写在前面ggplot2是一款风靡全球的绘图R包,可惜的是,我对它的理解只能到入门的水平,本着在实战中学习的理念,我就搜索一下往后可能用得到的图,进行揣摩和优化,然后我发现了一个师兄的公众号,遂跟着这个师兄学习R绘图。公众号在文末。1.读入数据dat2.过滤数据并用默认参数展示library(tidyverse)dat%>%filter(Corrected.P.Valuedat01#这里为了减少计算量,根据P值进行了过滤dim(dat01)dim(dat)library(ggplot2)dat01$GeneRatioimage.png这当然无法达到我们发文章的要求,需要对其进行美化一下。3.美化
####安装包install.packages("BiocManager")BiocManager::install(version="3.13")BiocManager::install("gprofiler2")BiocManager::install("clusterProfiler")BiocManager::install("AnnotationHub")BiocManager::install("org.Bt.eg.db")GO分析(上下调基因分开做,可用于BP,CC,MF分开画图)##方法2:下载到本地加载,每次使用上传,(推荐)library(AnnotationDbi)set
####安装包install.packages("BiocManager")BiocManager::install(version="3.13")BiocManager::install("gprofiler2")BiocManager::install("clusterProfiler")BiocManager::install("AnnotationHub")BiocManager::install("org.Bt.eg.db")GO分析(上下调基因分开做,可用于BP,CC,MF分开画图)##方法2:下载到本地加载,每次使用上传,(推荐)library(AnnotationDbi)set