草庐IT

python - 不应打开任何文件时 PyTorch 的数据加载器 "too many open files"错误

coder 2023-08-16 原文

所以这是说明问题的最小代码:

这是数据集:

class IceShipDataset(Dataset):
    BAND1='band_1'
    BAND2='band_2'
    IMAGE='image'

    @staticmethod
    def get_band_img(sample,band):
        pic_size=75
        img=np.array(sample[band])
        img.resize(pic_size,pic_size)
        return img

    def __init__(self,data,transform=None):
        self.data=data
        self.transform=transform

    def __len__(self):
        return len(self.data)  

    def __getitem__(self, idx):

        sample=self.data[idx]
        band1_img=IceShipDataset.get_band_img(sample,self.BAND1)
        band2_img=IceShipDataset.get_band_img(sample,self.BAND2)
        img=np.stack([band1_img,band2_img],2)
        sample[self.IMAGE]=img
        if self.transform is not None:
                sample=self.transform(sample)
        return sample

这是失败的代码:

PLAY_BATCH_SIZE=4
#load data. There are 1604 examples.
with open('train.json','r') as f:
        data=f.read()
data=json.loads(data)

ds=IceShipDataset(data)
playloader = torch.utils.data.DataLoader(ds, batch_size=PLAY_BATCH_SIZE,
                                          shuffle=False, num_workers=4)
for i,data in enumerate(playloader):
        print(i)

它在 for 循环中给出了奇怪的打开文件错误…… 我的手电筒版本是0.3.0.post4

如果你想要 json 文件，可以在 Kaggle ( https://www.kaggle.com/c/statoil-iceberg-classifier-challenge ) 获得

我应该提一下，这个错误与我笔记本电脑的状态无关:

yoni@yoni-Lenovo-Z710:~$ lsof | wc -l
89114
yoni@yoni-Lenovo-Z710:~$ cat /proc/sys/fs/file-max
791958

我在这里做错了什么？

最佳答案

我知道如何修复错误，但我没有完整的解释为什么会发生。

首先，解决方案:您需要确保图像数据存储为numpy.array s，当你调用json.loads它将它们加载为 python list的 float秒。这会导致 torch.utils.data.DataLoader将列表中的每个 float 单独转换为 torch.DoubleTensor .

看看default_collate在torch.utils.data.DataLoader - 你的__getitem__返回 dict这是一个映射，所以 default_collate在 dict 的每个元素上再次调用.第一对是int s，但是你得到的图像数据是 list ，即 collections.Sequence - 这是事情变得时髦的地方 default_collate在列表的每个元素上调用。这显然不是您想要的。我不知道 torch 中的假设是什么关于一个list的内容与 numpy.array , 但鉴于错误，该假设似乎被违反了。

修复非常简单，只需确保两个图像波段为 numpy.array s，例如 __init__ 

def __init__(self,data,transform=None):
    self.data=[]
    for d in data:
        d[self.BAND1] = np.asarray(d[self.BAND1])
        d[self.BAND2] = np.asarray(d[self.BAND2])
        self.data.append(d)
    self.transform=transform

或者在您加载 json 之后，无论您在何处执行操作都无关紧要，只要您执行即可。

为什么上面的结果是too many open files ？

我不知道，但正如评论所指出的，这很可能与进程间通信有关，并且两个队列上的锁定文件数据是从中获取和添加的。

脚注:train.json由于比赛仍在进行中(？？)，无法从 Kaggle 下载。我制作了一个应该具有相同结构的虚拟 json 文件，并测试了对该虚拟文件的修复。

关于python - 不应打开任何文件时 PyTorch 的数据加载器 "too many open files"错误，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/48250053/

ampPyTorchcodeselfdatapythonpython-3.x

有关python - 不应打开任何文件时 PyTorch 的数据加载器 "too many open files"错误的更多相关文章

  1. ruby - 使用 RubyZip 生成 ZIP 文件时设置压缩级别 - 2

    我有一个Ruby程序，它使用rubyzip压缩XML文件的目录树。gem。我的问题是文件开始变得很重，我想提高压缩级别，因为压缩时间不是问题。我在rubyzipdocumentation中找不到一种为创建的ZIP文件指定压缩级别的方法。有人知道如何更改此设置吗？是否有另一个允许指定压缩级别的Ruby库？ 最佳答案 这是我通过查看ruby​​zip内部创建的代码。level=Zlib::BEST_COMPRESSIONZip::ZipOutputStream.open(zip_file)do|zip|Dir.glob("**/*")d

  2. ruby - 其他文件中的 Rake 任务 - 2

    我试图在一个项目中使用rake，如果我把所有东西都放到Rakefile中，它会很大并且很难读取/找到东西，所以我试着将每个命名空间放在lib/rake中它自己的文件中，我添加了这个到我的rake文件的顶部:Dir['#{File.dirname(__FILE__)}/lib/rake/*.rake'].map{|f|requiref}它加载文件没问题，但没有任务。我现在只有一个.rake文件作为测试，名为“servers.rake”，它看起来像这样:namespace:serverdotask:testdoputs"test"endend所以当我运行rakeserver:testid时

  3. ruby-on-rails - 在 Rails 中将文件大小字符串转换为等效千字节 - 2

    我的目标是转换表单输入，例如“100兆字节”或“1GB”，并将其转换为我可以存储在数据库中的文件大小(以千字节为单位)。目前，我有这个:defquota_convert@regex=/([0-9]+)(.*)s/@sizes=%w{kilobytemegabytegigabyte}m=self.quota.match(@regex)if@sizes.include?m[2]eval("self.quota=#{m[1]}.#{m[2]}")endend这有效，但前提是输入是倍数(“gigabytes”，而不是“gigabyte”)并且由于使用了eval看起来疯狂不安全。所以，功能正常，

  4. python - 如何使用 Ruby 或 Python 创建一系列高音调和低音调的蜂鸣声？ - 2

    关闭。这个问题是opinion-based.它目前不接受答案。想要改进这个问题？更新问题，以便editingthispost可以用事实和引用来回答它.关闭4年前。Improvethisquestion我想在固定时间创建一系列低音和高音调的哔哔声。例如:在150毫秒时发出高音调的蜂鸣声在151毫秒时发出低音调的蜂鸣声200毫秒时发出低音调的蜂鸣声250毫秒的高音调蜂鸣声有没有办法在Ruby或Python中做到这一点？我真的不在乎输出编码是什么(.wav、.mp3、.ogg等等)，但我确实想创建一个输出文件。

  5. ruby-on-rails - rails : "missing partial" when calling 'render' in RSpec test - 2

    我正在尝试测试是否存在表单。我是Rails新手。我的new.html.erb_spec.rb文件的内容是:require'spec_helper'describe"messages/new.html.erb"doit"shouldrendertheform"dorender'/messages/new.html.erb'reponse.shouldhave_form_putting_to(@message)with_submit_buttonendendView本身，new.html.erb，有代码:当我运行rspec时，它失败了:1)messages/new.html.erbshou

  6. ruby-on-rails - 由于 "wkhtmltopdf"，PDFKIT 显然无法正常工作 - 2

    我在从html页面生成PDF时遇到问题。我正在使用PDFkit。在安装它的过程中，我注意到我需要wkhtmltopdf。所以我也安装了它。我做了PDFkit的文档所说的一切......现在我在尝试加载PDF时遇到了这个错误。这里是错误:commandfailed:"/usr/local/bin/wkhtmltopdf""--margin-right""0.75in""--page-size""Letter""--margin-top""0.75in""--margin-bottom""0.75in""--encoding""UTF-8""--margin-left""0.75in""-

  7. ruby-on-rails - Rails 3 中的多个路由文件 - 2

    Rails2.3可以选择随时使用RouteSet#add_configuration_file添加更多路由。是否可以在Rails3项目中做同样的事情？ 最佳答案 在config/application.rb中:config.paths.config.routes在Rails3.2(也可能是Rails3.1)中，使用:config.paths["config/routes"] 关于ruby-on-rails-Rails3中的多个路由文件，我们在StackOverflow上找到一个类似的问题

  8. ruby - 将差异补丁应用于字符串/文件 - 2

    对于具有离线功能的智能手机应用程序，我正在为Xml文件创建单向文本同步。我希望我的服务器将增量/差异(例如GNU差异补丁)发送到目标设备。这是计划:Time=0Server:hasversion_1ofXmlfile(~800kiB)Client:hasversion_1ofXmlfile(~800kiB)Time=1Server:hasversion_1andversion_2ofXmlfile(each~800kiB)computesdeltaoftheseversions(=patch)(~10kiB)sendspatchtoClient(~10kiBtransferred)Cl

  9. ruby - 如何将脚本文件的末尾读取为数据文件(Perl 或任何其他语言) - 2

    我正在寻找执行以下操作的正确语法(在Perl、Shell或Ruby中):#variabletoaccessthedatalinesappendedasafileEND_OF_SCRIPT_MARKERrawdatastartshereanditcontinues. 最佳答案 Perl用__DATA__做这个:#!/usr/bin/perlusestrict;usewarnings;while(){print;}__DATA__Texttoprintgoeshere 关于ruby-如何将脚

  10. ruby - 使用 Vim Rails，您可以创建一个新的迁移文件并一次性打开它吗？ - 2

    使用带有Rails插件的vim，您可以创建一个迁移文件，然后一次性打开该文件吗？textmate也可以这样吗？ 最佳答案 你可以使用rails.vim然后做类似的事情::Rgeneratemigratonadd_foo_to_bar插件将打开迁移生成的文件，这正是您想要的。我不能代表textmate。 关于ruby-使用VimRails，您可以创建一个新的迁移文件并一次性打开它吗？，我们在StackOverflow上找到一个类似的问题： https://sta

随机推荐