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c++ - 从 Boost 图中删除 100,000 多个节点

coder 2024-02-14 原文

我有一个图 ( adjacency_list (listS, vecS, bidirectionalS, VertexVal) )，我需要在其中删除 100,000 多个节点。每个节点还包含一个由 2 个 64 位整数和另一个 64 位整数组成的结构。下面代码中发生的 guid 检查是检查结构中的第一个整数。

根据 VTune，在我的笔记本电脑(i7 2.7GHz，16GB 内存)上大约需要 88 秒。

以下是我如何删除节点:

  vertex_iterator vi,vi_end;
  boost::tie(vi, vi_end) = boost::vertices(m_graph);
  while (vi!=vi_end) {
    if (m_graph[*vi].guid.part1 == 0) {
      boost::remove_vertex(*vi,m_graph);
      boost::tie(vi, vi_end) = boost::vertices(m_graph);
    } else 
      ++vi;
  }

Vtune 显示 boost::remove_vertex() 调用需要 88.145 秒。有没有更有效的方法来删除这些顶点？

最佳答案

在您的删除分支中，您重新tie() 迭代器:

boost::tie(vi, vi_end) = boost::vertices(m_graph);

这将导致每次重新启动循环时循环重新启动。这正是 Schlemiel The Painter .

我会查明您是否可以相信 remove_vertex 不会触发重新分配。如果是这样，它很容易修复。否则，您需要基于索引器的循环而不是基于迭代器的循环。或者您可以在原始容器上工作(不过，我记得它是私有(private)成员)。

更新 使用 vecS 作为顶点的容器会导致性能不佳:

If the VertexList template parameter of the adjacency_list was vecS, then all vertex descriptors, edge descriptors, and iterators for the graph are invalidated by this operation. <...> If you need to make frequent use of the remove_vertex() function the listS selector is a much better choice for the VertexList template parameter.

这small benchmark test.cpp比较:

  • 与 -DSTABLE_IT (listS)

    $ ./stable 
Generated 100000 vertices and 5000 edges in 14954ms
The graph has a cycle? false
starting selective removal...
Done in 0ms
After: 99032 vertices and 4916 edges

  • 没有-DSTABLE_IT (vecS)

    $ ./unstable 
Generated 100000 vertices and 5000 edges in 76ms
The graph has a cycle? false
starting selective removal...
Done in 396ms
After: 99032 vertices and 4916 edges

  • 使用filtered_graph(感谢评论中的@cv_and_he)

    Generated 100000 vertices and 5000 edges in 15ms
The graph has a cycle? false
starting selective removal...
Done in 0ms
After: 99032 vertices and 4916 edges
Done in 13ms

您可以清楚地看到，listS 的删除速度多，但生成速度多/strong> 较慢。

关于c++ - 从 Boost 图中删除 100,000 多个节点，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/28376370/

图中ampcodestrongverticesc++boost

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