我有 200 个大小从 1 到 4000000 的 vector 存储在 vecOfVec 中。我需要将这些 vector 与大小为 9000+ 元素的单个 vector “vecSearched”相交。我尝试使用以下代码来做同样的事情,但是使用 perf 工具我发现我正在做的交集是我代码中的瓶颈。有什么方法可以执行有效的交叉
#include <cstdlib>
#include <iostream>
#include <vector>
using namespace std;
int main(int argc, char** argv) {
vector<vector<unsigned> > vecOfVec; //contains 120 vectors of size ranging from 1 to 2000000 elements. All vectors in vecOfVec are sorted
vector<unsigned> vecSearched; //vector searched in contains 9000+ elements. Vectors in vecSearched are sorted
for(unsigned kbt=0; kbt<vecOfVec.size(); kbt++)
{
//first find first 9 values spaced at equi-distant places, use these 9 values for performing comparisons
vector<unsigned> equiSpacedVec;
if(((vecSearched[0]))>vecOfVec[kbt][(vecOfVec[kbt].size())-1]) //if beginning of searched vector > last value present in individual vectors of vecOfVec then continue
{
continue;
}
unsigned elementIndex=0; //used for iterating over equiSpacedVec
unsigned i=0; //used for iterating over individual buckets vecOfVec[kbt].second
//search for value in bucket and store it in bucketValPos
bool firstRun=true;
for(vector<unsigned>::iterator itValPos=vecSearched.begin();itValPos!=vecSearched.end();++itValPos)
{
//construct a summarized vector out of individual vectors of vecOfVec
if(firstRun)
{
firstRun=false;
unsigned elementIndex1=0; //used for iterating over equiSpacedVec
while(elementIndex1<(vecOfVec[kbt].size())) //create a small vector for skipping over the remaining vectors
{
if((elementIndex1+(10000))<(vecOfVec[kbt].size()))
elementIndex1+=10000;
else
break;
equiSpacedVec.push_back(vecOfVec[kbt][elementIndex1]);
}
}
//skip individual vectors of vecOfVec using summarized vector constructed above
while((!(equiSpacedVec.empty()))&&(equiSpacedVec.size()>(elementIndex+1))&&((*itValPos)>equiSpacedVec[elementIndex+1])){
elementIndex+=1;
if((i+100)<(vecOfVec[kbt].size()))
i+=100;
}
unsigned j=i;
while(((*itValPos)>vecOfVec[kbt][j])&&(j<vecOfVec[kbt].size())){
j++;
}
if(j>(vecOfVec[kbt].size()-1)) //element not found even at last position.
{
break;
}
if((*itValPos)==vecOfVec[kbt][j])
{
//store intersection result
}
}
}
return 0;
}
最佳答案
您的问题很受欢迎。由于您没有相关 vector 相交的数据,它归结为加速两个 vector 之间的交集,基本上有两种方法:
这通常由三件事来解决:
减少比较次数。例如,对于小 vector (大小为 1 到 50),您应该对每个元素进行二进制搜索,以避免遍历主题 vector 的所有 9000+ 个元素。
提高代码质量以减少分支错误预测,例如,观察结果集通常比输入集的大小可以转换这样的代码:
while (Apos < Aend && Bpos < Bend) {
if (A[Apos] == B[Bpos]) {
C[Cpos++] = A[Apos];
Apos++; Bpos++;
}
else if (A[Apos] > B[Bpos]) {
Bpos++;
}
else {
Apos++;
}
}
编写“展开”此类比较的代码,虽然更容易预测分支( block 大小 = 2 的示例):
while (1) {
Adat0 = A[Apos]; Adat1 = A[Apos + 1];
Bdat0 = B[Bpos]; Bdat1 = B[Bpos + 1];
if (Adat0 == Bdat0) {
C[Cpos++] = Adat0;
}
else if (Adat0 == Bdat1) {
C[Cpos++] = Adat0;
goto advanceB;
}
else if (Adat1 == Bdat0) {
C[Cpos++] = Adat1;
goto advanceA;
}
if (Adat1 == Bdat1) {
C[Cpos++] = Adat1;
goto advanceAB;
}
else if (Adat1 > Bdat1) goto advanceB;
else goto advanceA;
advanceA:
Apos+=2;
if (Apos >= Aend) { break; } else { continue; }
advanceB:
Bpos+=2;
if (Bpos >= Bend) { break; } else { continue; }
advanceAB:
Apos+=2; Bpos+=2;
if (Apos >= Aend || Bpos >= Bend) { break; }
}
// fall back to naive algorithm for remaining elements
使用SIMD指令进行 block 操作
这些技术很难在 QA 上下文中描述,但您可以阅读它们(加上相关的优化,如 if 转换)here和 here或查找实现元素 here
恕我直言,这个方法更适合您的情况,因为您有一个大小为 9000 多个元素的单一主题 vector 。您可以从中制作一棵间隔树,或者简单地找到一种索引它的方法,例如制作一个可以加快搜索速度的结构:
vector<unsigned> subject(9000+);
vector<range> index(9000/M);
其中 range 是一个类似的结构
struct range {
unsigned min, max;
};
这样就创建了一系列范围
[0, 100], [101, 857], ... [33221, 33500]
这将允许在进行交集时跳过许多比较(例如,如果另一个集合的元素大于子范围的最大值,您可以完全跳过该子范围)
是的,两个元素的列表中总有第三个元素 :P。当您对过程进行了足够的优化时(并且只有到那时),请将您的工作分解成 block 并并行运行。该问题符合令人尴尬的模式,因此 200 vector 对 1 应该明确地运行为“50 对 1 四次并发”
测试、测量、重新设计!!
关于c++ - 执行 vector c++的交集,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/31065273/
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