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使用 Monai 和 PyTorch 预处理 3D Volumes以进行肿瘤分割

1.介绍针对在使用传统图像处理工具时可能遇到的困难,深度学习已成为医疗保健领域的主要解决方案。因为医学图像比标准图像更难处理(高对比度、人体的广泛变化……)深度学习用于分类、对象检测,尤其是分割任务。在分割方面,深度学习用于分割人体器官,如肝脏、肺和……或分割来自身体不同部位的肿瘤。医学图像有很多不同的类型,例如MRI(主要用于脑肿瘤分割)、CT扫描、PET扫描等。本文将重点介绍CT扫描,但同样的操作也适用于其他类型。所以我们知道执行深度学习任务需要许多步骤,其中一个是数据预处理,这是我们在开始训练之前必须做的第一件事。这是本文的主题;我们将讨论可用于执行此预处理的工具。准备数据因任务而异;例

Docker 上的 Wordpress : Could not create directory on mounted volume

这是路径/var/www/html上WordpressDocker容器中的原始文件:$dockerexec5b957c7b9c5ad054883694afbfb80d3c9df6707458d55011f471be0701f3890cls-ltotal192-rw-r--r--1www-datawww-data418Sep252013index.php-rw-r--r--1www-datawww-data19935Jan218:51license.txt-rw-r--r--1www-datawww-data7433Jan1117:46readme.html-rw-r--r--1www-

Docker 上的 Wordpress : Could not create directory on mounted volume

这是路径/var/www/html上WordpressDocker容器中的原始文件:$dockerexec5b957c7b9c5ad054883694afbfb80d3c9df6707458d55011f471be0701f3890cls-ltotal192-rw-r--r--1www-datawww-data418Sep252013index.php-rw-r--r--1www-datawww-data19935Jan218:51license.txt-rw-r--r--1www-datawww-data7433Jan1117:46readme.html-rw-r--r--1www-

linux - 为什么要在 Dockerfile 中使用 VOLUME?

对我来说,Dockerfile中的VOLUME并不能做任何事情,命令行上的-v实际上使容器内的目录可用。当我阅读VOLUME的Docker手册时,我不是很清楚,为什么我想把它写在Dockerfile中,而不仅仅是在命令行上? 最佳答案 在Dockerfile中定义卷默认情况下不会将卷暴露给主机。相反,它设置链接卷以允许其他容器链接到其他Docker容器中的卷。这通常用于“数据容器”配置中,在该配置中,您启动容器的唯一目的是持久化数据。这是一个简单的例子:dockerrun-d--namedocker_datadocker/image

linux - 为什么要在 Dockerfile 中使用 VOLUME?

对我来说,Dockerfile中的VOLUME并不能做任何事情,命令行上的-v实际上使容器内的目录可用。当我阅读VOLUME的Docker手册时,我不是很清楚,为什么我想把它写在Dockerfile中,而不仅仅是在命令行上? 最佳答案 在Dockerfile中定义卷默认情况下不会将卷暴露给主机。相反,它设置链接卷以允许其他容器链接到其他Docker容器中的卷。这通常用于“数据容器”配置中,在该配置中,您启动容器的唯一目的是持久化数据。这是一个简单的例子:dockerrun-d--namedocker_datadocker/image

ruby-on-rails - 如何设置 dokku-persistent-storage 的音量

我正在尝试使用dokku-persistent-storage所以我为我的rails应用程序上传的内容保留在服务器上,但我不太了解如何构建路径,因为我是Dokku的新手和Docker.(我在DigitalOcean上的Ubuntudroplet上运行它)我不确定它是否应该是这样的:[SERVERIPADDRESS]/home/dokku/myapp/public_folder或/home/dokku/myapp/public_folder或者如果我已经离开了,那应该是完全不同的东西。这是github部分所说的:在您的应用程序文件夹(/home/dokku/app_name)中创建一个名

ruby-on-rails - 如何设置 dokku-persistent-storage 的音量

我正在尝试使用dokku-persistent-storage所以我为我的rails应用程序上传的内容保留在服务器上,但我不太了解如何构建路径,因为我是Dokku的新手和Docker.(我在DigitalOcean上的Ubuntudroplet上运行它)我不确定它是否应该是这样的:[SERVERIPADDRESS]/home/dokku/myapp/public_folder或/home/dokku/myapp/public_folder或者如果我已经离开了,那应该是完全不同的东西。这是github部分所说的:在您的应用程序文件夹(/home/dokku/app_name)中创建一个名

Docker 卷 : Docker Volume does not get mounted correctly on Amazon Linux

我目前正在尝试使用ansible将docker注册表部署到Amazonec2。我的食谱中的任务如下所示:-name:rundockerregistrycontainerdocker:image:registryname:docker-registrystate:reloadedenv:SETTINGS_FLAVOR:localSTORAGE_PATH:/opt/docker-registrySEARCH_BACKEND:sqlalchemyvolumes:-"/data/docker-registry-server/opt/docker-registry:/opt/docker-reg

Docker 卷 : Docker Volume does not get mounted correctly on Amazon Linux

我目前正在尝试使用ansible将docker注册表部署到Amazonec2。我的食谱中的任务如下所示:-name:rundockerregistrycontainerdocker:image:registryname:docker-registrystate:reloadedenv:SETTINGS_FLAVOR:localSTORAGE_PATH:/opt/docker-registrySEARCH_BACKEND:sqlalchemyvolumes:-"/data/docker-registry-server/opt/docker-registry:/opt/docker-reg

docker - Jenkins 声明性管道 : How can I mount a temporary volume associated with the workspace in a docker container?

我想在docker容器中挂载与工作区关联的临时卷以进行gradle缓存。使用ScriptedPipeline,它可以写成如下。docker.image('my-gradle').inside("-v${pwd(tmp:true)}:/home/jenkins/.gradle"){sh'./gradlewtest'}但使用声明式管道,以下会导致错误。agent{dockerfile{dir'path/to/dockerfileDir'label'docker-nodes'args"-v${pwd(tmp:true)}:/home/jenkins/.gradle"}}控制台日志如下。$do