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r - 从 MatLab 调用 R 脚本 - 错误

coder 2024-06-20 原文

我想调用一个 R 脚本，比如 myRfile.R , 来自 MatLab .我正在使用 Windows 10机器 MatLab 2017a和 R-3.4.2 .我用 system命令如先前 stackoverflow question. 中所建议解决方案是执行以下操作:

  1. 添加路径到R的安装位置.就我而言，我写 addpath C:\Program Files\R\R-3.4.2\bin .

  2. 确保 R 脚本位于工作目录(或路径)中。

  3. 调用函数system('R CMD BATCH myRfile.R') .

但是，我得到了错误标志 = 1，并且在命令窗口中打印了以下内容:

'R' is not recognized as an internal or external command, operable program or batch file.

我检查以确保我可以运行 R从 cmd 导航到适当的文件并调用 R.exe .相反，如果我调用 system通过:

system('"C:\Program Files\R\R-3.4.2\bin\x64\R.exe" CMD BATCH myRfile.R');,

然后脚本被正确执行(没有错误)。因此，我找到了解决问题的方法。但是，我想定义字符串

Rpath = "C:\Program Files\R\R-3.4.2\bin\x64\R.exe"

在我的程序开始时运行命令

system('Rpath CMD BATCH myRfile.R');

这会返回一个与之前类似的错误:

'Rpath' is not recognized as an internal or external command, operable program or batch file.

问题:

  1. 为什么命令 system('R CMD BATCH myRfile.R')不适合我？

  2. 为什么 system如果我为 R 编写目录，命令工作直接作为一个字符串，但如果我通过 Rpath 传递一个字符串，它就不起作用到吗？

最佳答案

根据@r2evans 的评论，解决方案是使用setenv 而不是addpath，因为system 使用系统路径来搜索文件. Program 和Files 之间的空间对于system 命令也是有问题的。

示例解决方案:

% Get the current set of system paths
path1 = getenv('PATH'); 
% Append directory for R to the system path    
path1 = [path1'C:\PROGRA~1\R\R-34~1.2\bin\x64']; 
% Update system path
setenv('PATH', path1) 
% Run the system command.
system('R CMD BATCH myRfile.R');

一般来说，获取正确路径的一种方法是打开 R 实例并输入命令 file.path(R.home())。对我来说，这会返回 "C:/PROGRA~1/R/R-34~1.2"。最后，追加\bin\x64`。

@excaza 指出定义 R 路径的字符串应该被 "" 包围，以便 cmd 正确解释空格.解决方案 2:

path1 = getenv('PATH'); 
% Append directory for R to the system path    
path1 = [path1'"C:\Program Files\R\R-3.4.2\bin\x64"']; 
% Update system path
setenv('PATH', path1) 
% Run the system command.
system('R CMD BATCH myRfile.R');

关于r - 从 MatLab 调用 R 脚本 - 错误，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/46817815/

MatLab从codesystemblockquoterwindowscmd

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