我正在用 python 绘制自相关。我用了三种方法来做:1.pandas,2.matplotlib,3.statsmodels。我发现我从 matplotlib 得到的图表与其他两个不一致。代码是:
from statsmodels.graphics.tsaplots import *
# print out data
print mydata.values
#1. pandas
p=autocorrelation_plot(mydata)
plt.title('mydata')
#2. matplotlib
fig=plt.figure()
plt.acorr(mydata,maxlags=150)
plt.title('mydata')
#3. statsmodels.graphics.tsaplots.plot_acf
plot_acf(mydata)
plt.title('mydata')
最佳答案
这是统计和信号处理之间不同通用定义的结果。基本上,信号处理定义假定您要处理去趋势。统计定义假设减去均值就是您要做的所有去除趋势的工作,并且会为您完成。
首先,让我们用一个独立的例子来演示这个问题:
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import pandas as pd
from statsmodels.graphics import tsaplots
def label(ax, string):
ax.annotate(string, (1, 1), xytext=(-8, -8), ha='right', va='top',
size=14, xycoords='axes fraction', textcoords='offset points')
np.random.seed(1977)
data = np.random.normal(0, 1, 100).cumsum()
fig, axes = plt.subplots(nrows=4, figsize=(8, 12))
fig.tight_layout()
axes[0].plot(data)
label(axes[0], 'Raw Data')
axes[1].acorr(data, maxlags=data.size-1)
label(axes[1], 'Matplotlib Autocorrelation')
tsaplots.plot_acf(data, axes[2])
label(axes[2], 'Statsmodels Autocorrelation')
pd.tools.plotting.autocorrelation_plot(data, ax=axes[3])
label(axes[3], 'Pandas Autocorrelation')
# Remove some of the titles and labels that were automatically added
for ax in axes.flat:
ax.set(title='', xlabel='')
plt.show()
那么,我到底为什么要说它们都是正确的?它们明显不同!
让我们编写自己的自相关函数来演示 plt.acorr 正在做什么:
def acorr(x, ax=None):
if ax is None:
ax = plt.gca()
autocorr = np.correlate(x, x, mode='full')
autocorr /= autocorr.max()
return ax.stem(autocorr)
如果我们用我们的数据绘制它,我们将得到与 plt.acorr 或多或少相同的结果(我没有正确标记滞后,只是因为我懒惰):
fig, ax = plt.subplots()
acorr(data)
plt.show()
这是一个完全有效的自相关。这完全取决于您的背景是信号处理还是统计。
这是信号处理中使用的定义。假设您要处理数据的去趋势化(请注意 plt.acorr 中的 detrend kwarg)。如果你想要它去趋势化,你会明确要求它(并且可能做一些比仅仅减去平均值更好的事情),否则不应该假设它。
在统计学中,简单地减去均值被认为是您想要去除趋势的方法。
所有其他函数都是在相关之前减去数据的平均值,类似于:
def acorr(x, ax=None):
if ax is None:
ax = plt.gca()
x = x - x.mean()
autocorr = np.correlate(x, x, mode='full')
autocorr /= autocorr.max()
return ax.stem(autocorr)
fig, ax = plt.subplots()
acorr(data)
plt.show()
但是,我们仍然有一个很大的不同。这纯粹是一种密谋约定。
在大多数信号处理教科书中(无论如何我都看过),显示的是“完全”自相关,即零滞后位于中心,结果在每一侧都是对称的。另一方面,R 有非常合理的约定,只显示它的一侧。 (毕竟,另一面是完全多余的。)统计绘图函数遵循 R 约定,plt.acorr 遵循 Matlab 所做的,这是相反的约定。
基本上,你会想要这个:
def acorr(x, ax=None):
if ax is None:
ax = plt.gca()
x = x - x.mean()
autocorr = np.correlate(x, x, mode='full')
autocorr = autocorr[x.size:]
autocorr /= autocorr.max()
return ax.stem(autocorr)
fig, ax = plt.subplots()
acorr(data)
plt.show()
关于python - matplotlib 的 plt.acorr 中自相关图的错误?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/27541290/
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