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R中进行parallel并行运算

嘿嘿嘿嘿哈 2023-10-09 原文

R语言的内置并行包parallel，可以进行多线程调用。其使用方法类似于apply家族函数，常用parApply parLapply parSaplly等函数，使用方法如下：


library(parallel) #并行计算  常用parApply parLapply parSaplly

detectCores() #检测计算机核心数

cl <- makeCluster(16) #指定调用的核心数

efflen <- parLapply(cl,exon_bygeneid,function(x){

      tmp <- apply(x,1,function(y){  y[1]:y[2]  }) #输出exon长度值所有元素           

      length(unique(unlist(tmp))) #去重复并统计exon长度元素的数量

    })

#stopCluster(cl) #停止多核计算功能

#要注意使用时par内不能再嵌套par

中进parallelsection心数parLapply

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