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python - travis-ci 上的 scipy ImportError

coder 2023-05-27 原文

我是第一次设置 Travis-CI。我以我认为是标准的方式安装 scipy:

language: python
python:
  - "2.7"
# command to install dependencies
before_install:
  - sudo apt-get -qq update
  - sudo apt-get -qq install python-numpy python-scipy python-opencv
  - sudo apt-get -qq install libhdf5-serial-dev hdf5-tools
install:
   - "pip install numexpr"
   - "pip install cython"
   - "pip install -r requirements.txt --use-mirrors"
# command to run tests
script: nosetests

一切都建立起来。但是当 Nose 测试开始时,我得到了

ImportError: No module named scipy.ndimage

更新:这里有一个更直接的问题演示。

$ sudo apt-get install python-numpy python-scipy python-opencv
$ python -c 'import scipy'
Traceback (most recent call last):
  File "<string>", line 1, in <module>

ImportError: No module named scipy

The command "python -c 'import scipy'" failed and exited with 1 during install.

我也尝试使用 pip 安装 scipy。我尝试先安装 gfortran。 Here is one example of a failed build .有什么建议吗?

另一个更新:Travis 已经添加了关于在 Travis 中使用 conda 的官方文档。请参阅 ostrokach 的回答。

最佳答案

我找到了解决这个困难的两种方法:

  1. 正如@unutbu 建议的那样,构建您自己的虚拟环境并在该环境中使用 pip 安装所有内容。我通过了构建,但是以这种方式从源代码安装 scipy 非常慢。

  2. 遵循 this .travis.yml file and the shell scripts that it calls 中 pandas 项目使用的方法,强制 travis 使用系统范围的站点包,并使用 apt-get 安装 numpy 和 scipy。这要快得多。关键线是

    virtualenv:
        system_site_packages: true
    

    在 travis.yml 中的 before_install 组之前,后面是这些 shell 命令

    SITE_PKG_DIR=$VIRTUAL_ENV/lib/python$TRAVIS_PYTHON_VERSION/site-packages
    rm -f $VIRTUAL_ENV/lib/python$TRAVIS_PYTHON_VERSION/no-global-site-packages.txt  
    

    然后是最后

    apt-get install python-numpy
    apt-get install python-scipy
    

    当 Nose 测试尝试导入它们时会找到。

更新

我现在更喜欢基于 conda 的构建,它比上述任何一种策略都快。这里是 one example在我维护的一个项目中。

关于python - travis-ci 上的 scipy ImportError,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/17224389/

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