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如何有效地对 spark 数据集中的每 k 行进行分组?

codeneng 2023-03-28 原文

How to efficiently group every k rows in spark dataset?

我创建了一个 spark Dataset[Row],Row 是 Row(x: Vector)。 x 这里是一个 1xp 向量。

是否可以 1) 每 k 行分组 2) 将这些行连接成一个 k x p 矩阵 - mX 即,将 Dateset[Row(Vector)] 更改为 Dateset[Row(Matrix)] ?

这是我目前的解决方案,将此 Dataset[Row] 转换为 RDD,并使用 zipWithIndex 和 aggregateByKey 连接每 k 行。

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val dataRDD = data_df.rdd.zipWithIndex
    .map {  case (line, index) =>  (index/k, line) }
    .aggregateByKey(...) (..., ...)

但是好像效率不是很高,有没有更高效的方法呢?

提前致谢。


您的方法存在两个性能问题:

  • 使用全局排序
  • 进行洗牌以构建 k 的组
  • 如果您绝对需要全局排序,从第 1 行开始,并且您不能将数据分成多个分区,那么 Spark 必须通过单个核心移动所有数据。您可以通过找到一种拥有多个分区的方法来加快该部分的速度。

    您可以通过使用 mapPartitions:

    一次处理一个分区的数据来避免洗牌

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    spark.range(1, 20).coalesce(1).mapPartitions(_.grouped(5)).show

    +--------------------+
    |               value|
    +--------------------+
    |     [1, 2, 3, 4, 5]|
    |    [6, 7, 8, 9, 10]|
    |[11, 12, 13, 14, 15]|
    |    [16, 17, 18, 19]|
    +--------------------+

    请注意,上面的 coalesce(1) 将所有 20 行强制为一个分区。

    • 嗨,西姆,谢谢你的评论。我实际上不需要全球订购。 k 组也不必要地需要改组。我将 rdd.repartition(...).mapPartitions(_.grouped(5)) 应用于我的代码以避免全局分组。我只是想知道上面的代码是否会发生两次改组?即,一个用于重新分区,另一个用于 mapPartiion。
    • repartition() 会随机播放,mapPartitions() 不会。但是,除非您需要分发数据,否则您不需要 repartition()coalesce() 不会随机播放。


    这是一个将 N 条记录分组为列的解决方案:

    从RDD生成到DF,如下图处理。

    g 是组,k 是记录 g 内重复的编号的关键。 v 是您的记录内容。

    输入是一个 6 行的文件,我在这里使用了 3 组。

    唯一的缺点是行的余数小于分组 N。

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    import org.apache.spark.sql.functions._
    import org.apache.spark.mllib.rdd.RDDFunctions._

    val dfsFilename ="/FileStore/tables/7dxa9btd1477497663691/Text_File_01-880f5.txt"
    val readFileRDD = spark.sparkContext.textFile(dfsFilename)
    val rdd2 = readFileRDD.sliding(3,3).zipWithIndex
    val rdd3 = rdd2.map(r => (r._1.zipWithIndex, r._2))
    val df = rdd3.toDF("vk","g")

    val df2 = df.withColumn("vke", explode($"vk")).drop("vk")
    val df3 = df2.withColumn("k", $"vke._2").withColumn("v", $"vke._1").drop("vke")

    val result = df3
                .groupBy("g")
                .pivot("k")
                .agg(expr("first(v)"))

    result.show()

    返回:

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    +---+--------------------+--------------------+--------------------+
    |  g|                   0|                   1|                   2|
    +---+--------------------+--------------------+--------------------+
    |  0|The quick brown f...|Here he lays I te...|Gone are the days...|
    |  1|  Gosh, what to say.|Hallo, hallo, how...|          I am fine.|
    +---+--------------------+--------------------+--------------------+

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