我正在尝试过滤/平滑从采样频率为 50 kHz 的压力传感器获得的信号。示例信号如下所示:
我想在MATLAB中得到一个loess得到的平滑信号(我画的不是同一个数据,数值不同)。
我使用 matplotlib 的 psd() 函数计算了功率谱密度,下面还提供了功率谱密度:
我已经尝试使用以下代码并获得了过滤后的信号:
import csv
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import scipy as sp
from scipy.signal import butter, lfilter, freqz
def butter_lowpass(cutoff, fs, order=5):
nyq = 0.5 * fs
normal_cutoff = cutoff / nyq
b, a = butter(order, normal_cutoff, btype='low', analog=False)
return b, a
def butter_lowpass_filter(data, cutoff, fs, order=5):
b, a = butter_lowpass(cutoff, fs, order=order)
y = lfilter(b, a, data)
return y
data = np.loadtxt('data.dat', skiprows=2, delimiter=',', unpack=True).transpose()
time = data[:,0]
pressure = data[:,1]
cutoff = 2000
fs = 50000
pressure_smooth = butter_lowpass_filter(pressure, cutoff, fs)
figure_pressure_trace = plt.figure(figsize=(5.15, 5.15))
figure_pressure_trace.clf()
plot_P_vs_t = plt.subplot(111)
plot_P_vs_t.plot(time, pressure, linewidth=1.0)
plot_P_vs_t.plot(time, pressure_smooth, linewidth=1.0)
plot_P_vs_t.set_ylabel('Pressure (bar)', labelpad=6)
plot_P_vs_t.set_xlabel('Time (ms)', labelpad=6)
plt.show()
plt.close()
我得到的输出是:
我需要更多的平滑,我尝试改变截止频率但仍然无法获得满意的结果。我无法通过 MATLAB 获得相同的平滑度。我确信它可以在 Python 中完成,但是怎么做呢?
您可以找到数据here .
更新
我从 statsmodels 应用了 lowess 平滑,这也不能提供令人满意的结果。
最佳答案
这里有几个建议。
首先,使用 it=0 尝试 statsmodels 中的 lowess 函数,并调整 frac 参数 a位:
In [328]: from statsmodels.nonparametric.smoothers_lowess import lowess
In [329]: filtered = lowess(pressure, time, is_sorted=True, frac=0.025, it=0)
In [330]: plot(time, pressure, 'r')
Out[330]: [<matplotlib.lines.Line2D at 0x1178d0668>]
In [331]: plot(filtered[:,0], filtered[:,1], 'b')
Out[331]: [<matplotlib.lines.Line2D at 0x1173d4550>]
第二个建议是使用 scipy.signal.filtfilt而不是 lfilter 来应用 Butterworth 过滤器。 filtfilt 是 forward-backward 过滤器。它应用滤波器两次,一次向前,一次向后,导致零相位延迟。
这是您的脚本的修改版本。显着的变化是使用 filtfilt 而不是 lfilter,以及将 cutoff 从 3000 更改为 1500。您可能想尝试一下参数--较高的值可以更好地跟踪压力增加的开始,但过高的值不会过滤掉压力增加后的 3kHz(大约)振荡。
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from scipy.signal import butter, filtfilt
def butter_lowpass(cutoff, fs, order=5):
nyq = 0.5 * fs
normal_cutoff = cutoff / nyq
b, a = butter(order, normal_cutoff, btype='low', analog=False)
return b, a
def butter_lowpass_filtfilt(data, cutoff, fs, order=5):
b, a = butter_lowpass(cutoff, fs, order=order)
y = filtfilt(b, a, data)
return y
data = np.loadtxt('data.dat', skiprows=2, delimiter=',', unpack=True).transpose()
time = data[:,0]
pressure = data[:,1]
cutoff = 1500
fs = 50000
pressure_smooth = butter_lowpass_filtfilt(pressure, cutoff, fs)
figure_pressure_trace = plt.figure()
figure_pressure_trace.clf()
plot_P_vs_t = plt.subplot(111)
plot_P_vs_t.plot(time, pressure, 'r', linewidth=1.0)
plot_P_vs_t.plot(time, pressure_smooth, 'b', linewidth=1.0)
plt.show()
plt.close()
这是结果图。注意右边缘的滤波信号的偏差。为了解决这个问题,你可以试验 filtfilt 的 padtype 和 padlen 参数,或者,如果你知道你有足够的数据,你可以丢弃滤波信号的边缘。
关于python - 如何使用 SciPy/Numpy 过滤/平滑?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/28536191/
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