草庐IT

python - Pandas DataFrame 性能

coder 2023-05-20 原文

Pandas 确实很棒,但我很惊讶从 Pandas.DataFrame 中检索值的效率如此之低。在下面的玩具示例中,即使是 DataFrame.iloc 方法也比字典慢 100 倍以上。

问题:这里的教训仅仅是字典是查找值的更好方法吗?是的,我知道这正是它们的用途。但我只是想知道我是否缺少关于 DataFrame 查找性能的一些东西。

我意识到这个问题比“询问”更“沉思”,但我会接受一个能提供洞察力或观点的答案。谢谢。

import timeit

setup = '''
import numpy, pandas
df = pandas.DataFrame(numpy.zeros(shape=[10, 10]))
dictionary = df.to_dict()
'''

f = ['value = dictionary[5][5]', 'value = df.loc[5, 5]', 'value = df.iloc[5, 5]']

for func in f:
    print func
    print min(timeit.Timer(func, setup).repeat(3, 100000))

value = dictionary[5][5]

0.130625009537

value = df.loc[5, 5]

19.4681699276

value = df.iloc[5, 5]

17.2575249672

最佳答案

字典对 DataFrame 就像自行车对汽车一样。 您可以骑自行车 10 英尺,比启动汽车、挂档等速度更快。但如果您需要跑一英里,汽车就赢了。

对于某些小的、有针对性的目的,dict 可能更快。 如果这就是你所需要的,那么一定要使用字典!但是,如果您需要/想要 DataFrame 的功能和奢华,那么 dict 是无可替代的。如果数据结构首先不能满足你的需求,那么比较速度是没有意义的。

现在例如 -- 更具体一点 -- dict 对于访问列很有用,但对于访问行就不那么方便了。

import timeit

setup = '''
import numpy, pandas
df = pandas.DataFrame(numpy.zeros(shape=[10, 1000]))
dictionary = df.to_dict()
'''

# f = ['value = dictionary[5][5]', 'value = df.loc[5, 5]', 'value = df.iloc[5, 5]']
f = ['value = [val[5] for col,val in dictionary.items()]', 'value = df.loc[5]', 'value = df.iloc[5]']

for func in f:
    print(func)
    print(min(timeit.Timer(func, setup).repeat(3, 100000)))

产量

value = [val[5] for col,val in dictionary.iteritems()]
25.5416321754
value = df.loc[5]
5.68071913719
value = df.iloc[5]
4.56006002426

所以列表的字典在检索行时比 df.iloc 慢 5 倍。随着列数的增加,速度赤字变得更大。 (列数就像自行车类比中的英尺数,距离越长,车越方便……)

这只是列表字典比 DataFrame 更不方便/更慢的一个示例。

另一个例子是当你有一个 DatetimeIndex 的行并希望选择特定日期之间的所有行时。使用 DataFrame,您可以使用

df.loc['2000-1-1':'2000-3-31']

如果您要使用列表的字典,则没有简单的类比。与 DataFrame 相比,您需要用于选择正确行的 Python 循环再次变得非常慢。

关于python - Pandas DataFrame 性能,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/22084338/

有关python - Pandas DataFrame 性能的更多相关文章

  1. python - 如何使用 Ruby 或 Python 创建一系列高音调和低音调的蜂鸣声? - 2

    关闭。这个问题是opinion-based.它目前不接受答案。想要改进这个问题?更新问题,以便editingthispost可以用事实和引用来回答它.关闭4年前。Improvethisquestion我想在固定时间创建一系列低音和高音调的哔哔声。例如:在150毫秒时发出高音调的蜂鸣声在151毫秒时发出低音调的蜂鸣声200毫秒时发出低音调的蜂鸣声250毫秒的高音调蜂鸣声有没有办法在Ruby或Python中做到这一点?我真的不在乎输出编码是什么(.wav、.mp3、.ogg等等),但我确实想创建一个输出文件。

  2. Python 相当于 Perl/Ruby ||= - 2

    这个问题在这里已经有了答案:关闭10年前。PossibleDuplicate:Pythonconditionalassignmentoperator对于这样一个简单的问题表示歉意,但是谷歌搜索||=并不是很有帮助;)Python中是否有与Ruby和Perl中的||=语句等效的语句?例如:foo="hey"foo||="what"#assignfooifit'sundefined#fooisstill"hey"bar||="yeah"#baris"yeah"另外,类似这样的东西的通用术语是什么?条件分配是我的第一个猜测,但Wikipediapage跟我想的不太一样。

  3. java - 什么相当于 ruby​​ 的 rack 或 python 的 Java wsgi? - 2

    什么是ruby​​的rack或python的Java的wsgi?还有一个路由库。 最佳答案 来自Python标准PEP333:Bycontrast,althoughJavahasjustasmanywebapplicationframeworksavailable,Java's"servlet"APImakesitpossibleforapplicationswrittenwithanyJavawebapplicationframeworktoruninanywebserverthatsupportstheservletAPI.ht

  4. 华为OD机试用Python实现 -【明明的随机数】 2023Q1A - 2

    华为OD机试题本篇题目:明明的随机数题目输入描述输出描述:示例1输入输出说明代码编写思路最近更新的博客华为od2023|什么是华为od,od薪资待遇,od机试题清单华为OD机试真题大全,用Python解华为机试题|机试宝典【华为OD机试】全流程解析+经验分享,题型分享,防作弊指南华为o

  5. python - 如何读取 MIDI 文件、更改其乐器并将其写回? - 2

    我想解析一个已经存在的.mid文件,改变它的乐器,例如从“acousticgrandpiano”到“violin”,然后将它保存回去或作为另一个.mid文件。根据我在文档中看到的内容,该乐器通过program_change或patch_change指令进行了更改,但我找不到任何在已经存在的MIDI文件中执行此操作的库.他们似乎都只支持从头开始创建的MIDI文件。 最佳答案 MIDIpackage会为您完成此操作,但具体方法取决于midi文件的原始内容。一个MIDI文件由一个或多个音轨组成,每个音轨是十六个channel中任何一个上的

  6. 「Python|Selenium|场景案例」如何定位iframe中的元素? - 2

    本文主要介绍在使用Selenium进行自动化测试或者任务时,对于使用了iframe的页面,如何定位iframe中的元素文章目录场景描述解决方案具体代码场景描述当我们在使用Selenium进行自动化测试的时候,可能会遇到一些界面或者窗体是使用HTML的iframe标签进行承载的。对于iframe中的标签,如果直接查找是无法找到的,会抛出没有找到元素的异常。比如近在咫尺的例子就是,CSDN的登录窗体就是使用的iframe,大家可以尝试通过F12开发者模式查看到的tag_name,class_name,id或者xpath来定位中的页面元素,会抛出NoSuchElementException异常。解决

  7. python ffmpeg 使用 pyav 转换 一组图像 到 视频 - 2

    2022/8/4更新支持加入水印水印必须包含透明图像,并且水印图像大小要等于原图像的大小pythonconvert_image_to_video.py-f30-mwatermark.pngim_dirout.mkv2022/6/21更新让命令行参数更加易用新的命令行使用方法pythonconvert_image_to_video.py-f30im_dirout.mkvFFMPEG命令行转换一组JPG图像到视频时,是将这组图像视为MJPG流。我需要转换一组PNG图像到视频,FFMPEG就不认了。pyav内置了ffmpeg库,不需要系统带有ffmpeg工具因此我使用ffmpeg的python包装p

  8. Python 刷Leetcode题库,顺带学英语单词(31) - 2

    ValidPalindromeGivenastring,determineifitisapalindrome,consideringonlyalphanumericcharactersandignoringcases. [#125]Example:"Aman,aplan,acanal:Panama"isapalindrome."raceacar"isnotapalindrome.Haveyouconsiderthatthestringmightbeempty?Thisisagoodquestiontoaskduringaninterview.Forthepurposeofthisproblem

  9. python - 是否可以使用 Ruby 或 Python 禁用 anchor /引用来发出有效的 YAML? - 2

    是否可以在PyYAML或Ruby的Psych引擎中禁用创建anchor和引用(并有效地显式列出冗余数据)?也许我在网上搜索时遗漏了一些东西,但在Psych中似乎没有太多可用的选项,而且我也无法确定PyYAML是否允许这样做.基本原理是我必须序列化一些数据并将其以可读的形式传递给一个不是真正的技术同事进行手动验证。有些数据是多余的,但我需要以最明确的方式列出它们以提高可读性(anchor和引用是提高效率的好概念,但不是人类可读性)。Ruby和Python是我选择的工具,但如果有其他一些相当简单的方法来“展开”YAML文档,它可能就可以了。 最佳答案

  10. .net - .NET 将如何影响 Python 和 Ruby 应用程序? - 2

    我很好奇.NET将如何影响Python和Ruby应用程序。用IronPython/IronRuby编写的应用程序是否会非常特定于.NET环境,以至于它们实际上将变得特定于平台?如果他们不使用任何.NET功能,那么IronPython/IronRuby相对于非.NET同类产品的优势是什么? 最佳答案 我不能说任何关于IronRuby的东西,但是大多数Python实现(如IronPython、Jython和PyPy)都试图尽可能忠实于CPython实现。不过,IronPython正在迅速成为这方面的佼佼者之一,并且在PlanetPyth

随机推荐