草庐IT

linux - 在 Linux 中运行 R 脚本时等待用户输入

coder 2023-06-18 原文

我有一段代码提示用户输入，并且在 Windows 中运行代码时工作得很好。然而，在 Linux 中，它执行每一行而不等待用户输入。

我在一个单独的函数中添加了代码并使用了 system("stty -echo") 但没有成功。 为什么会发生这种情况，可以做什么？ (执行命令:Rscript test.R)

require(Biostrings)
read_value <- function(prompt_text = "", prompt_suffix = getOption("prompt"),
                       coerce_to= "character")
{
  prompt <- paste(prompt_text, prompt_suffix)
  system("stty -echo")
  as(readline(prompt), coerce_to)
 }

prints<-function()
{ opt<-as.character(readline(prompt = "Enter parameter values: "))
  system("stty -echo")
  i<-1
  while ((i<=5))
    { if (i==1)
       { expr.filename <- as.character(readline(prompt = "Expression file name: "))
         tryCatch( {expr.file<-read.table(expr.filename)},error=function(e)
             {print("ERROR : Enter valid filename!") return })
       }
      if (i==2)
      {  system("stty -echo")
       fasta.filename <- as.character(readline(prompt = "Fasta file name: "))
       tryCatch( {sequence_data<-read.DNAStringSet(fasta.filename)},error=function(e) 
                {print("ERROR : Enter valid filename!")  return })
      }
     #missing piece of code
    i<-i+1
}

最佳答案

您可能要考虑使用“stdin”中的readLines。提示功能是为记录数据集而设计的。

 cat("Please enter a file name ...")
 fil <- readLines(con="stdin", 1)
 cat(fil, "\n")

另存为 filnam.r .... 使用:

user-linux-prompt$  Rscript filnam.r

关于linux - 在 Linux 中运行 R 脚本时等待用户输入，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/9648933/

中运linuxprompt34sectionruser-input

有关linux - 在 Linux 中运行 R 脚本时等待用户输入的更多相关文章

  1. ruby - 如何将脚本文件的末尾读取为数据文件(Perl 或任何其他语言) - 2

    我正在寻找执行以下操作的正确语法(在Perl、Shell或Ruby中):#variabletoaccessthedatalinesappendedasafileEND_OF_SCRIPT_MARKERrawdatastartshereanditcontinues. 最佳答案 Perl用__DATA__做这个:#!/usr/bin/perlusestrict;usewarnings;while(){print;}__DATA__Texttoprintgoeshere 关于ruby-如何将脚

  2. ruby-on-rails - 独立 ruby​​ 脚本的配置文件 - 2

    我有一个在Linux服务器上运行的ruby​​脚本。它不使用rails或任何东西。它基本上是一个命令行ruby​​脚本，可以像这样传递参数:./ruby_script.rbarg1arg2如何将参数抽象到配置文件(例如yaml文件或其他文件)中？您能否举例说明如何做到这一点？提前谢谢你。 最佳答案 首先，您可以运行一个写入YAML配置文件的独立脚本:require"yaml"File.write("path_to_yaml_file",[arg1,arg2].to_yaml)然后，在您的应用中阅读它:require"yaml"arg

  3. ruby-on-rails - 使用 rails 4 设计而不更新用户 - 2

    我将应用程序升级到Rails4，一切正常。我可以登录并转到我的编辑页面。也更新了观点。使用标准View时，用户会更新。但是当我添加例如字段:name时，它​​不会在表单中更新。使用devise3.1.1和gem'protected_attributes'我需要在设备或数据库上运行某种更新命令吗？我也搜索过这个地方，找到了许多不同的解决方案，但没有一个会更新我的用户字段。我没有添加任何自定义字段。 最佳答案 如果您想允许额外的参数，您可以在ApplicationController中使用beforefilter，因为Rails4将参数

  4. ruby-on-rails - 简单的 Ruby on Rails 问题——如何将评论附加到用户和文章？ - 2

    我意识到这可能是一个非常基本的问题，但我现在已经花了几天时间回过头来解决这个问题，但出于某种原因，Google就是没有帮助我。(我认为部分问题在于我是一个初学者，我不知道该问什么......)我也看过O'Reilly的RubyCookbook和RailsAPI，但我仍然停留在这个问题上.我找到了一些关于多态关系的信息，但它似乎不是我需要的(尽管如果我错了请告诉我)。我正在尝试调整MichaelHartl'stutorial创建一个包含用户、文章和评论的博客应用程序(不使用脚手架)。我希望评论既属于用户又属于文章。我的主要问题是:我不知道如何将当前文章的ID放入评论Controller。

  5. ruby - RVM "ERROR: Unable to checkout branch ."单用户 - 2

    我在新的Debian6VirtualBoxVM上安装RVM时遇到问题。我已经安装了所有需要的包并使用下载了安装脚本(curl-shttps://rvm.beginrescueend.com/install/rvm)>rvm，但以单个用户身份运行时bashrvm我收到以下错误消息:ERROR:Unabletocheckoutbranch.安装在这里停止，并且(据我所知)没有安装RVM的任何文件。如果我以root身份运行脚本(对于多用户安装)，我会收到另一条消息:Successfullycheckedoutbranch''安装程序继续并指示成功，但未添加.rvm目录，甚至在修改我的.bas

  6. postman——集合——执行集合——测试脚本——pm对象简单示例02 - 2

    //1.验证返回状态码是否是200pm.test("Statuscodeis200",function(){pm.response.to.have.status(200);});//2.验证返回body内是否含有某个值pm.test("Bodymatchesstring",function(){pm.expect(pm.response.text()).to.include("string_you_want_to_search");});//3.验证某个返回值是否是100pm.test("Yourtestname",function(){varjsonData=pm.response.json

  7. ruby - 如何在 ruby​​ 中运行后台线程？ - 2

    我是ruby​​的新手，我认为重新构建一个我用C#编写的简单聊天程序是个好主意。我正在使用Ruby2.0.0MRI(Matz的Ruby实现)。问题是我想在服务器运行时为简单的服务器命令提供I/O。这是从示例中获取的服务器。我添加了使用gets()获取输入的命令方法。我希望此方法在后台作为线程运行，但该线程正在阻塞另一个线程。require'socket'#Getsocketsfromstdlibserver=TCPServer.open(2000)#Sockettolistenonport2000defcommandsx=1whilex==1exitProgram=gets.chomp

  8. ruby-on-rails - 在 Ruby on Rails 中发送响应之前如何等待多个异步操作完成？ - 2

    在我做的一些网络开发中，我有多个操作开始，比如对外部API的GET请求，我希望它们同时开始，因为一个不依赖另一个的结果。我希望事情能够在后台运行。我找到了concurrent-rubylibrary这似乎运作良好。通过将其混合到您创建的类中，该类的方法具有在后台线程上运行的异步版本。这导致我编写如下代码，其中FirstAsyncWorker和SecondAsyncWorker是我编写的类，我在其中混合了Concurrent::Async模块，并编写了一个名为“work”的方法来发送HTTP请求:defindexop1_result=FirstAsyncWorker.new.async.

  9. ruby - 确定 ruby​​ 脚本是否已经在运行 - 2

    有没有一种简单的方法可以判断ruby​​脚本是否已经在运行，然后适本地处理它？例如:我有一个名为really_long_script.rb的脚本。我让它每5分钟运行一次。当它运行时，我想看看之前运行的是否还在运行，然后停止第二个脚本的执行。有什么想法吗？ 最佳答案 ps是一种非常糟糕的方法，并且可能会出现竞争条件。传统的Unix/Linux方法是将PID写入文件(通常在/var/run中)并在启动时检查该文件是否存在。例如pid文件位于/var/run/myscript.pid然后你会在运行程序之前检查它是否存在。有一些技巧可以避免

  10. ruby - 鸭子输入字符串、符号和数组的优雅方式？ - 2

    这是针对我无法破坏的现有公共(public)API，但我确实希望对其进行扩展。目前，该方法采用字符串或符号或任何其他在作为第一个参数传递给send时有意义的内容我想添加发送字符串、符号等列表的功能。我可以只使用is_a吗？数组，但还有其他发送列表的方法，这不是很像ruby​​。我将调用列表中的map，所以第一个倾向是使用respond_to?:map。但是字符串也会响应:map，所以这行不通。 最佳答案 如何将它们全部视为数组？String的行为与仅包含String的Array相同:deffoo(obj,arg)[*arg].eac

随机推荐