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跟着Nature Communications学作图:R语言ggplot2做堆积柱形图展示群体基因组学的结果

论文Genomicinsightsintolocaladaptationandfutureclimate-inducedvulnerabilityofakeystoneforesttreeinEastAsiahttps://www.nature.com/articles/s41467-022-34206-8#Sec23完整的数据分析代码涉及到群体基因组学作图数据``https://github.com/jingwanglab/Populus_genomic_prediction_climate_vulnerability作者的github主页还有很多其他内容https://github.com

跟着Nature学作图:R语言ggplot2散点图和添加辅助线完整示例

论文Graphpangenomecapturesmissingheritabilityandempowerstomatobreedinghttps://www.nature.com/articles/s41586-022-04808-9#MOESM8没有找到论文里的作图的代码,但是找到了部分组图数据,我们可以用论文中提供的原始数据模仿出论文中的图今天的推文重复一下论文中的ExtendedDataFig7aimage.png部分示例数据截图image.png将数据整理成作图需要的格式library(tidyverse)table(dat01$type)dat01%>%filter(type=="

跟着Nature Metabolism学作图:R语言ggplot2各种各样柱形图(1)

论文Single-cellprofilingofvascularendothelialcellsrevealsprogressiveorgan-specificvulnerabilitiesduringobesityhttps://www.nature.com/articles/s42255-022-00674-x#Sec58s42255-022-00674-x.pdfhttps://github.com/Osynchronika/sc_EC_obesity_atlas大部分作图的数据都有,可以试着用论文中提供的数据复现一下论文中的图论文中figure2和figure3中有很多种柱形图,争取把

运行超千亿不同电路、可编程,国内团队DNA计算机论文登Nature

在计算机的庞大宇宙里,有依赖于硅晶片的常规计算机,也有生物形式的DNA计算机。后者利用DNA建立一种完整的信息技术形式,以编码的DNA序列为运算对象,通过分子生物学的运算操作来解决复杂的数学难题。DNA计算机依赖的不再是硅晶片,而是大自然数十亿年来用以编码生命蓝图的分子。这类计算机通过实验室操作来执行计算,并以DNA链式形式的数据作为输入和输出。与常规计算机相比,DNA计算的一个潜在优势在于它可以存储的数据密度。理论上,DNA每平方毫米最多可以存储1艾字节(exabyte)或10亿千兆字节。不仅如此,一滴水就能容纳数万亿DNA分子,这表明DNA计算能够并行执行海量计算的同时,只需要很少的能量。

hive表的全关联full join用法

背景:实际开发中需要用到全关联的用法,之前没遇到过,现在记录一下。需求是找到两张表的并集。全关联的解释如下;下面建两张表进行测试test_a表的数据如下test_b表的数据如下;写第一个fulljoin的SQL进行查询测试select*frompdata_dynamic.test_aafulljoinpdata_dynamic.test_bbona.id=b.id;查询结果显示如下;把两个表的结果拼在一行了,匹配不上的都用NULL值进行填充了,显然不是我要的结果优化好的fulljoin的SQL写法如下selectcasewhena.idisnullthenb.idelsea.idendid,c

跟着Nature Communications学数据分析:R语言做随机森林模型并对变量重要性排序

论文Driversandtrendsofglobalsoilmicrobialcarbonovertwodecadeshttps://www.nature.com/articles/s41467-022-31833-z#data-availability这个里面有很多地图的图还有自定义图例形状的代码数据和代码https://github.com/gpatoine/drivers_trends_microbial_carbon这里有随机森林模型然后对变量重要性进行排序的代码,今天的推文我们重复一下论文中的这部分内容,目前能够利用代码和数据运行得到结果,但是还不明白原理和代码中参数的具体作用。今天

Nature子刊 | 周集中团队揭示长期气候变暖导致草地土壤微生物多样性降低

题目:Reductionofmicrobialdiversityingrasslandsoilisdrivenbylong-termclimatewarming发表杂志:NatureMicrobiology发表年月:2022年6月第一作者:吴林蔚、ZhangYa、郭雪通讯作者:周集中第一单位:北京大学城市与环境学院生态研究所影响因子:17.74DOI:10.1038/s41564-022-01147-3原文链接:https://www.nature.com/articles/s41564-022-01147-3-研究背景-气候变化对生物多样性的影响包括物种地理范围的变化、物种灭绝、物种范围内丰

跟着Nature Genetics学作图:使用ggarrange包对ggplot2的多个图进行组合

论文PlasmaproteomeanalysesinindividualsofEuropeanandAfricanancestryidentifycis-pQTLsandmodelsforproteome-wideassociationstudieshttps://www.nature.com/articles/s41588-022-01051-w本地pdfs41588-022-01051-w.pdf代码链接https://zenodo.org/record/6332981#.YroV0nZBzichttps://github.com/Jingning-Zhang/PlasmaProtein/

Doris(七) -- 修改表、动态和临时分区、join的优化

修改表修改表名--1.将名为table1的表修改为table2ALTERTABLEtable1RENAMEtable2;--示例ALTERTABLEaggregate_testRENAMEaggregate_test1;--2.将表example_table中名为rollup1的rollupindex修改为rollup2ALTERTABLEbase_table_nameRENAMEROLLUPold_rollup_namenew_rollup_name;ALTERTABLEex_userRENAMEROLLUProllup_u_costnew_rollup_u_cost;descex_user

【人工智能】NLP自然语言处理领域发展史 | The History of Development in Natural Language Processing (NLP) Field

NLP自然语言处理领域发展史|TheHistoryofDevelopmentinNaturalLanguageProcessing(NLP)Field自然语言处理(NaturalLanguageProcessing,NLP)是人工智能(AI)领域的重要分支,旨在让计算机能够理解、处理和生成自然语言,如英语、汉语等。本文将介绍NLP领域的发展历史和里程碑事件。文章目录NLP自然语言处理领域发展史|TheHistoryofDevelopmentinNaturalLanguageProcessing(NLP)Field第一章:NLP的起源和早期发展1.1早期的规则方法1.2基于机器学习的方法第二章: