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学习小组Day6-学习R包————阿司匹林

阿峰的生信笔记 2023-03-28 原文

1.dplyr五个基础函数(数据使用内置数据集iris)

1.mutate(),新增列

mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width)
image.png

2.select(),按列筛选

select(test,1)
select(test,c(1,5))
select(test,Sepal.Length)
image.png

(2)按列名筛选

select(test, Petal.Length, Petal.Width)
vars <- c("Petal.Length", "Petal.Width")
select(test, one_of(vars))
image.png

image.png

3.filter()筛选行
filter(test, Species == "setosa")


image.png

filter(test, Species == "setosa"&Sepal.Length > 5 )
image.png

filter(test, Species %in% c("setosa","versicolor"))


image.png

4.arrange(),按某1列或某几列对整个表格进行排序
arrange(test, Sepal.Length)#默认从小到大排序
image.png

arrange(test, desc(Sepal.Length))#用desc从大到小
image.png

5.summarise():汇总
summarise(test, mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))# 计算Sepal.Length的平均值和标准差
image.png

group_by(test, Species)


image.png

summarise(group_by(test, Species),mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))
image.png

2.dplyr两个实用技能

1.管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)


image.png

2:count统计某列的unique值


image.png

3.dplyr处理关系数据

1.內连inner_join,取交集


image.png

image.png

inner_join(test1, test2, by = "x")


image.png

2.左连left_join
left_join(test1, test2, by = 'x')
image.png

left_join(test1, test2, by = 'x')


image.png

3.全连full_join
image.png

4.半连接:返回能够与y表匹配的x表所有记录semi_join
semi_join(x = test1, y = test2, by = 'x')
image.png

5.反连接:返回无法与y表匹配的x表的所记录anti_join
anti_join(x = test2, y = test1, by = 'x')
image.png

6.简单合并
test1 <- data.frame(x = c(1,2,3,4), y = c(10,20,30,40))
test1
test2 <- data.frame(x = c(5,6), y = c(50,60))
test2
test3 <- data.frame(z = c(100,200,300,400))
test3
bind_rows(test1, test2)
bind_cols(test1, test3)

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