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python - scipy.io.loadmat 嵌套结构(即字典)

coder 2023-05-23 原文

使用给定的例程(如何使用 scipy 加载 Matlab .mat 文件)，我无法访问更深层的嵌套结构以将它们恢复到字典中

为了更详细地介绍我遇到的问题，我给出了以下玩具示例:

load scipy.io as spio
a = {'b':{'c':{'d': 3}}}
# my dictionary: a['b']['c']['d'] = 3
spio.savemat('xy.mat',a)

现在我想将 mat-File 读回 python。我尝试了以下方法:

vig=spio.loadmat('xy.mat',squeeze_me=True)

如果我现在想访问我得到的字段:

>> vig['b']
array(((array(3),),), dtype=[('c', '|O8')])
>> vig['b']['c']
array(array((3,), dtype=[('d', '|O8')]), dtype=object)
>> vig['b']['c']['d']
---------------------------------------------------------------------------
ValueError                                Traceback (most recent call last)

/<ipython console> in <module>()

ValueError: field named d not found.

但是，通过使用选项 struct_as_record=False 可以访问该字段:

v=spio.loadmat('xy.mat',squeeze_me=True,struct_as_record=False)

现在可以通过

>> v['b'].c.d
array(3)

最佳答案

这里是重建字典的函数，只使用这个 loadmat 而不是 scipy.io 的 loadmat:

import scipy.io as spio

def loadmat(filename):
    '''
    this function should be called instead of direct spio.loadmat
    as it cures the problem of not properly recovering python dictionaries
    from mat files. It calls the function check keys to cure all entries
    which are still mat-objects
    '''
    data = spio.loadmat(filename, struct_as_record=False, squeeze_me=True)
    return _check_keys(data)

def _check_keys(dict):
    '''
    checks if entries in dictionary are mat-objects. If yes
    todict is called to change them to nested dictionaries
    '''
    for key in dict:
        if isinstance(dict[key], spio.matlab.mio5_params.mat_struct):
            dict[key] = _todict(dict[key])
    return dict        

def _todict(matobj):
    '''
    A recursive function which constructs from matobjects nested dictionaries
    '''
    dict = {}
    for strg in matobj._fieldnames:
        elem = matobj.__dict__[strg]
        if isinstance(elem, spio.matlab.mio5_params.mat_struct):
            dict[strg] = _todict(elem)
        else:
            dict[strg] = elem
    return dict

关于python - scipy.io.loadmat 嵌套结构(即字典)，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/7008608/

loadmatpython39codesectionnestedstructurescipydictionary

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