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r - Shiny 的服务器崩溃

背景:我在RHEL5机器上运行shiny-server,它一直以不可重现的方式崩溃。似乎node.js与错误有关..错误如下:Error:writeEIOaterrnoException(net.js:901:11)atObject.afterWrite(net.js:718:19)来自/var/log/shiny-server.log的日志[2015-07-1517:28:20.982][INFO]shiny-server-^[[39mShinyServerv1.4.0.718(Node.jsv0.10.21)^[[32m[2015-07-1517:28:20.984][INFO]s

r - Shiny 的服务器崩溃

背景:我在RHEL5机器上运行shiny-server,它一直以不可重现的方式崩溃。似乎node.js与错误有关..错误如下:Error:writeEIOaterrnoException(net.js:901:11)atObject.afterWrite(net.js:718:19)来自/var/log/shiny-server.log的日志[2015-07-1517:28:20.982][INFO]shiny-server-^[[39mShinyServerv1.4.0.718(Node.jsv0.10.21)^[[32m[2015-07-1517:28:20.984][INFO]s

通过R语言实现平稳时间序列的建模--基础(ARMA模型)

目录1.建模流程2.序列平稳性检验和纯随机性检验2.1图检验2.2单位根检验3.模型选择​ 4.参数估计5.模型检验5.1模型显著性检验5.2参数显著性检验6.模型优化6.1AIC准则6.2BIC准则7.预测1.建模流程1.1序列平稳性检验+纯随机性检验1.2模型选择1.3参数估计1.4模型检验1.5模型优化1.6预测2.序列平稳性检验和纯随机性检验2.1图检验主要适用于趋势或者周期比较明显的序列,具有一定主观性。(1)绘制时序图与自相关图:x 从时序图可见该序列没有明显的趋势和周期,从自相关图可见该序列除了延迟1~4阶外,其他自相关系数均在两倍标准差内,可以认为该序列具有短期相关性。因此判断

使用R和Randomforestsrc软件包的机器学习

我试图使用“surv.randomforestsrc”作为机器学习的学习者。我的代码和结果如下。“NewHCC”是HCC患者的生存数据,并导致多个数字参数。>newHCC$status=(newHCC$status==1)>surv.task=makeSurvTask(data=newHCC,target=c("time","status"))>surv.taskSupervisedtask:newHCCType:survTarget:time,statusEvents:61Observations:127Features:numericsfactorsordered3000Missings:

2021.05.17【R语言】丨clusterProfiler注释表——KEGG/GO enrich富集图专用

摘要  刚开始接触项目的时候一直用公司搭建好的流程分析项目,慢慢学习后,发现有些地方的注释除了靠参考基因组相关的注释文档,还需要对应物种。在R中绘制KEGG.GOenrich富集图就需要根据物种来读取相应注释包,这里记录一份常用物种及对应注释包表,方便以后使用。注释表packagesorganismorg.Ag.eg.dbAnophelesorg.At.tair.dbArabidopsisorg.Bt.eg.dbBovineorg.Ce.eg.dbWormorg.Cf.eg.dbCanineorg.Dm.eg.dbFlyorg.Dr.eg.dbZebrafishorg.EcK12.eg.dbE

2021.05.17【R语言】丨clusterProfiler注释表——KEGG/GO enrich富集图专用

摘要  刚开始接触项目的时候一直用公司搭建好的流程分析项目,慢慢学习后,发现有些地方的注释除了靠参考基因组相关的注释文档,还需要对应物种。在R中绘制KEGG.GOenrich富集图就需要根据物种来读取相应注释包,这里记录一份常用物种及对应注释包表,方便以后使用。注释表packagesorganismorg.Ag.eg.dbAnophelesorg.At.tair.dbArabidopsisorg.Bt.eg.dbBovineorg.Ce.eg.dbWormorg.Cf.eg.dbCanineorg.Dm.eg.dbFlyorg.Dr.eg.dbZebrafishorg.EcK12.eg.dbE

node.js - Node 脚本可执行文件在 Mac : env: node\r: No such file or directory 上不起作用

我已经创建了我的Node脚本可执行文件来执行一些任务。在Windows上,我的Node脚本运行良好。但在MacOSX(Yosemite)上,它不起作用。我的Node脚本已在Windows上发布。我的Node脚本是通过npm命令安装的:npminstall-gtask-app我的Node脚本有这第一行:#!/usr/bin/envnode我尝试了许多解决方案来解决我的问题,但我仍然卡住了。这是我使用的这些解决方案:卸载并重新安装Node.js执行此命令为Node创建链接:sudoln-s/usr/bin/nodejs/usr/local/bin/node使用以下命令设置我的路径:expo

node.js - Node 脚本可执行文件在 Mac : env: node\r: No such file or directory 上不起作用

我已经创建了我的Node脚本可执行文件来执行一些任务。在Windows上,我的Node脚本运行良好。但在MacOSX(Yosemite)上,它不起作用。我的Node脚本已在Windows上发布。我的Node脚本是通过npm命令安装的:npminstall-gtask-app我的Node脚本有这第一行:#!/usr/bin/envnode我尝试了许多解决方案来解决我的问题,但我仍然卡住了。这是我使用的这些解决方案:卸载并重新安装Node.js执行此命令为Node创建链接:sudoln-s/usr/bin/nodejs/usr/local/bin/node使用以下命令设置我的路径:expo

R语言风险价值VaR(Value at Risk)和ES 的估计

R语言中可以使用多种方法对风险价值VaR和损失期望值ES进行估计。下面介绍一些常用的方法:历史模拟法(Historicalsimulation)历史模拟法是一种基于历史数据的方法,它假设未来的风险分布与历史数据的分布相似。该方法通过计算历史数据中在给定置信水平下的分位数来估计VaR和ES。在R语言中,可以使用“quantile”函数来计算分位数。下面给出一个使用历史模拟法估计VaR和ES的例子:#加载数据data-read.csv("data.csv",header=TRUE)#计算收益率returns-diff(log(data$price

R代码和SPSS绘制相关性热图/矩阵的差别说明

博主在使用SPSS统计软件做pearson相关性分析的时候,发现用热图可视化可能效果会更好,于是,博主就去度娘了,然后用R代码绘制,但是发现做显著性的时候(P值检验),p值计算出来竟然不一样,惊呆了!!>_一、绘制相关性热图方法base::cor()和base::cor.test()psych::cor.test()Hmisc::rcorr()corrplot::cor.mtest()以上就是找到的方法,最后博主还是使用基础包中的方式绘制了相关性热图,代码在后面附上。以上几种方法请看别的博主的链接:>>>1、2、3讲解>>>4讲解(1)避坑博主使用的是cor.mtest()来看显著性检验的,但