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c++ - 在 GPU 上计算平方欧氏距离矩阵

coder 2024-02-23 原文

p 是第一组位置的矩阵,其中每一行给出特定点的坐标。类似地,设 q 是第二组位置的矩阵,其中每一行给出特定点的坐标。

则成对平方欧氏距离的公式为:

k(i,j) = (p(i,:) - q(j,:))*(p(i,:) - q(j,:))', 

其中 p(i,:) 表示 i 矩阵 p 的第行,并且 p'表示 p 的转置。

我想在支持 CUDA 的 GPU (NVidia Tesla) 上用 C++ 计算矩阵 k。我有支持 GPU 的 OpenCV v.2.4.1,但我对其他替代方案持开放态度,例如 Thrust 库。但是,我不太熟悉 GPU 编程。你能建议一种有效的方法来完成这项任务吗?我应该使用哪些 C++ 库?

最佳答案

这个问题看起来很简单,足以让库变得矫枉过正。

在不知道 ij 的范围的情况下,我建议您将 k 分成 block ,每个 block 都是 32 个线程的倍数,并且在每个 block 中,计算

float sum, myp[d];
int i = blockIdx.x*blockDim.x + threadIdx.x;
for ( int kk = 0 ; kk < d ; kk++ )
    myp[kk] = p(i,kk);
for ( j = blockIdx.y*blockDim.y ; j < (blockIdx.y+1)*blockDim ; j++ ) {
    sum = 0.0f;
    #pragma unroll
    for ( int kk = 0 ; kk < d ; kk++ ) {
        temp = myp[kk] - q(j,kk);
        sum += temp*temp;
        }
    k(i,j) = sum;
    }

我假设您的数据具有 d 维度并编写 p(i,k)q(j,k)k(i,j) 表示访问二维数组。我还冒昧地假设您的数据是 float 类型。

请注意,这取决于 k 的存储方式,例如行优先或列优先,您可能希望每个线程遍历 i,而不是合并写入 k

关于c++ - 在 GPU 上计算平方欧氏距离矩阵,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/11196748/

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