我正在处理以加法模型为中心的 CPU 密集型机器学习问题。由于加法是主要操作,我可以将输入数据分成几部分并生成多个模型,然后通过覆盖的 __add__ 方法合并这些模型。
与多处理相关的代码如下所示:
def pool_worker(filename, doshuffle):
print(f"Processing file: {filename}")
with open(filename, 'r') as f:
partial = FragmentModel(order=args.order, indata=f, shuffle=doshuffle)
return partial
def generateModel(is_mock=False, save=True):
model = None
with ThreadPool(args.nthreads) as pool:
from functools import partial
partial_models = pool.imap_unordered(partial(pool_worker, doshuffle=is_mock), args.input)
i = 0
for m in partial_models:
logger.info(f'Starting to merge model {i}')
if model is None:
import copy
model = copy.deepcopy(m)
else:
model += m
logger.info(f'Done merging...')
i += 1
return model
问题在于,随着模型阶数的增加,内存消耗呈指数级增长,因此在阶数为 4 时,模型的每个实例大约为 4-5 GB,这会导致线程池崩溃,因为中间模型对象不可 pickle。
我读了一点,看起来即使酸洗不是问题,像这样传递数据仍然非常低效,如对 this answer 的评论.
但是,关于如何为此目的使用共享内存的指南很少。是否可以在不必更改模型对象的内部结构的情况下避免此问题?
最佳答案
从 Python 3.8 开始,有 multiprocessing.shared_memory这使得进程之间可以直接共享内存,类似于 C 或 Java 中的“真正的”多线程。直接内存共享比通过文件、套接字或数据复制序列化/反序列化共享要快得多。
它的工作原理是提供一个共享内存缓冲区,不同的进程可以在该缓冲区上通过基本的 SharedMemory 声明和声明变量。类实例或更高级的 SharedMemoryManager类实例。使用内置的 ShareableList 可以方便地声明基本 python 数据类型的变量. numpy.ndarray等高级数据类型的变量可以通过在声明时指定内存缓冲区来共享。
numpy.ndarray 示例:
import numpy as np
from multiprocessing import shared_memory
# setting up
data = [0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9]
d_shape = (len(data),)
d_type = np.int64
d_size = np.dtype(d_type).itemsize * np.prod(d_shape)
# IN THE MAIN PROCESS
# allocate new shared memory
shm = shared_memory.SharedMemory(create=True, size=d_size)
shm_name = shm.name
# numpy array on shared memory buffer
a = np.ndarray(shape=d_shape, dtype=d_type, buffer=shm.buf)
# copy data into shared memory ndarray once
a[:] = data[:]
# IN ANOTHER PROCESS
# reuse existing shared memory
ex_shm = shared_memory.SharedMemory(name=shm_name)
# numpy array b uses the same memory buffer as a
b = np.ndarray(shape=d_shape, dtype=d_type, buffer=ex_shm.buf)
# changes in b will be reflected in a and vice versa...
ex_shm.close() # close after using
# IN THE MAIN PROCESS
shm.close() # close after using
shm.unlink() # free memory
在上面的代码中,a 和b 数组使用相同的底层内存并且可以直接更新相同的内存,这在机器学习中非常有用。但是,您应该注意并发更新问题并决定如何处理它们,使用 Lock/partitioned accesses/或接受随机更新(所谓的 HogWild 风格)。
关于python - 如何使用共享内存而不是通过多个进程之间的酸洗来传递对象,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/53616039/
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