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乳腺数据DDSM标注overlay文件python处理

蓝湛救我 2023-06-08 原文

乳腺数据DDSM标注overlay文件python处理

原始.overlay文件内容

标注内容包括:
总共的病灶数:total abnormalities
病灶当前索引:abnormality
病灶类型:钙化指出分布和形态,肿块指出形状和边缘
下略
标注边界:boundary
boundary的值包括0-7等

参考

之前在github上有基于matlab的标注处理参考文件: https://github.com/trane293/DDSMUtility
简单看一下处理逻辑
主要是readBoundary.m文件里面的readBoundary函数
这部分就是从从文件中找到boundary关键字以及结束标识符#
这部分就是对boundary文件中的不同值在前一个点的基础上做位移

python 的

只有一个病灶的差不多是这样,多个病灶的写一些判断条件就行

最后把这些点画出来可视化一下看对不对

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