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Seurat,Harmony,LIGER 三种整合软件比较

常见问题:1)SeuratCCA整合分析后什么情况下用RNAassay,什么时候用intergratedassay?conservedcelltypemarkers部分,用整合前的“RNA”或整合后的归一化”integrated“分析不会造成差异;作为一般规则,我们总是建议对原始的“RNA“执行差异分析,而不是对批次校正等值执行差异分析,整合后的数据用于聚类。后续的分析建议建立在“RNA”上,因此在CCA之后,可以设置:DefaultAssay(sc_data)2)Seurat包的两种整合方法CCA和RPCACCA和RPCA整合方法都是Seurat包内置并推荐使用的。区别在于:CCA方法非常适

sprringboot3整合springsecurity6.0(只做token权限验证)+redis+自定义权限验证+自定义操作日志

1.引入pom.xmldependency>groupId>org.springframework.bootgroupId>artifactId>spring-boot-starter-securityartifactId>dependency>dependency>groupId>org.springframework.bootgroupId>artifactId>spring-boot-starter-data-redisartifactId>dependency>2.RedisConfig@ConfigurationpublicclassRedisConfig{/****redis序列化

scanpy数据整合批次效应去除原理

引用:葬花朴1.scanpy.external.pp.mnn_correct**第一步:将表达量按细胞进行归一化,计算细胞之间归一化后的Euclidean距离。第二步:识别MNN(mutualnearestneighbors,相互最近的邻居):假设两个batch,寻找batch1中每一个细胞的在batch2中最近的k个细胞(knn1),对batch2进行相同操作(knn2),knn1和knn2的关系的交集就是MNN。关键1:一对MNN细胞的差异完全来源于批次效应;关键2:三个假设a)两个批次中至少有1种相同的细胞类型,b)批次效应与生物子空间(基因表达特征张成的空间)正交,c)批次效应变异远小

SpringBoot整合Easy-ES操作演示文档

文章目录SpringBoot整合Easy-ES操作演示文档1概述及特性1.1官网1.2主要特性2整合配置2.1导入POM2.2Yaml配置2.3@EsMapperScan注解扫描2.4配置Entity2.5配置Mapper3基础操作3.1批量保存3.2数据更新3.3数据删除3.4组合查询3.5高亮查询3.6统计查询4整合异常4.1XContentType找不到问题SpringBoot整合Easy-ES操作演示文档1概述及特性1.1官网Easy-ES官网:https://www.easy-es.cn/官方示例:https://gitee.com/dromara/easy-es/tree/mast

boot-admin整合Liquibase实现数据库版本管理

Liquibase和Flyway是两款成熟的、优秀的、开源/商业版的数据库版本管理工具,鉴于Flyway的社区版本对Oracle数据库支持存在限制,所以boot-admin选择整合Liquibase提供数据库版本管理能力支持。Liquibase开源版使用Apache2.0协议。Liquibase的适用情形?在你的项目进行版本升级的时候,大概率情况下数据库也需要同步升级,Liquibase会自动扫描数据库迁移文件(changeSet),将迁移文件的版本号与历史记录表(changelog)中的版本号进行对比,略过已执行的的迁移文件,顺序执行未执行的新版本迁移文件,最终实现数据库与代码版本相匹配;当

百度人脸识别_SpringBoot整合离线SDK

一、前言建议使用低版本SDK:Baidu_Face_Offline_SDK_Windows_Java_6.1.3目前已知8.x版本对服务端不兼容,存在运行过程中,第一次调用sdk能够正常执行,第二次时出现JVM异常。SDK不支持多线程,一般都用于设备端,如人脸闸机上的面板机设备。自定义库文件路径,与项目分离。整合springBoot项目,实现启动初始化SDK,按需调用。二、SDK引入并配置解压程序,查看对应操作系统的文件夹,将src目录下的文件移动到我们的项目中。请不要修改此目录结构。给Face.java类添加注解,实现条件实例化。@Slf4j@Component@Conditional(Fa

SpringBoot快速整合RabbitMq小案例

对于一个直接创建的springBoot项目工程来说,可以按照以下步骤使用rabbitmq添加依赖:添加rabbitMQ的依赖。org.springframework.bootspring-boot-starter-amqp配置连接:在配置文件中配置虚拟主机、端口号、用户名、密码等信息。spring:rabbitmq:host:localhostport:5672virtual-host:{你的虚拟主机}username:{你的用户名}password:{你的密码}创建生产者:导入对应依赖后,使用rabbitTemplate,并调用convertAndSend来发送消息。@Autowiredpr

阿里云短信验证项目整合

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Spring Boot 整合 Bootstrap

SpringBoot整合Bootstrap一、添加Bootstrap依赖二、配置静态资源三、创建一个Bootstrap页面运行程序五、使用Bootstrap组件高级用法:使用Thymeleaf和Bootstrap使用CDN加速加载Bootstrap资源使用ThymeleafLayoutsindex.html一、添加Bootstrap依赖在pom.xml文件中添加以下依赖:dependency>groupId>org.webjarsgroupId>artifactId>bootstrapartifactId>version>5.1.3version>dependency>这里使用WebJars来

docker 部署 vue+springboot前端+后端 整合在一个镜像中

文章目录1、什么是docker2、打包前后端文件2.1、打包前端文件2.2、打包后端文件3、制作docker镜像4、新建一个容器运行镜像5、保存制作好的镜像6、mysql如果你自己独立开发了一套前后端分离的项目,想要把它放在一个docker镜像中,一键部署,真正做到开箱即用。1、什么是dockerbuildonce,runeverywhere2、打包前后端文件2.1、打包前端文件1.在项目下执行注意!打包之前你的api不要设置成localhost或者127.0.0.1,而是要换成你等下要部署的服务器的ip地址npmrunbuild//oryarnbuild2.会生成一个dist文件夹,里面就是