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python - 如何缓存读取?

我正在使用python/pysam来分析测序数据。在它的命令伙伴教程(pysam-AninterfaceforreadingandwritingSAMfiles)中说:'这种方法对于高通量处理来说太慢了。如果读取需要与其伙伴一起处理,请从读取名称排序文件或更好的缓存读取中工作。'您将如何“缓存读取”? 最佳答案 Caching是加速长时间运行操作的典型方法。它为了计算速度而牺牲了内存。假设您有一个函数,给定一组参数总是返回相同的结果。不幸的是,这个函数非常慢,你需要调用它很多次,这会减慢你的程序。您可以做的是存储有限数量的{para

python - 如何缓存读取?

我正在使用python/pysam来分析测序数据。在它的命令伙伴教程(pysam-AninterfaceforreadingandwritingSAMfiles)中说:'这种方法对于高通量处理来说太慢了。如果读取需要与其伙伴一起处理,请从读取名称排序文件或更好的缓存读取中工作。'您将如何“缓存读取”? 最佳答案 Caching是加速长时间运行操作的典型方法。它为了计算速度而牺牲了内存。假设您有一个函数,给定一组参数总是返回相同的结果。不幸的是,这个函数非常慢,你需要调用它很多次,这会减慢你的程序。您可以做的是存储有限数量的{para

linux - 无法执行 'x86_64-conda_cos6-linux-gnu-gcc' : No such file or directory (pysam installation)

我正在尝试安装pysam。执行后:pythonpath/to/pysam-master/setup.pybuild产生这个错误:unabletoexecute'x86_64-conda_cos6-linux-gnu-gcc':Nosuchfileordirectoryerror:command'x86_64-conda_cos6-linux-gnu-gcc'failedwithexitstatus1有类似的线程,但它们似乎都解决了我没有的管理员权限问题。有没有办法安装所需的文件?免责声明:这个问题来self之前的一篇帖子。manuallyinstallingpysamerror:"Im

linux - 无法执行 'x86_64-conda_cos6-linux-gnu-gcc' : No such file or directory (pysam installation)

我正在尝试安装pysam。执行后:pythonpath/to/pysam-master/setup.pybuild产生这个错误:unabletoexecute'x86_64-conda_cos6-linux-gnu-gcc':Nosuchfileordirectoryerror:command'x86_64-conda_cos6-linux-gnu-gcc'failedwithexitstatus1有类似的线程,但它们似乎都解决了我没有的管理员权限问题。有没有办法安装所需的文件?免责声明:这个问题来self之前的一篇帖子。manuallyinstallingpysamerror:"Im