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linux - 简单的 awk 命令问题(FS、OFS 相关)

coder 2023-06-17 原文

我试图重新组织包含以下内容的文件的格式:

>Humanl|chr16:86430087-86430726 | element 1 | positive
>Humanl|chr16:85620095-85621736 | element 2 | negative
>Humanl|chr16:80423343-80424652 | element 3 | negative
>Humanl|chr16:80372593-80373755 | element 4 | positive
>Humanl|chr16:79969907-79971297 | element 5 | negative
>Humanl|chr16:79949950-79951518 | element 6 | negative
>Humanl|chr16:79026563-79028162 | element 7 | negative
>Humanl|chr16:78933253-78934686 | element 9 | negative
>Humanl|chr16:78832182-78833595 | element 10 | negative

我的命令是:

awk '{FS="|";OFS="\t"} {print $1,$2,$3,$4,$5}'

这是输出:

>Human|chr16:86430087-86430726  |      element 1      |
>Human  chr16:85620095-85621736         element 2      negative
>Human  chr16:80423343-80424652         element 3      negative
>Human  chr16:80372593-80373755         element 4      positive
>Human  chr16:79969907-79971297         element 5      negative
>Human  chr16:79949950-79951518         element 6      negative
>Human  chr16:79026563-79028162         element 7      negative
>Human  chr16:78933253-78934686         element 9      negative
>Human  chr16:78832182-78833595         element 10     negative

除第一行外，每一行都工作正常。我不明白为什么会这样。

有人可以帮我吗？谢谢!

最佳答案

简答

FS 和 OFS 设置得太晚，无法影响第一行，请改用如下内容:

awk '{print $1,$2,$3,$4,$5}' FS='|' OFS='\t'

您也可以使用这个较短的版本:

awk -v FS='|' -v OFS='\t' '$1=$1'

稍微长一点的回答

它不起作用，因为 awk 在设置 FS 和 OFS 时已经执行了记录/字段拆分。您可以通过将 $0 设置为 $0 来强制重新拆分，例如:

awk '{FS="|";OFS="\t";$0=$0} {print $1,$2,$3,$4,$5}'

常规方法是 1. 在 BEGIN 子句中设置 FS 和其他， 2. 通过 -v VAR=VALUE<> 符号，或 3. 将它们作为 VAR=VALUE 添加到脚本之后。我喜欢的风格是最后一个选择:

awk '{print $1,$2,$3,$4,$5}' FS='|' OFS='\t'

请注意，设置-v 和后脚本变量之间存在显着差异。 -v 将在 BEGIN 子句之前设置变量，而在 BEGIN 子句之后设置变量的后脚本设置。

关于linux - 简单的 awk 命令问题(FS、OFS 相关)，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/16203336/

linuxawkcodeelementnegative

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