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14.GO富集分析R语言代码及5种图的绘制

一、举例回顾本节使用GSE1009数据集,已经用limma包对数据集中的样本进行差异分析,现对差异基因(DEGs)做GO富集分析。GSE1009数据集介绍:  样本量:共6个样本,其中后3个为糖尿病肾病(DN)肾小球样本,前3个为正常肾小球样本。使用芯片:AffymetrixHumanGenomeU95Version2Array。平台:GPL8300。DEGs:共有66个DEGs(diffsig),22个上调(diffup),44个下调(diffDown)(详见上两章).二、需要准备的文件:包含差异基因名字+logFC值的文本文件,命名为symbol(下面有介绍详细做法。)三、具体做法:1.整

【高阶数据结构】图详解第一篇:图的基本概念及其存储结构(邻接矩阵和邻接表)

文章目录1.图的基本概念1.1什么是图1.2有向图和无向图1.3完全图1.4邻接顶点1.5顶点的度1.6路径1.7路径长度1.8简单路径与回路1.9子图1.10连通图1.11强连通图1.12生成树2.图的存储结构2.1邻接矩阵2.2邻接矩阵代码实现结构定义构造函数添加边打印图测试2.3邻接表2.4邻接表代码实现结构定义构造函数添加边打印图测试3.源码3.1Graph.h3.2Test.cpp这篇文章开始,我们来学习一种高阶数据结构——图1.图的基本概念1.1什么是图图是由顶点集合及顶点间的关系(边)组成的一种数据结构:G=(V,E)。其中:顶点集合V={x|x属于某个数据对象集}是有穷非空集合

数据结构(12)Dijkstra算法JAVA版:图的最短路径问题

目录12.1.概述12.1.1.无权图的最短路径 12.1.2.带权图的最短路径1.单源最短路径2.多源最短路径12.2.代码实现12.1.概述12.1.1.无权图的最短路径无权图的最短路径,即最少步数,使用BFS+贪心算法来求解最短路径,比较好实现,此处不做展开讨论。 12.1.2.带权图的最短路径有权图的最短路径,不考虑权重为负数的情况,因为权重为负数的情况极有可能出现负值圈,在这个圈子上形成环路,最短路径是无限兜圈,趋于负无穷。所以此处我们只考虑权重不为负数的带权图的最短路径求解问题。带权图的最短路径求解问题主要求两种最短路径:单源最短路径,某个点到全图各点之间的最短路径。多源最短路径,

【高阶数据结构】图详解第二篇:图的遍历(广度优先+深度优先)

文章目录图的遍历1.图的广度优先遍历(一石激起千层浪)思路分析代码实现测试美团2020校招笔试题:六度人脉2.图的深度优先遍历(一条道走到黑)思路分析代码实现测试3.对于非连通图情况的处理4.源码BFSDFS图的遍历所谓图的遍历:即从图中的任一顶点出发,对图中的所有顶点访问一次且只访问一次。给定一个图G和其中任意一个顶点v0,从v0出发,沿着图中各边访问图中的所有顶点,且每个顶点仅被遍历一次。ps:我们后面讲解这些图相关的算法默认都针对邻接矩阵结构的图去讲解,因为后面有些算法针对的图一般都是比较稠密的图,前面我们说了邻接矩阵更适合稠密图。那具体要如何对一个图进行遍历呢?有哪些方法呢?1.图的广

【数据结构】图的应用:最小生成树;最短路径;有向无环图描述表达式;拓扑排序;逆拓扑排序;关键路径

目录1、最小生成树1.1概念 1.2普利姆算法(Prim)1.3克鲁斯卡尔算法(Kruskal) 2、最短路径2.1迪杰斯特拉算法(Dijkstra)2.2弗洛伊德算法(Floyd) 2.3BFS算法,Dijkstra算法,Floyd算法的对比3、有向无环图描述表达式3.1有向无环图定义及特点3.2描述表达式4、拓扑排序4.1AOV网4.2步骤 4.3DFS实现拓扑排序 5、逆拓扑排序5.1步骤 5.2DFS实现逆拓扑排序  6、关键路径6.1AOE网 6.2求解方法6.3特性 1、最小生成树1.1概念         最小生成树是一种基于图的算法,用于在一个连通加权无向图中找到一棵生成树,使

图的最小生成树算法(图解+代码)| 学不会来看我系列

文章目录最小生成树Prim算法1.介绍2.图解步骤3.算法分析算法问题解决方案4.代码实现Kruskal算法1.介绍2.图解3.算法分析算法问题解决方案4.代码实现最小生成树在含有n个顶点的连通图中选择n-1条边,构成一棵极小连通子图,并使该连通子图中n-1条边上权值之和达到最小,则称其为连通网的最小生成树。例如,对于上图中的连通网可以有多棵权值总和不相同的生成树。Prim算法1.介绍普里姆(Prim)算法,也是求加权连通图的最小生成树的算法。基本思想对于图G而言,V是所有顶点的集合;现在,设置两个新的集合U和T,其中U用于存放G的最小生成树中的顶点,T存放G的最小生成树中的边。从所有的u∈U

【图论】图的概念和基本术语(顶点、边、度、路径等)

图的概念和基本术语一、图的概念二、基本术语1、顶点(Vertex)2、边(Edge)3、无向图(UndirectedGraph)4、有向图(DirectedGraph)5、加权图(WeightedGraph)6、多重图(Multigraph)7、度(Degree)8、路径(Path)9、简单路径(SimplePath)10、环(Cycle)11、连通图(ConnectedGraph)12、强连通图(StronglyConnectedGraph)13、子图(Subgraph)一、图的概念在数学和计算机科学中,图是由顶点(节点)和边(连接)组成的一种数据结构,用于描述对象之间的关系。图是一种广泛应

Unity中圆环图的实现

一、根据数值变化制作圆环首先需要多张圆环作为单个数据颜色,并把Image的属性设置为按数值转换为角度铺满,再把实际数据所占百分比与Image中的FillAmout同步每一个圆环都根据数值变化改变后虽然每一个圆环都已经根据数值展示对应的大小,还需要把这些扇环组装为一个完整的圆环,就需要给他们添加上一个旋转旋转角度==-1*自身扇环起点所对应的角度==-1*前方所有扇环的角度和(因为是反的)具体代码://////更新圆环图内的图标位置//////数据一///数据二///数据三///数据四publicvoidUpdatePercent(floatn1,floatn2,floatn3,floatn4)

ios - 构建 safari HTML5 全景图的教程?

关闭。这个问题不符合StackOverflowguidelines.它目前不接受答案。我们不允许提问寻求书籍、工具、软件库等的推荐。您可以编辑问题,以便用事实和引用来回答。关闭5年前。Improvethisquestion是否有像Apple技术演示中介绍的那样构建基于HTML5的VR全景图的教程?我问是因为关于再现VR效果的搜索结果或教程很少。这是链接:VRDemo

基于对数谱图的深度学习心音分类

这是一篇很有意思的论文,他基于心音信号的对数谱图,提出了两种心率音分类模型,我们都知道:频谱图在语音识别上是广泛应用的,这篇论文将心音信号作为语音信号处理,并且得到了很好的效果。对心音信号进行一致长度的分帧,提取其对数谱图特征,论文提出了长短期记忆(LSTM)和卷积神经网络(CNN)两种深度学习模型,根据提取的特征对心跳声进行分类。心音数据集影像学诊断包括心脏核磁共振成像(MRI)、CT扫描、心肌灌注成像。这些技术的缺点也很明显对现代机械、专业人员的要求高,诊断时间长。论文使用的是公共数据集,由1000个。wav格式的信号样本组成,采样频率为8kHz。数据集分为5类,包括1个正常类(N)和4个