草庐IT

python - 使用管道在进程之间传输 Python 对象时的字节限制?

coder 2023-08-21 原文

我有一个自定义模拟器(用于生物学)在 64 位 Linux(内核)上运行 版本 2.6.28.4) 使用 64 位 Python 3.3.0 CPython 解释器的机器。

因为模拟器依赖于许多独立的实验来获得有效的结果, 我内置了用于运行实验的并行处理。之间的通信 线程主要出现在具有托管的生产者-消费者模式下 多处理队列 (doc)。 架构概要如下:

  • 一个处理生成和管理进程和各种队列的主进程
  • N 个进行模拟的工作进程
  • 1 个结果消费者进程,它使用模拟结果并对结果进行排序和分析

主进程和工作进程通过输入 Queue 进行通信。 同样,工作进程将它们的结果放在输出 Queue 中 结果消费者进程从中消费项目。最终结果消费者 对象通过多处理管道传递 ( doc ) 回到主进程。

一切正常,直到它尝试将 ResultConsumer 对象传递回 通过 Pipe 的主进程:

Traceback (most recent call last):
  File "/home/cmccorma/.local/lib/python3.3/multiprocessing/process.py", line 258, in _bootstrap
    self.run()
  File "/home/cmccorma/.local/lib/python3.3/multiprocessing/process.py", line 95, in run
    self._target(*self._args, **self._kwargs)
  File "DomainArchitectureGenerator.py", line 93, in ResultsConsumerHandler
    pipeConn.send(resCon)
  File "/home/cmccorma/.local/lib/python3.3/multiprocessing/connection.py", line 207, in send
    self._send_bytes(buf.getbuffer())
  File "/home/cmccorma/.local/lib/python3.3/multiprocessing/connection.py", line 394, in _send_bytes
    self._send(struct.pack("!i", n))
struct.error: 'i' format requires -2147483648 <= number <= 2147483647

我理解前两条轨迹(Process 库中未处理的退出), 第三个是我的代码行,用于将 ResultConsumer 对象发送到 管道到主进程。最后两条痕迹是它得到的地方 有趣的。 Pipe 挑选发送给它的任何对象并传递 结果字节到另一端(匹配连接),在那里它被取消 在运行 recv() 时。 self._send_bytes(buf.getbuffer()) 正在尝试 发送腌制对象的字节。 self._send(struct.pack("!i", n)) 是 试图用长度为 n 的整数(网络/大端)打包结构, 其中 n 是作为参数传入的缓冲区的长度(struct 库处理 Python 值和 C 结构之间的转换,表示为 Python 字符串,参见 the doc ).

此错误仅在尝试大量实验时发生,例如10个实验 不会导致它,但 1000 会一致(所有其他参数保持不变)。我最好的 关于为什么抛出 struct.error 的假设是字节数 试图被推下管道超过 2^32-1 (2147483647),或 ~2 GB。

所以我的问题有两个方面:

  1. 我的调查陷入困境,因为 struct.py 本质上只是 从 _struct 导入,我不知道它在哪里。

  2. 考虑到底层架构,字节限制似乎是任意的 64 位。那么,为什么我不能传递比这更大的东西呢?另外,如果我 无法更改此问题,是否有针对此问题的任何好的(阅读:简单的)解决方法?

注意:我不认为使用 Queue 代替 Pipe 可以解决问题, 因为我怀疑 Queue 使用了类似的 pickling 中间步骤。 编辑:正如 abarnert 的回答中所指出的,这条注释是完全不正确的。

最佳答案

I'm getting stuck with my investigations as struct.py essentially just imports from _struct and I have no idea where that is.

在 CPython 中,_struct是从 _struct.c 构建的 C 扩展模块在Modules源树中的目录。您可以在线找到代码here .

每当foo.pyimport _foo ,那几乎总是一个 C 扩展模块,通常是从 _foo.c 构建的.如果找不到 foo.py根本上,它可能是一个 C 扩展模块,由 _foomodule.c 构建.

通常也值得一看 equivalent PyPy source ,即使您没有使用 PyPy。他们用纯 Python 重新实现了几乎所有扩展模块——对于其余部分(包括本例),底层的“扩展语言”是 RPython,而不是 C。

但是,在这种情况下,您不需要知道 struct 是如何实现的。正在超出文档中的范围。


The byte limit seems arbitrary given that the underlying architecture is all 64-bit.

查看它调用的代码:

self._send(struct.pack("!i", n))

如果你看the documentation , 'i'格式字符明确表示“4 字节 C 整数”,而不是“ssize_t 是什么”。为此,您必须使用 'n' .或者你可能想显式地使用 long long,带 'q' .

你可以 monkeypatch multiprocessing使用 struct.pack('!q', n) .或者 '!q' .或者以 struct 以外的方式对长度进行编码.当然,这会破坏与未打补丁的兼容性 multiprocessing ,如果您尝试在多台计算机或其他设备上进行分布式处理,这可能是个问题。但这应该非常简单:

def _send_bytes(self, buf):
    # For wire compatibility with 3.2 and lower
    n = len(buf)
    self._send(struct.pack("!q", n)) # was !i
    # The condition is necessary to avoid "broken pipe" errors
    # when sending a 0-length buffer if the other end closed the pipe.
    if n > 0:
        self._send(buf)

def _recv_bytes(self, maxsize=None):
    buf = self._recv(8) # was 4
    size, = struct.unpack("!q", buf.getvalue()) # was !i
    if maxsize is not None and size > maxsize:
        return None
    return self._recv(size)

当然,不能保证这种变化就足够了;您将需要通读其余的周围代码并对其进行测试。


Note: I suspect that using a Queue in place of a Pipe will not solve the issue, as I suspect that Queue's use a similar pickling intermediate step.

好吧,这个问题与酸洗无关。 Pipe没有使用 pickle发送长度,它使用 struct .您可以验证 pickle不会有这个问题:pickle.loads(pickle.dumps(1<<100)) == 1<<100将返回 True .

(在早期版本中,pickle 在处理大对象时存在问题——例如,一个 list 的 2G 元素——这可能会导致大约 8 倍于大对象的问题你目前正在击球。但这已被 3.3 修复。)

与此同时……试一试看看会不会更快,而不是深入研究源代码来弄清楚它是否可行?


另外,你确定你真的想通过隐式 pickling 传递一个 2GB 的数据结构吗?

如果我正在做一些缓慢且耗费内存的事情,我宁愿将其明确化——例如,pickle 到一个临时文件并发送路径或 fd。 (如果您使用的是 numpypandas 或其他东西,请使用其二进制文件格式而不是 pickle ,但想法相同。)

或者,更好的是,共享数据。是的,可变的共享状态不好……但是共享不可变对象很好。无论你有 2GB 的空间,你能把它放在 multiprocessing.Array 中吗? , 或者把它放在 ctypes 中您可以通过 multiprocessing.sharedctypes 共享的数组或结构(属于……的数组或结构) , 或 ctypes它来自 file那你mmap双方,还是……?有一些额外的代码来定义和分离结构,但当 yield 可能如此之大时,值得尝试。


最后,当您认为您在 Python 中发现了错误/明显缺失的功能/不合理的限制时,值得查看错误跟踪器。看起来像 issue 17560: problem using multiprocessing with really big objects?正是您的问题,并且有很多信息,包括建议的解决方法。

关于python - 使用管道在进程之间传输 Python 对象时的字节限制?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/16576386/

有关python - 使用管道在进程之间传输 Python 对象时的字节限制?的更多相关文章

  1. ruby - 如何使用 Nokogiri 的 xpath 和 at_xpath 方法 - 2

    我正在学习如何使用Nokogiri,根据这段代码我遇到了一些问题:require'rubygems'require'mechanize'post_agent=WWW::Mechanize.newpost_page=post_agent.get('http://www.vbulletin.org/forum/showthread.php?t=230708')puts"\nabsolutepathwithtbodygivesnil"putspost_page.parser.xpath('/html/body/div/div/div/div/div/table/tbody/tr/td/div

  2. ruby - 如何从 ruby​​ 中的字符串运行任意对象方法? - 2

    总的来说,我对ruby​​还比较陌生,我正在为我正在创建的对象编写一些rspec测试用例。许多测试用例都非常基础,我只是想确保正确填充和返回值。我想知道是否有办法使用循环结构来执行此操作。不必为我要测试的每个方法都设置一个assertEquals。例如:describeitem,"TestingtheItem"doit"willhaveanullvaluetostart"doitem=Item.new#HereIcoulddotheitem.name.shouldbe_nil#thenIcoulddoitem.category.shouldbe_nilendend但我想要一些方法来使用

  3. ruby - 使用 RubyZip 生成 ZIP 文件时设置压缩级别 - 2

    我有一个Ruby程序,它使用rubyzip压缩XML文件的目录树。gem。我的问题是文件开始变得很重,我想提高压缩级别,因为压缩时间不是问题。我在rubyzipdocumentation中找不到一种为创建的ZIP文件指定压缩级别的方法。有人知道如何更改此设置吗?是否有另一个允许指定压缩级别的Ruby库? 最佳答案 这是我通过查看ruby​​zip内部创建的代码。level=Zlib::BEST_COMPRESSIONZip::ZipOutputStream.open(zip_file)do|zip|Dir.glob("**/*")d

  4. ruby - 为什么我可以在 Ruby 中使用 Object#send 访问私有(private)/ protected 方法? - 2

    类classAprivatedeffooputs:fooendpublicdefbarputs:barendprivatedefzimputs:zimendprotecteddefdibputs:dibendendA的实例a=A.new测试a.foorescueputs:faila.barrescueputs:faila.zimrescueputs:faila.dibrescueputs:faila.gazrescueputs:fail测试输出failbarfailfailfail.发送测试[:foo,:bar,:zim,:dib,:gaz].each{|m|a.send(m)resc

  5. ruby-on-rails - 使用 Ruby on Rails 进行自动化测试 - 最佳实践 - 2

    很好奇,就使用ruby​​onrails自动化单元测试而言,你们正在做什么?您是否创建了一个脚本来在cron中运行rake作业并将结果邮寄给您?git中的预提交Hook?只是手动调用?我完全理解测试,但想知道在错误发生之前捕获错误的最佳实践是什么。让我们理所当然地认为测试本身是完美无缺的,并且可以正常工作。下一步是什么以确保他们在正确的时间将可能有害的结果传达给您? 最佳答案 不确定您到底想听什么,但是有几个级别的自动代码库控制:在处理某项功能时,您可以使用类似autotest的内容获得关于哪些有效,哪些无效的即时反馈。要确保您的提

  6. ruby - 在 Ruby 中使用匿名模块 - 2

    假设我做了一个模块如下:m=Module.newdoclassCendend三个问题:除了对m的引用之外,还有什么方法可以访问C和m中的其他内容?我可以在创建匿名模块后为其命名吗(就像我输入“module...”一样)?如何在使用完匿名模块后将其删除,使其定义的常量不再存在? 最佳答案 三个答案:是的,使用ObjectSpace.此代码使c引用你的类(class)C不引用m:c=nilObjectSpace.each_object{|obj|c=objif(Class===objandobj.name=~/::C$/)}当然这取决于

  7. ruby - 使用 ruby​​ 和 savon 的 SOAP 服务 - 2

    我正在尝试使用ruby​​和Savon来使用网络服务。测试服务为http://www.webservicex.net/WS/WSDetails.aspx?WSID=9&CATID=2require'rubygems'require'savon'client=Savon::Client.new"http://www.webservicex.net/stockquote.asmx?WSDL"client.get_quotedo|soap|soap.body={:symbol=>"AAPL"}end返回SOAP异常。检查soap信封,在我看来soap请求没有正确的命名空间。任何人都可以建议我

  8. python - 如何使用 Ruby 或 Python 创建一系列高音调和低音调的蜂鸣声? - 2

    关闭。这个问题是opinion-based.它目前不接受答案。想要改进这个问题?更新问题,以便editingthispost可以用事实和引用来回答它.关闭4年前。Improvethisquestion我想在固定时间创建一系列低音和高音调的哔哔声。例如:在150毫秒时发出高音调的蜂鸣声在151毫秒时发出低音调的蜂鸣声200毫秒时发出低音调的蜂鸣声250毫秒的高音调蜂鸣声有没有办法在Ruby或Python中做到这一点?我真的不在乎输出编码是什么(.wav、.mp3、.ogg等等),但我确实想创建一个输出文件。

  9. ruby-on-rails - 按天对 Mongoid 对象进行分组 - 2

    在控制台中反复尝试之后,我想到了这种方法,可以按发生日期对类似activerecord的(Mongoid)对象进行分组。我不确定这是完成此任务的最佳方法,但它确实有效。有没有人有更好的建议,或者这是一个很好的方法?#eventsisanarrayofactiverecord-likeobjectsthatincludeatimeattributeevents.map{|event|#converteventsarrayintoanarrayofhasheswiththedayofthemonthandtheevent{:number=>event.time.day,:event=>ev

  10. ruby-on-rails - 'compass watch' 是如何工作的/它是如何与 rails 一起使用的 - 2

    我在我的项目目录中完成了compasscreate.和compassinitrails。几个问题:我已将我的.sass文件放在public/stylesheets中。这是放置它们的正确位置吗?当我运行compasswatch时,它不会自动编译这些.sass文件。我必须手动指定文件:compasswatchpublic/stylesheets/myfile.sass等。如何让它自动运行?文件ie.css、print.css和screen.css已放在stylesheets/compiled。如何在编译后不让它们重新出现的情况下删除它们?我自己编译的.sass文件编译成compiled/t

随机推荐