性为[Int]

ios - 在 runBlock 发生后延迟 SKAction.sequence 中的下一个 Action (Swift)?

moveTo的duration属性在runBlock中没有被遵循,允许序列中的后续Action在以下情况下立即执行它应该只在duration秒后执行。代码A(正确执行的序列):letrealDest=CGPointMake(itemA.position.x,itemA.position.y)letmoveAction=SKAction.moveTo(realDest,duration:2.0)itemB.runAction(SKAction.sequence([SKAction.waitForDuration(0.5),moveAction,SKAction.runBlock{item

java - Hibernate IDENTITY 与 SEQUENCE 实体标识符生成器

这article说:Unlikeidentity,thenextnumberforthecolumnvaluewillberetrievedfrommemoryratherthanfromthedisk–thismakesSequencesignificantlyfasterthanIdentity在identity的情况下是不是说ID来自磁盘?如果是,那么是哪个磁盘以及如何?使用序列,我可以在日志中看到,在插入新记录时对数据库进行了额外的选择查询。但是在身份的情况下,我没有在日志中找到额外的选择查询。那么序列如何变得比身份更快? 最佳答案

java - : sequence id using JPA @TableGenerator, @GeneratedValue 与数据库 Auto_Increment 之间有什么区别

问题1.:在数据库中使用序列ID有什么区别A.CREATETABLEPerson(idlongNOTNULLAUTO_INCREMENT...PRIMARYKEY(id))对比B.@EntitypublicclassPerson{@Id@TableGenerator(name="TABLE_GEN",table="SEQUENCE_TABLE",pkColumnName="SEQ_NAME",valueColumnName="SEQ_COUNT",pkColumnValue="PERSON_SEQ")@GeneratedValue(strategy=GenerationType.TAB

python - 用 Python 生成所有 DNA kmers

我在处理这段python代码时遇到了一些麻烦。我是python的新手,我想生成所有可能的长度为k的DNAkmers并将它们添加到列表中,但是我想不出一种优雅的方法来做到这一点!以下是我对长度为8的kmer的看法。任何建议都会非常有帮助。bases=['A','T','G','C']kmer=list()foriinbases:forjinbases:forkinbases:forlinbases:forminbases:forninbases:foroinbases:forpinbases:kmer.append(i+j+k+l+m+n+o+p) 最佳答案

python - 使用 Python 反向补充 DNA 链

我有一个DNA序列,想使用Python对其进行反向补码。它位于CSV文件的一列中,我想将反向补码写入同一文件中的另一列。棘手的部分是,有一些单元格除了A、T、G和C之外还有其他东西。我能够用这段代码获得反向补码:defcomplement(seq):complement={'A':'T','C':'G','G':'C','T':'A'}bases=list(seq)bases=[complement[base]forbaseinbases]return''.join(bases)defreverse_complement(s):returncomplement(s[::-1])prin

python - 改进DNA比对去间隙的代码设计

这是一个关于更高效的代码设计的问题:假设三个对齐的DNA序列(seq1、seq2和seq3;它们都是字符串)代表两个基因(gene1和gene2)。相对于比对的DNA序列,这些基因的起始和终止位置是已知的。#Inputalign={"seq1":"ATGCATGC",#Inseq1,gene1andgene2areofequallength"seq2":"AT----GC","seq3":"A--CA--C"}annos={"seq1":{"gene1":[0,3],"gene2":[4,7]},"seq2":{"gene1":[0,3],"gene2":[4,7]},"seq3":{

python - 值错误 : cannot copy sequence with size 2 to array axis with dimension 4

任何人都可以向我解释这个错误是从哪里来的吗?这是什么意思?我该如何解决?也许我的问题太笼统了!对不起,但我不知道我应该在这里多放些什么!:P错误:Traceback(mostrecentcalllast):File"C:\test\7.4.3.bench.py",line9,inprintimagesearch.compute_ukbench_score(src,imlist[:100])File"C:\test\imagesearch.py",line168,incompute_ukbench_scorepos[i]=[w[1]-1forwinsrc.query(imlist[i])