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Windows系统下本地Blast(本地化的自定义blast)

一、本地Blast用途介绍:在我们平时的学习、实验、和数据分析的时候经常会遇到将某条序列或者某个fasta文件比对到某个数据库的情况,或者已知序列与自定义数据库的比对,这种是在线blast无法完成的。下面就详细介绍一下本地的Blast(BasicLocalAlignmentSearchTool)的安装及使用。二、本地Blast的安装:https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/1.点击下载。下载网址2.下载后正常安装即可,这里不再赘述。安装成功后,会生成两个文件夹,分别是bin和doc,其中bin是程序目录,doc是

Windows系统下本地Blast(本地化的自定义blast)

一、本地Blast用途介绍:在我们平时的学习、实验、和数据分析的时候经常会遇到将某条序列或者某个fasta文件比对到某个数据库的情况,或者已知序列与自定义数据库的比对,这种是在线blast无法完成的。下面就详细介绍一下本地的Blast(BasicLocalAlignmentSearchTool)的安装及使用。二、本地Blast的安装:https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/1.点击下载。下载网址2.下载后正常安装即可,这里不再赘述。安装成功后,会生成两个文件夹,分别是bin和doc,其中bin是程序目录,doc是

「BLAST Zone」plus「一键进化树」

写在前面那天夏老师突然给我了一个电话,大体是提了这么一个想法,亦即,「BLASTZone」挺好的,但如果可以加上「OneStepMLTree」似乎就更好了。当然,这个事情其实不是没想过。主要还是涉及到一个多库检索,路径解决以及一些调整起来相对麻烦的事情。于是也就不了了之了。不过,今晚我还是花了时间,把这个功能实现了。至于为什么?因为心情确实不好,今天一天心情都不怎样。来来去去,也只能谢谢代码来放松下子了。回到主题,其实,这个功能,似乎不需要说明。BLAST+建树随后,等就完事了。注意到,其中可以指定使用BLAST结果的前多少个序列拿来建树,大体如下多条序列当然,我们可以输入多条序列,BLAST

「BLAST Zone」plus「一键进化树」

写在前面那天夏老师突然给我了一个电话,大体是提了这么一个想法,亦即,「BLASTZone」挺好的,但如果可以加上「OneStepMLTree」似乎就更好了。当然,这个事情其实不是没想过。主要还是涉及到一个多库检索,路径解决以及一些调整起来相对麻烦的事情。于是也就不了了之了。不过,今晚我还是花了时间,把这个功能实现了。至于为什么?因为心情确实不好,今天一天心情都不怎样。来来去去,也只能谢谢代码来放松下子了。回到主题,其实,这个功能,似乎不需要说明。BLAST+建树随后,等就完事了。注意到,其中可以指定使用BLAST结果的前多少个序列拿来建树,大体如下多条序列当然,我们可以输入多条序列,BLAST
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