我已经实现了基于 MapReduce 范例的 local clustering coefficient algorithm .但是,对于更大的数据集或特定的数据集(节点的平均度数高),我遇到了严重的麻烦。我试图调整我的 hadoop 平台和代码,但结果并不令人满意(至少可以这么说)。不,我已经将注意力转移到实际更改/改进算法上。下面是我目前的算法(伪代码)
foreach(Node in Graph) {
//Job1
/* Transform edge-based input dataset to node-based dataset */
//Job2
map() {
emit(this.Node, this.Node.neighbours) //emit myself data to all my neighbours
emit(this.Node, this.Node) //emit myself to myself
}
reduce() {
NodeNeighbourhood nodeNeighbourhood;
while(values.hasNext) {
if(myself)
this.nodeNeighbourhood.setCentralNode(values.next) //store myself data
else
this.nodeNeighbourhood.addNeighbour(values.next) //store neighbour data
}
emit(null, this.nodeNeighbourhood)
}
//Job3
map() {
float lcc = calculateLocalCC(this.nodeNeighbourhood)
emit(0, lcc) //emit all lcc to specific key, combiners are used
}
reduce() {
float combinedLCC;
int numberOfNodes;
while(values.hasNext) {
combinedLCC += values.next;
}
emit(null, combinedLCC/numberOfNodes); // store graph average local clustering coefficient
}
}
关于代码的更多细节。对于有向图,邻居数据仅限于节点 ID 和 OUT 边目标 ID(以减小数据大小),对于无向图,它的节点 ID 和边目标 ID 也是如此。排序和合并缓冲区增加到 1.5 Gb,合并流 80。
可以明显看出Job2是整个算法的实际问题。它会生成大量需要排序/复制/合并的数据。这基本上会破坏某些数据集的算法性能。有人可以指导我如何改进算法(我正在考虑创建一个迭代 Job2 [在每次迭代中“处理”只有 N 个节点中的 M 个节点,直到每个节点都被“处理”],但我现在已经放弃了这个想法) .在我看来,Job2 映射输出应该减少,以避免代价高昂的排序/合并过程,这会降低性能。
我也为 Giraph 平台实现了相同的算法(同样是 3 个作业,相同的“通信”模式,还有“Job2”问题)。然而,Giraph 是一个内存平台,针对相同“有问题”的数据集的算法会导致 OutOfMemoryException。
对于任何评论、评论、指南,我将不胜感激。
更新
我将“彻底”改变算法。我找到了这篇文章 Counting Triangles .
代码实现后,我将在这里发表我的意见和更详细的代码(如果这种方法会成功的话)。
UPDATE_2
最后,我根据自己的需要“修改”了 NodeIterator++ 算法(Yahoo 论文可通过文章中的链接获得)。不幸的是,虽然我可以看到性能有所提高,但最终结果并不像我希望的那样好。我得出的结论是,我可用的集群太小,无法使 LCC 计算对这些特定数据集可行。所以问题仍然存在,或者更确切地说,它在演变。有谁知道一种有效的分布式/顺序算法来计算可用资源有限的 LCC 或三角形? (我绝不是说 NodeIterator++ 算法不好,我只是说我可用的资源还不够)。
最佳答案
在论文“用于大规模图算法的 MPI 中的 MapReduce”中,作者很好地描述了三角计数的 MapReduce 实现。该论文可在此处获得:http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0167819111000172但您可能需要一个帐户才能访问该论文。 (我使用的是付费订阅的大学系统,所以我永远不知道我只能访问什么,因为他们已经付费了。)作者可能会在个人网站上发布论文草稿。
还有另一种计算三角形的方法——除非您的图形相当密集,否则效率可能要低得多。首先,构建图形的邻接矩阵 A。然后计算 A^3(您可以很容易地并行执行矩阵乘法)。然后,将 A^3 的 (i,i) 个条目相加并将答案除以 6。这将为您提供三角形的数量,因为 A^k 的 i,j 条目计算从 i 走的长度 k 的数量到 j 并且因为我们只看长度为 3 的步行,任何从 i 开始并在 3 步后以 i 结束的步行都是三角形......多算了 6 倍。这主要是效率较低,因为矩阵的大小如果您的图形是稀疏的,则与边缘列表的大小相比将非常大。
关于performance - 分布式局部聚类系数算法(MapReduce/Hadoop),我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/10968084/
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1.1.1 YARN的介绍 为克服Hadoop1.0中HDFS和MapReduce存在的各种问题⽽提出的,针对Hadoop1.0中的MapReduce在扩展性和多框架⽀持⽅⾯的不⾜,提出了全新的资源管理框架YARN. ApacheYARN(YetanotherResourceNegotiator的缩写)是Hadoop集群的资源管理系统,负责为计算程序提供服务器计算资源,相当于⼀个分布式的操作系统平台,⽽MapReduce等计算程序则相当于运⾏于操作系统之上的应⽤程序。 YARN被引⼊Hadoop2,最初是为了改善MapReduce的实现,但是因为具有⾜够的通⽤性,同样可以⽀持其他的分布式计算模
如thisquestion,当在其自己的赋值中使用未定义的局部变量时,它的计算结果为nil。x=x#=>nil但是当局部变量的名称与现有的方法名称冲突时,就比较棘手了。为什么下面的最后一个示例返回nil?{}.instance_eval{a=keys}#=>[]{}.instance_eval{keys=self.keys}#=>[]{}.instance_eval{keys=keys}#=>nil 最佳答案 在Ruby中,因为可以在没有显式接收器和括号的情况下调用方法,所以在局部变量引用和无接收器无参数方法调用之间存在语法歧义:f
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我正在尝试完成本教程:http://guides.rubyonrails.org/getting_started.html#say-hello-rails但是我遇到了一个错误:我有下一个错误:undefinedlocalvariableormethod`articles_path'for#:0x4661d30>Extractedsource(aroundline#1):rake路线:PrefixVerbURIPatternController#Actionwelcome_indexGET/welcome/index(.:format)welcome#indexarticles_newG
这个问题在这里已经有了答案:Inrubyhowtouseclasslevellocalvariable?(arubynewbie'squestion)(4个答案)关闭6年前。我注意到以下代码在语法上是正确的:classFoobar=3end现在,我知道实例变量由@访问,类变量由@@访问,但我不知道在哪里bar存储在这种情况下或如何访问它。如何找到bar的范围?
1.问题描述使用Python的turtle(海龟绘图)模块提供的函数绘制直线。2.问题分析一幅复杂的图形通常都可以由点、直线、三角形、矩形、平行四边形、圆、椭圆和圆弧等基本图形组成。其中的三角形、矩形、平行四边形又可以由直线组成,而直线又是由两个点确定的。我们使用Python的turtle模块所提供的函数来绘制直线。在使用之前我们先介绍一下turtle模块的相关知识点。turtle模块提供面向对象和面向过程两种形式的海龟绘图基本组件。面向对象的接口类如下:1)TurtleScreen类:定义图形窗口作为绘图海龟的运动场。它的构造器需要一个tkinter.Canvas或ScrolledCanva
我有一个循环,我在远程机器上执行一系列命令:ssh.exec('cd/vmfs/volumes/4c6d95d2-b1923d5d-4dd7-f4ce46baaadc/ghettoVCB;./ghettoVCB.sh-fvms_to_backup-ddryrun')do|ch,stream,data|if#{stream}=~/vmupgrade/putsvalue_hosts+"is"+dataputs#{stream}putsdataendend我想在do-end循环之外访问#{stream}和数据如果有任何帮助,我将不胜感激。谢谢,嗨,约格,我实现了您的建议,但现在出现错误:Wr
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