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PNAS:密歇根大学张阳教授团队实现对任意人工蛋白构型的从头设计

蛋白质是生命体执行功能的基本生物分子。蛋白质分子折叠结构的多样性赋予了它们独特而丰富的功能,从而也让生命世界丰富多彩。尽管理论上蛋白质序列和结构空间十分庞大,然而历经数十亿年进化后,只有极少部分蛋白空间出现于自然界。这可能是生命体在演化过程中为适应自然选择压力而做的最终选择。研究表明,目前的PDB数据库几乎涵盖了所有天然折叠,而SCOPe的蛋白拓扑构型数据库的统计显示这些天然折叠只含有不到1500种不同蛋白折叠类型。这些数据表明,蛋白质的理论结构空间和自然界展示的结构空间存在巨大差异。 为探索和弥补这种差异,也鉴于蛋白质对生命体的重要性,近年来利用计算机来从头设计具有比天然蛋白更强劲功能的人工

结构型:策略模式

定义  定义一系列的算法,将他们一个个封装起来,使他们直接可以相互替换。 算法:就是写的逻辑可以是你任何一个功能函数的逻辑封装:就是把某一功能点对应的逻辑给抽出来可替换:建立在封装的基础上,这些独立的算法可以很方便的替换通俗的理解就是,把你的算法(逻辑)封装到不同的策略中,在不同的策略中是互相独立的,这样我们封装的每一个算法是可以很方便的复用。策略模式主要解决在有多种情况下,使用if...else所带来的复杂和难以维护。它的优点是算法可以自由切换,同时可以避免多重if...else判断,且具有良好的扩展性。看一个真实场景--最简单的策略模式我们有一个根据不同的类型返回不同价格的一个方法func

结构型:策略模式

定义  定义一系列的算法,将他们一个个封装起来,使他们直接可以相互替换。 算法:就是写的逻辑可以是你任何一个功能函数的逻辑封装:就是把某一功能点对应的逻辑给抽出来可替换:建立在封装的基础上,这些独立的算法可以很方便的替换通俗的理解就是,把你的算法(逻辑)封装到不同的策略中,在不同的策略中是互相独立的,这样我们封装的每一个算法是可以很方便的复用。策略模式主要解决在有多种情况下,使用if...else所带来的复杂和难以维护。它的优点是算法可以自由切换,同时可以避免多重if...else判断,且具有良好的扩展性。看一个真实场景--最简单的策略模式我们有一个根据不同的类型返回不同价格的一个方法func

结构型:策略模式

定义  定义一系列的算法,将他们一个个封装起来,使他们直接可以相互替换。 算法:就是写的逻辑可以是你任何一个功能函数的逻辑封装:就是把某一功能点对应的逻辑给抽出来可替换:建立在封装的基础上,这些独立的算法可以很方便的替换通俗的理解就是,把你的算法(逻辑)封装到不同的策略中,在不同的策略中是互相独立的,这样我们封装的每一个算法是可以很方便的复用。策略模式主要解决在有多种情况下,使用if...else所带来的复杂和难以维护。它的优点是算法可以自由切换,同时可以避免多重if...else判断,且具有良好的扩展性。看一个真实场景--最简单的策略模式我们有一个根据不同的类型返回不同价格的一个方法func

结构型:策略模式

定义  定义一系列的算法,将他们一个个封装起来,使他们直接可以相互替换。 算法:就是写的逻辑可以是你任何一个功能函数的逻辑封装:就是把某一功能点对应的逻辑给抽出来可替换:建立在封装的基础上,这些独立的算法可以很方便的替换通俗的理解就是,把你的算法(逻辑)封装到不同的策略中,在不同的策略中是互相独立的,这样我们封装的每一个算法是可以很方便的复用。策略模式主要解决在有多种情况下,使用if...else所带来的复杂和难以维护。它的优点是算法可以自由切换,同时可以避免多重if...else判断,且具有良好的扩展性。看一个真实场景--最简单的策略模式我们有一个根据不同的类型返回不同价格的一个方法func

Python设计模式-结构型:适配器模式,装饰者模式,代理模式,组合模式,外观模式

Python设计模式-结构型:适配器模式,装饰者模式,代理模式,组合模式,外观模式适配器模式定义及简单实现案例装饰者模式定义及简单实现案例代理模式定义及简单实现案例组合模式定义及简单实现案例外观模式定义及简单实现案例适配器模式adapter电子产品的电源插头插在转换插头上,然后转换插头插上电源,电子产品就能正常工作了。这就是适配器模式#-*-coding:utf-8-*-classOldCourse(object):"""老的课程类"""defshow(self):"""显示关于本课程的所有信息"""print("showdescription")print("showteacherofcou

Python设计模式-结构型:适配器模式,装饰者模式,代理模式,组合模式,外观模式

Python设计模式-结构型:适配器模式,装饰者模式,代理模式,组合模式,外观模式适配器模式定义及简单实现案例装饰者模式定义及简单实现案例代理模式定义及简单实现案例组合模式定义及简单实现案例外观模式定义及简单实现案例适配器模式adapter电子产品的电源插头插在转换插头上,然后转换插头插上电源,电子产品就能正常工作了。这就是适配器模式#-*-coding:utf-8-*-classOldCourse(object):"""老的课程类"""defshow(self):"""显示关于本课程的所有信息"""print("showdescription")print("showteacherofcou

结构型:二. 外观模式(facade)

外观模式是什么外观模式是一种结构性设计模式,它能为程序库、框架或者其他复杂的子系统提供一个统一的高层界面,使子系统更容易使用。外观模式就是聚合多个接口实现,对外只暴露单个接口。隐藏子系统的复杂性。调用方不关心实现步骤。为什么要用外观模式当子系统提供的功能很多,而我们子需要多个子系统中很少的几个功能时。这时我们可以用外观模式,让我们不必关注与子系统众多的方法。或者子系统相互调用复杂时,外观模式我们不必清楚子系统中众多类之间的相互调用关系。外观模式怎么实现电脑启动需要依次启动电源、主板、CPU、内存、硬盘。当然我们也可以用外观模式封装一下,把它们都封装到一起。当然这个例子比较简单,子系统之间没有相

结构型:一. 适配器模式

适配器模式是什么适配器模式(AdapterDesignPattern)适配器是一种结构型设计模式,用来将不兼容的接口转换为兼容的接口。适配器可担任两个对象间的转换器,它会接收对于一个对象的调用,并将其转换为另一个对象可识别的格式和接口。为什么用适配器模式两个对象直接由于格式或者接口不兼容不能直接调用,所以使用适配器转换为格式或者接口。适配器不会影响原有的代码及功能。适配器模式怎么实现客户端客户端通过USB来连接电脑,并且windows实现了这个接口,可以正常使用,客户端可以和windows传输数据,一切很完美。typeComputerinterface{ USB()}typeClientstr

结构型:二. 外观模式(facade)

外观模式是什么外观模式是一种结构性设计模式,它能为程序库、框架或者其他复杂的子系统提供一个统一的高层界面,使子系统更容易使用。外观模式就是聚合多个接口实现,对外只暴露单个接口。隐藏子系统的复杂性。调用方不关心实现步骤。为什么要用外观模式当子系统提供的功能很多,而我们子需要多个子系统中很少的几个功能时。这时我们可以用外观模式,让我们不必关注与子系统众多的方法。或者子系统相互调用复杂时,外观模式我们不必清楚子系统中众多类之间的相互调用关系。外观模式怎么实现电脑启动需要依次启动电源、主板、CPU、内存、硬盘。当然我们也可以用外观模式封装一下,把它们都封装到一起。当然这个例子比较简单,子系统之间没有相