问题做生信分析时，会遇到很多样品需要用同一个脚本去分析的情况。这些脚本除了样本名字需要更改，其他的都一样。有时候就会遇到这样的尴尬情况：（1）如果这些样品一次性提交，然后在后台一个一个的依次分析比较费时间。（2）如果同时把这些样品全部分析，服务器又带不动。（3）每次同时分析3个，结束了再提交3个，这个样子就会一直在忙着查看程序进程及提交新的程序，非常累。用一个比较容易理解的例子来讲就是：服务器出了一系列bug。如果只招一个程序员，一个一个的去修改，太慢了。如果招上和bug数量相等的程序员，每人解决一个bug，经费又不够。如果招上几个程序员，把bug平均分配，每人负责几个，那么必定有人很快把分到
问题做生信分析时，会遇到很多样品需要用同一个脚本去分析的情况。这些脚本除了样本名字需要更改，其他的都一样。有时候就会遇到这样的尴尬情况：（1）如果这些样品一次性提交，然后在后台一个一个的依次分析比较费时间。（2）如果同时把这些样品全部分析，服务器又带不动。（3）每次同时分析3个，结束了再提交3个，这个样子就会一直在忙着查看程序进程及提交新的程序，非常累。用一个比较容易理解的例子来讲就是：服务器出了一系列bug。如果只招一个程序员，一个一个的去修改，太慢了。如果招上和bug数量相等的程序员，每人解决一个bug，经费又不够。如果招上几个程序员，把bug平均分配，每人负责几个，那么必定有人很快把分到
我正在尝试量化执行相同进程的多线程与多进程的小型Java应用程序的内存占用差异。我所有的测试都是在Linux下进行的。运行多线程时，确定每个线程的总体占用空间和额外开销相对容易。根据pmap，运行单线程进程时，JVM占用空间大(200-300M虚拟空间)。如果我运行同一个应用程序的多个副本，我会看到内存占用xN，并且没有任何Java代码在进程之间共享。我被告知，由于Java代码是字节码，不可执行，因此它不会像C二进制文件那样在进程之间共享代码。然而，后来我得知它可能会使用Copy-On-Write技术来实现同样的事情。如果我使用pmap，它只会告诉我该进程的足迹，而不会指示可以与另一个
我正在尝试量化执行相同进程的多线程与多进程的小型Java应用程序的内存占用差异。我所有的测试都是在Linux下进行的。运行多线程时，确定每个线程的总体占用空间和额外开销相对容易。根据pmap，运行单线程进程时，JVM占用空间大(200-300M虚拟空间)。如果我运行同一个应用程序的多个副本，我会看到内存占用xN，并且没有任何Java代码在进程之间共享。我被告知，由于Java代码是字节码，不可执行，因此它不会像C二进制文件那样在进程之间共享代码。然而，后来我得知它可能会使用Copy-On-Write技术来实现同样的事情。如果我使用pmap，它只会告诉我该进程的足迹，而不会指示可以与另一个
我有一个在多个生产者和多个消费者之间共享的队列资源。都是独立的进程；没有一个进程“拥有”队列。根据实现的性质，必须控制对队列的访问，并且必须只允许一个进程在任何给定时刻推送或弹出。我认为使用名为semaphore的POSIX是正确的解决方案，但是一些细节让我感到困扰。(顺便说一下，这是一个仅限Linux的实现。)我应该在什么时候(如果有的话)执行sem_unlink？是否有任何理由实际删除队列？我担心某个进程在锁定队列信号量时死掉。有什么好的办法解决这个问题吗？我可以在尝试获取锁时进行定时等待，但如果超时到期，我现在就会遇到竞争条件。像这样的简单二进制锁是否有更好的解决方案？也许使用f
我有一个在多个生产者和多个消费者之间共享的队列资源。都是独立的进程；没有一个进程“拥有”队列。根据实现的性质，必须控制对队列的访问，并且必须只允许一个进程在任何给定时刻推送或弹出。我认为使用名为semaphore的POSIX是正确的解决方案，但是一些细节让我感到困扰。(顺便说一下，这是一个仅限Linux的实现。)我应该在什么时候(如果有的话)执行sem_unlink？是否有任何理由实际删除队列？我担心某个进程在锁定队列信号量时死掉。有什么好的办法解决这个问题吗？我可以在尝试获取锁时进行定时等待，但如果超时到期，我现在就会遇到竞争条件。像这样的简单二进制锁是否有更好的解决方案？也许使用f
我正在做一个项目，我需要找到在给定特定输入的各种Linux程序(用C编写)中调用了哪些函数。我目前的方法是使用-pg(分析选项)编译一个程序，运行它，然后通过处理gprof的输出找到调用了哪些函数。只有至少被调用一次的函数才会出现在输出文件中。明显的问题是只有一个进程可以写入gprof输出文件。如果程序fork多个进程，我不会从其他进程获得任何分析输出。有没有办法让gprof为每个进程(可能用pid标记)生成一个输出文件？该手册建议将每个进程更改为不同的目录，但我不想修改源代码来执行此操作。是否有其他适用于Linux的工具可以提供帮助？ 最佳答案
我正在做一个项目，我需要找到在给定特定输入的各种Linux程序(用C编写)中调用了哪些函数。我目前的方法是使用-pg(分析选项)编译一个程序，运行它，然后通过处理gprof的输出找到调用了哪些函数。只有至少被调用一次的函数才会出现在输出文件中。明显的问题是只有一个进程可以写入gprof输出文件。如果程序fork多个进程，我不会从其他进程获得任何分析输出。有没有办法让gprof为每个进程(可能用pid标记)生成一个输出文件？该手册建议将每个进程更改为不同的目录，但我不想修改源代码来执行此操作。是否有其他适用于Linux的工具可以提供帮助？ 最佳答案
我想用C语言实现一个原子函数，使进程或线程在执行函数时不会被抢占。 最佳答案 如果你在内核中并且你真的需要禁用抢占(可能不是一个好主意，我希望你知道你在做什么)你可以使用preempt_disable()和preempt_enable()(有关详细信息，请参阅Documentation/preempt-locking.txt)。如果您在内核之外，您的选择将非常有限。大多数多进程或多线程应用程序所做的是创建它们在访问共享资源时用于self限制的互斥量。(想想典型的读写锁。)但这对于系统上的所有其他进程来说绝不是原子的。对于遵循相同协议
我想用C语言实现一个原子函数，使进程或线程在执行函数时不会被抢占。 最佳答案 如果你在内核中并且你真的需要禁用抢占(可能不是一个好主意，我希望你知道你在做什么)你可以使用preempt_disable()和preempt_enable()(有关详细信息，请参阅Documentation/preempt-locking.txt)。如果您在内核之外，您的选择将非常有限。大多数多进程或多线程应用程序所做的是创建它们在访问共享资源时用于self限制的互斥量。(想想典型的读写锁。)但这对于系统上的所有其他进程来说绝不是原子的。对于遵循相同协议
