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python - pyLDAvis可视化pyspark生成的LDA模型

coder 2023-08-19 原文

有没有人有使用 PySpark 库(特别是使用 pyLDAvis)训练的 LDA 模型的数据可视化示例?我看过很多 GenSim 和其他库的示例,但没有看到 PySpark。具体来说,我想知道将什么传递给 pyLDAvis.prepare() 函数以及如何从我的 lda 模型中获取它。 这是我的代码:

 from pyspark.mllib.clustering import LDA, LDAModel
 from pyspark.mllib.feature import IDF
 from pyspark.ml.feature import CountVectorizer
 from pyspark.mllib.linalg import Vectors

 vectorizer = CountVectorizer(inputCol="filtered1", outputCol="features").fit(filtered_final)
 countVectors = vectorizer.transform(filtered_final).select("status_id", "features")
 countVectors.show()
 frequencyVectors = countVectors.rdd.map(lambda vector: vector[1])
 frequencyDenseVectors = frequencyVectors.map(lambda vector: Vectors.dense(vector))
 idf = IDF().fit(frequencyDenseVectors)
 print('fitting complete')
 tfidf = idf.transform(frequencyDenseVectors)
 print("tf idf complete")
 #prepare corpus for LDA
 corpus = tfidf.map(lambda x: [1, x]).cache()
 #train LDA
 ldaModel = LDA.train(corpus, k = 15, maxIterations=100, optimizer="online", docConcentration=2.0, topicConcentration=3.0)
 print("lda model complete")

最佳答案

我以某种方式设法使 pyspark 的输出适合 pyLDAvis。
以下代码需要稍微清理一下,但可以正常工作。

from pyspark.ml.feature import StopWordsRemover,Tokenizer, RegexTokenizer, CountVectorizer, IDF
from pyspark.sql.functions import udf, col, size, explode, regexp_replace, trim, lower, lit
from pyspark.sql.types import ArrayType, StringType, DoubleType, IntegerType, LongType
from pyspark.ml.clustering import LDA
import pyLDAvis


def format_data_to_pyldavis(df_filtered, count_vectorizer, transformed, lda_model):
    xxx = df_filtered.select((explode(df_filtered.words_filtered)).alias("words")).groupby("words").count()
    word_counts = {r['words']:r['count'] for r in xxx.collect()}
    word_counts = [word_counts[w] for w in count_vectorizer.vocabulary]


    data = {'topic_term_dists': np.array(lda_model.topicsMatrix().toArray()).T, 
            'doc_topic_dists': np.array([x.toArray() for x in transformed.select(["topicDistribution"]).toPandas()['topicDistribution']]),
            'doc_lengths': [r[0] for r in df_filtered.select(size(df_filtered.words_filtered)).collect()],
            'vocab': count_vectorizer.vocabulary,
            'term_frequency': word_counts}

    return data

def filter_bad_docs(data):
    bad = 0
    doc_topic_dists_filtrado = []
    doc_lengths_filtrado = []

    for x,y in zip(data['doc_topic_dists'], data['doc_lengths']):
        if np.sum(x)==0:
            bad+=1
        elif np.sum(x) != 1:
            bad+=1
        elif np.isnan(x).any():
            bad+=1
        else:
            doc_topic_dists_filtrado.append(x)
            doc_lengths_filtrado.append(y)

    data['doc_topic_dists'] = doc_topic_dists_filtrado
    data['doc_lengths'] = doc_lengths_filtrado

# This is the only part that you have to implement:
create a Spark Dataframe named df_filtered and it has the list of raw words.
It can be the output of StopWordsRemover

# WORD COUNT
count_vectorizer = CountVectorizer(inputCol="words_filtered", outputCol="features", minDF=0.05, maxDF=0.5)
count_vectorizer = count_vectorizer.fit(df_filtered)
df_counted = count_vectorizer.transform(df_filtered)

# TF-IDF
idf = IDF(inputCol="features", outputCol="features_tfidf")
idf_model = idf.fit(df_counted)
df_tfidf = idf_model.transform(df_counted)

# LDA
lda = LDA(k=2, maxIter=20, featuresCol='features_tfidf')
lda_model = lda.fit(df_tfidf)
transformed = lda_model.transform(df_tfidf)

# FORMAT DATA AND PASS IT TO PYLDAVIS
data = format_data_to_pyldavis(df_filtered, count_vectorizer, transformed, lda_model)
filter_bad_docs(data) # this is, because for some reason some docs apears with 0 value in all the vectors, or the norm is not 1, so I filter those docs.
py_lda_prepared_data = pyLDAvis.prepare(**data)
pyLDAvis.display(py_lda_prepared_data)

关于python - pyLDAvis可视化pyspark生成的LDA模型,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/41819761/

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