我有以下数据框。
df.head(30)
struct_id resNum score_type_name score_value
0 4294967297 1 omega 0.064840
1 4294967297 1 fa_dun 2.185618
2 4294967297 1 fa_dun_dev 0.000027
3 4294967297 1 fa_dun_semi 2.185591
4 4294967297 1 ref -1.191180
5 4294967297 2 rama -0.795161
6 4294967297 2 omega 0.222345
7 4294967297 2 fa_dun 1.378923
8 4294967297 2 fa_dun_dev 0.028560
9 4294967297 2 fa_dun_rot 1.350362
10 4294967297 2 p_aa_pp -0.442467
11 4294967297 2 ref 0.249477
12 4294967297 3 rama 0.267443
13 4294967297 3 omega 0.005106
14 4294967297 3 fa_dun 0.020352
15 4294967297 3 fa_dun_dev 0.025507
16 4294967297 3 fa_dun_rot -0.005156
17 4294967297 3 p_aa_pp -0.096847
18 4294967297 3 ref 0.979644
19 4294967297 4 rama -1.403292
20 4294967297 4 omega 0.212160
21 4294967297 4 fa_dun 4.218029
22 4294967297 4 fa_dun_dev 0.003712
23 4294967297 4 fa_dun_semi 4.214317
24 4294967297 4 p_aa_pp -0.462765
25 4294967297 4 ref -1.960940
26 4294967297 5 rama -0.600053
27 4294967297 5 omega 0.061867
28 4294967297 5 fa_dun 3.663050
29 4294967297 5 fa_dun_dev 0.004953
根据 pivot 文档,我应该能够使用 pivot 函数在 score_type_name 上 reshape 它。
df.pivot(columns='score_type_name',values='score_value',index=['struct_id','resNum'])
但是,我得到以下信息。
但是,pivot_table 函数似乎可以工作:
pivoted = df.pivot_table(columns='score_type_name',
values='score_value',
index=['struct_id','resNum'])
但至少对我来说,它不适合做进一步的分析。我希望它只将 struct_id、resNum 和 score_type_name 作为列,而不是将 score_type_name 堆叠在其他列的顶部。此外,我希望 struct_id 用于每一行,而不是像在表中那样聚合在连接行中。
那么谁能告诉我如何使用 pivot 获得一个不错的 Dataframe?此外,从文档中,我无法说出为什么 pivot_table 有效而 pivot 无效。如果我查看枢轴的第一个示例,它看起来正是我所需要的。
附: 我确实发布了一个关于这个问题的问题,但是我在演示输出方面做得很差,我删除了它并再次使用 ipython notebook 尝试。如果您看到两次,我提前道歉。
Here is the notebook for your full reference
编辑 - 我想要的结果看起来像这样(用 excel 制作):
StructId resNum pdb_residue_number chain_id name3 fa_dun fa_dun_dev fa_dun_rot fa_dun_semi omega p_aa_pp rama ref
4294967297 1 99 A ASN 2.1856 0.0000 2.1856 0.0648 -1.1912
4294967297 2 100 A MET 1.3789 0.0286 1.3504 0.2223 -0.4425 -0.7952 0.2495
4294967297 3 101 A VAL 0.0204 0.0255 -0.0052 0.0051 -0.0968 0.2674 0.9796
4294967297 4 102 A GLU 4.2180 0.0037 4.2143 0.2122 -0.4628 -1.4033 -1.9609
4294967297 5 103 A GLN 3.6630 0.0050 3.6581 0.0619 -0.2759 -0.6001 -1.5172
4294967297 6 104 A MET 1.5175 0.2206 1.2968 0.0504 -0.3758 -0.7419 0.2495
4294967297 7 105 A HIS 3.6987 0.0184 3.6804 0.0547 0.4019 -0.1489 0.3883
4294967297 8 106 A THR 0.1048 0.0134 0.0914 0.0003 -0.7963 -0.4033 0.2013
4294967297 9 107 A ASP 2.3626 0.0005 2.3620 0.0521 0.1955 -0.3499 -1.6300
4294967297 10 108 A ILE 1.8447 0.0270 1.8176 0.0971 0.1676 -0.4071 1.0806
4294967297 11 109 A ILE 0.1276 0.0092 0.1183 0.0208 -0.4026 -0.0075 1.0806
4294967297 12 110 A SER 0.2921 0.0342 0.2578 0.0342 -0.2426 -1.3930 0.1654
4294967297 13 111 A LEU 0.6483 0.0019 0.6464 0.0845 -0.3565 -0.2356 0.7611
4294967297 14 112 A TRP 2.5965 0.1507 2.4457 0.5143 -0.1370 -0.5373 1.2341
4294967297 15 113 A ASP 2.6448 0.1593 0.0510 -0.5011
最佳答案
对于仍然对pivot和pivot_table之间的区别感兴趣的人,主要有两个区别:
pivot_table 是 pivot 的概括,它可以处理一个 pivot 索引/列对的重复值。具体来说,您可以使用关键字参数 aggfunc 为 pivot_table 提供一个聚合函数列表。 pivot_table 的默认 aggfunc 是 numpy.mean。pivot_table 还支持对pivot 表的索引和列使用多列。系统会自动为您生成分层索引。编号:pivot和 pivot_table
关于python - Pandas :pivot 和 pivot_table 之间的区别。为什么只有 pivot_table 工作?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/30960338/
类classAprivatedeffooputs:fooendpublicdefbarputs:barendprivatedefzimputs:zimendprotecteddefdibputs:dibendendA的实例a=A.new测试a.foorescueputs:faila.barrescueputs:faila.zimrescueputs:faila.dibrescueputs:faila.gazrescueputs:fail测试输出failbarfailfailfail.发送测试[:foo,:bar,:zim,:dib,:gaz].each{|m|a.send(m)resc
关闭。这个问题是opinion-based.它目前不接受答案。想要改进这个问题?更新问题,以便editingthispost可以用事实和引用来回答它.关闭4年前。Improvethisquestion我想在固定时间创建一系列低音和高音调的哔哔声。例如:在150毫秒时发出高音调的蜂鸣声在151毫秒时发出低音调的蜂鸣声200毫秒时发出低音调的蜂鸣声250毫秒的高音调蜂鸣声有没有办法在Ruby或Python中做到这一点?我真的不在乎输出编码是什么(.wav、.mp3、.ogg等等),但我确实想创建一个输出文件。
我有一个模型:classItem项目有一个属性“商店”基于存储的值,我希望Item对象对特定方法具有不同的行为。Rails中是否有针对此的通用设计模式?如果方法中没有大的if-else语句,这是如何干净利落地完成的? 最佳答案 通常通过Single-TableInheritance. 关于ruby-on-rails-Rails-子类化模型的设计模式是什么?,我们在StackOverflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.co
我正在使用的第三方API的文档状态:"[O]urAPIonlyacceptspaddedBase64encodedstrings."什么是“填充的Base64编码字符串”以及如何在Ruby中生成它们。下面的代码是我第一次尝试创建转换为Base64的JSON格式数据。xa=Base64.encode64(a.to_json) 最佳答案 他们说的padding其实就是Base64本身的一部分。它是末尾的“=”和“==”。Base64将3个字节的数据包编码为4个编码字符。所以如果你的输入数据有长度n和n%3=1=>"=="末尾用于填充n%
我主要使用Ruby来执行此操作,但到目前为止我的攻击计划如下:使用gemsrdf、rdf-rdfa和rdf-microdata或mida来解析给定任何URI的数据。我认为最好映射到像schema.org这样的统一模式,例如使用这个yaml文件,它试图描述数据词汇表和opengraph到schema.org之间的转换:#SchemaXtoschema.orgconversion#data-vocabularyDV:name:namestreet-address:streetAddressregion:addressRegionlocality:addressLocalityphoto:i
为什么4.1%2返回0.0999999999999996?但是4.2%2==0.2。 最佳答案 参见此处:WhatEveryProgrammerShouldKnowAboutFloating-PointArithmetic实数是无限的。计算机使用的位数有限(今天是32位、64位)。因此计算机进行的浮点运算不能代表所有的实数。0.1是这些数字之一。请注意,这不是与Ruby相关的问题,而是与所有编程语言相关的问题,因为它来自计算机表示实数的方式。 关于ruby-为什么4.1%2使用Ruby返
我构建了两个需要相互通信和发送文件的Rails应用程序。例如,一个Rails应用程序会发送请求以查看其他应用程序数据库中的表。然后另一个应用程序将呈现该表的json并将其发回。我还希望一个应用程序将存储在其公共(public)目录中的文本文件发送到另一个应用程序的公共(public)目录。我从来没有做过这样的事情,所以我什至不知道从哪里开始。任何帮助,将不胜感激。谢谢! 最佳答案 无论Rails是什么,几乎所有Web应用程序都有您的要求,大多数现代Web应用程序都需要相互通信。但是有一个小小的理解需要你坚持下去,网站不应直接访问彼此
它不等于主线程的binding,这个toplevel作用域是什么?此作用域与主线程中的binding有何不同?>ruby-e'putsTOPLEVEL_BINDING===binding'false 最佳答案 事实是,TOPLEVEL_BINDING始终引用Binding的预定义全局实例,而Kernel#binding创建的新实例>Binding每次封装当前执行上下文。在顶层,它们都包含相同的绑定(bind),但它们不是同一个对象,您无法使用==或===测试它们的绑定(bind)相等性。putsTOPLEVEL_BINDINGput
我可以得到Infinity和NaNn=9.0/0#=>Infinityn.class#=>Floatm=0/0.0#=>NaNm.class#=>Float但是当我想直接访问Infinity或NaN时:Infinity#=>uninitializedconstantInfinity(NameError)NaN#=>uninitializedconstantNaN(NameError)什么是Infinity和NaN?它们是对象、关键字还是其他东西? 最佳答案 您看到打印为Infinity和NaN的只是Float类的两个特殊实例的字符串
如果您尝试在Ruby中的nil对象上调用方法,则会出现NoMethodError异常并显示消息:"undefinedmethod‘...’fornil:NilClass"然而,有一个tryRails中的方法,如果它被发送到一个nil对象,它只返回nil:require'rubygems'require'active_support/all'nil.try(:nonexisting_method)#noNoMethodErrorexceptionanymore那么try如何在内部工作以防止该异常? 最佳答案 像Ruby中的所有其他对象