我在不同参数的循环中运行相同的模拟。每个模拟都使用一个 pandas DataFrame (data),它只被读取,从不被修改。使用 ipyparallel(IPython 并行),我可以在模拟开始之前将此 DataFrames 放入我 View 中每个引擎的全局变量空间中:
view['data'] = data
然后引擎可以访问 DataFrame 以获取在其上运行的所有模拟。复制数据(如果 pickled,data 为 40MB)的过程只有几秒钟。但是,如果模拟次数增加,内存使用量似乎会增长得非常大。我想这个共享数据正在被复制为每个任务 而不仅仅是为每个引擎。从客户端与引擎共享静态只读数据的最佳实践是什么?每个引擎复制一次是可以接受的,但理想情况下,每个主机只需要复制一次(我在 host1 上有 4 个引擎,在 host2 上有 8 个引擎)。
这是我的代码:
from ipyparallel import Client
import pandas as pd
rc = Client()
view = rc[:] # use all engines
view.scatter('id', rc.ids, flatten=True) # So we can track which engine performed what task
def do_simulation(tweaks):
""" Run simulation with specified tweaks """
# Do sim stuff using the global data DataFrame
return results, id, tweaks
if __name__ == '__main__':
data = pd.read_sql("SELECT * FROM my_table", engine)
threads = [] # store list of tweaks dicts
for i in range(4):
for j in range(5):
for k in range(6):
threads.append(dict(i=i, j=j, k=k)
# Set up globals for each engine. This is the read-only DataFrame
view['data'] = data
ar = view.map_async(do_simulation, threads)
# Our async results should pop up over time. Let's measure our progress:
for idx, (results, id, tweaks) in enumerate(ar):
print 'Progress: {}%: Simulation {} finished on engine {}'.format(100.0 * ar.progress / len(ar), idx, id)
# Store results as a pickle for the future
pfile = '{}_{}_{}.pickle'.format(tweaks['i'], tweaks['j'], tweaks['j'])
# Save our results to a pickle file
pd.to_pickle(results, out_file_path + pfile)
print 'Total execution time: {} (serial time: {})'.format(ar.wall_time, ar.serial_time)
如果模拟计数很小(~50),那么开始需要一段时间,但我开始看到进度打印语句。奇怪的是,多个任务将分配给同一个引擎,并且在为该引擎完成所有这些分配的任务之前我看不到响应。每次完成单个模拟任务时,我都希望看到 enumerate(ar) 的响应。
如果模拟计数很大(~1000),启动需要很长时间,我看到所有引擎上的 CPU 节流,但直到很长时间(~40 分钟)才看到进度打印语句,当我确实看到了进展,似乎一大块(>100)任务进入了同一个引擎,并等待该引擎完成,然后再提供一些进展。当那个引擎完成时,我看到 ar 对象每 4 秒提供一次新响应——这可能是写入输出 pickle 文件的时间延迟。
最后,host1 还运行了 ipycontroller 任务,它的内存使用量疯狂上升(Python 任务显示使用 >6GB RAM,内核任务显示使用 3GB)。 host2 引擎并没有真正显示出太多的内存使用情况。什么会导致这种内存峰值?
最佳答案
我在几年前的代码中使用过这个逻辑,我开始使用 this .我的代码是这样的:
shared_dict = {
# big dict with ~10k keys, each with a list of dicts
}
balancer = engines.load_balanced_view()
with engines[:].sync_imports(): # your 'view' variable
import pandas as pd
import ujson as json
engines[:].push(shared_dict)
results = balancer.map(lambda i: (i, my_func(i)), id)
results_data = results.get()
If simulation counts are small (~50), then it takes a while to get started, but i start to see progress print statements. Strangely, multiple tasks will get assigned to the same engine and I don't see a response until all of those assigned tasks are completed for that engine. I would expect to see a response from enumerate(ar) every time a single simulation task completes.
在我的例子中,my_func() 是一个复杂的方法,我将大量日志消息写入一个文件,所以我有打印语句。
关于任务分配,因为我使用了 load_balanced_view(),所以我让图书馆自行其是,效果很好。
If simulation counts are large (~1000), it takes a long time to get started, i see the CPUs throttle up on all engines, but no progress print statements are seen until a long time (~40mins), and when I do see progress, it appears a large block (>100) of tasks went to same engine, and awaited completion from that one engine before providing some progress. When that one engine did complete, i saw the ar object provided new responses ever 4 secs - this may have been the time delay to write the output pickle files.
关于这么久了,我没有经历过,所以我什么也不能说。
我希望这能对您的问题有所启发。
PS:正如我在评论中所说,您可以尝试multiprocessing.Pool .我想我还没有尝试使用它来共享一个大的只读数据作为全局变量。我会试一试,因为 it seems to work .
关于python - 如何最好地在 ipyparallel 客户端和远程引擎之间共享静态数据?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/33722330/
我正在学习如何使用Nokogiri,根据这段代码我遇到了一些问题:require'rubygems'require'mechanize'post_agent=WWW::Mechanize.newpost_page=post_agent.get('http://www.vbulletin.org/forum/showthread.php?t=230708')puts"\nabsolutepathwithtbodygivesnil"putspost_page.parser.xpath('/html/body/div/div/div/div/div/table/tbody/tr/td/div
总的来说,我对ruby还比较陌生,我正在为我正在创建的对象编写一些rspec测试用例。许多测试用例都非常基础,我只是想确保正确填充和返回值。我想知道是否有办法使用循环结构来执行此操作。不必为我要测试的每个方法都设置一个assertEquals。例如:describeitem,"TestingtheItem"doit"willhaveanullvaluetostart"doitem=Item.new#HereIcoulddotheitem.name.shouldbe_nil#thenIcoulddoitem.category.shouldbe_nilendend但我想要一些方法来使用
关闭。这个问题是opinion-based.它目前不接受答案。想要改进这个问题?更新问题,以便editingthispost可以用事实和引用来回答它.关闭4年前。Improvethisquestion我想在固定时间创建一系列低音和高音调的哔哔声。例如:在150毫秒时发出高音调的蜂鸣声在151毫秒时发出低音调的蜂鸣声200毫秒时发出低音调的蜂鸣声250毫秒的高音调蜂鸣声有没有办法在Ruby或Python中做到这一点?我真的不在乎输出编码是什么(.wav、.mp3、.ogg等等),但我确实想创建一个输出文件。
给定这段代码defcreate@upgrades=User.update_all(["role=?","upgraded"],:id=>params[:upgrade])redirect_toadmin_upgrades_path,:notice=>"Successfullyupgradeduser."end我如何在该操作中实际验证它们是否已保存或未重定向到适当的页面和消息? 最佳答案 在Rails3中,update_all不返回任何有意义的信息,除了已更新的记录数(这可能取决于您的DBMS是否返回该信息)。http://ar.ru
我在我的项目目录中完成了compasscreate.和compassinitrails。几个问题:我已将我的.sass文件放在public/stylesheets中。这是放置它们的正确位置吗?当我运行compasswatch时,它不会自动编译这些.sass文件。我必须手动指定文件:compasswatchpublic/stylesheets/myfile.sass等。如何让它自动运行?文件ie.css、print.css和screen.css已放在stylesheets/compiled。如何在编译后不让它们重新出现的情况下删除它们?我自己编译的.sass文件编译成compiled/t
我正在寻找执行以下操作的正确语法(在Perl、Shell或Ruby中):#variabletoaccessthedatalinesappendedasafileEND_OF_SCRIPT_MARKERrawdatastartshereanditcontinues. 最佳答案 Perl用__DATA__做这个:#!/usr/bin/perlusestrict;usewarnings;while(){print;}__DATA__Texttoprintgoeshere 关于ruby-如何将脚
Rackup通过Rack的默认处理程序成功运行任何Rack应用程序。例如:classRackAppdefcall(environment)['200',{'Content-Type'=>'text/html'},["Helloworld"]]endendrunRackApp.new但是当最后一行更改为使用Rack的内置CGI处理程序时,rackup给出“NoMethodErrorat/undefinedmethod`call'fornil:NilClass”:Rack::Handler::CGI.runRackApp.newRack的其他内置处理程序也提出了同样的反对意见。例如Rack
在选择我想要运行操作的频率时,唯一的选项是“每天”、“每小时”和“每10分钟”。谢谢!我想为我的Rails3.1应用程序运行调度程序。 最佳答案 这不是一个优雅的解决方案,但您可以安排它每天运行,并在实际开始工作之前检查日期是否为当月的第一天。 关于ruby-如何每月在Heroku运行一次Scheduler插件?,我们在StackOverflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/8692687/
我有一个对象has_many应呈现为xml的子对象。这不是问题。我的问题是我创建了一个Hash包含此数据,就像解析器需要它一样。但是rails自动将整个文件包含在.........我需要摆脱type="array"和我该如何处理?我没有在文档中找到任何内容。 最佳答案 我遇到了同样的问题;这是我的XML:我在用这个:entries.to_xml将散列数据转换为XML,但这会将条目的数据包装到中所以我修改了:entries.to_xml(root:"Contacts")但这仍然将转换后的XML包装在“联系人”中,将我的XML代码修改为
我有一大串格式化数据(例如JSON),我想使用Psychinruby同时保留格式转储到YAML。基本上,我希望JSON使用literalstyle出现在YAML中:---json:|{"page":1,"results":["item","another"],"total_pages":0}但是,当我使用YAML.dump时,它不使用文字样式。我得到这样的东西:---json:!"{\n\"page\":1,\n\"results\":[\n\"item\",\"another\"\n],\n\"total_pages\":0\n}\n"我如何告诉Psych以想要的样式转储标量?解