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python - 破损管道错误导致 AWS 上的流式 Elastic MapReduce 作业失败

coder 2023-08-22 原文

当我执行以下操作时，在本地一切正常:

cat input | python mapper.py | sort | python reducer.py

但是，当我在 AWS Elastic Mapreduce 上运行流式 MapReduce 作业时，作业没有成功完成。 mapper.py 运行了一半(我知道这一点是因为一路上写入了 stderr)。映射器被“Broken Pipe”错误中断，我可以在它失败后从任务尝试的系统日志中检索到该错误:

java.io.IOException: Broken pipe
    at java.io.FileOutputStream.writeBytes(Native Method)
    at java.io.FileOutputStream.write(FileOutputStream.java:282)
    at java.io.BufferedOutputStream.write(BufferedOutputStream.java:105)
    at java.io.BufferedOutputStream.flushBuffer(BufferedOutputStream.java:65)
    at java.io.BufferedOutputStream.write(BufferedOutputStream.java:109)
    at java.io.DataOutputStream.write(DataOutputStream.java:90)
    at org.apache.hadoop.streaming.io.TextInputWriter.writeUTF8(TextInputWriter.java:72)
    at org.apache.hadoop.streaming.io.TextInputWriter.writeValue(TextInputWriter.java:51)
    at org.apache.hadoop.streaming.PipeMapper.map(PipeMapper.java:109)
    at org.apache.hadoop.mapred.MapRunner.run(MapRunner.java:50)
    at org.apache.hadoop.streaming.PipeMapRunner.run(PipeMapRunner.java:36)
    at org.apache.hadoop.mapred.MapTask.runOldMapper(MapTask.java:441)
    at org.apache.hadoop.mapred.MapTask.run(MapTask.java:377)
    at org.apache.hadoop.mapred.Child$4.run(Child.java:255)
    at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method)
    at javax.security.auth.Subject.doAs(Subject.java:396)
    at org.apache.hadoop.security.UserGroupInformation.doAs(UserGroupInformation.java:1059)
    at org.apache.hadoop.mapred.Child.main(Child.java:249)


2012-03-26 07:19:05,400 WARN org.apache.hadoop.streaming.PipeMapRed (main): java.io.IOException: Broken pipe
    at java.io.FileOutputStream.writeBytes(Native Method)
    at java.io.FileOutputStream.write(FileOutputStream.java:282)
    at java.io.BufferedOutputStream.write(BufferedOutputStream.java:105)
    at java.io.BufferedOutputStream.flushBuffer(BufferedOutputStream.java:65)
    at java.io.BufferedOutputStream.flush(BufferedOutputStream.java:123)
    at java.io.DataOutputStream.flush(DataOutputStream.java:106)
    at org.apache.hadoop.streaming.PipeMapRed.mapRedFinished(PipeMapRed.java:579)
    at org.apache.hadoop.streaming.PipeMapper.map(PipeMapper.java:124)
    at org.apache.hadoop.mapred.MapRunner.run(MapRunner.java:50)
    at org.apache.hadoop.streaming.PipeMapRunner.run(PipeMapRunner.java:36)
    at org.apache.hadoop.mapred.MapTask.runOldMapper(MapTask.java:441)
    at org.apache.hadoop.mapred.MapTask.run(MapTask.java:377)
    at org.apache.hadoop.mapred.Child$4.run(Child.java:255)
    at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method)
    at javax.security.auth.Subject.doAs(Subject.java:396)
    at org.apache.hadoop.security.UserGroupInformation.doAs(UserGroupInformation.java:1059)
    at org.apache.hadoop.mapred.Child.main(Child.java:249)

2012-03-26 07:19:05,400 INFO org.apache.hadoop.streaming.PipeMapRed (main): mapRedFinished
2012-03-26 07:19:05,400 WARN org.apache.hadoop.streaming.PipeMapRed (main): java.io.IOException: Bad file descriptor
    at java.io.FileOutputStream.writeBytes(Native Method)
    at java.io.FileOutputStream.write(FileOutputStream.java:282)
    at java.io.BufferedOutputStream.write(BufferedOutputStream.java:105)
    at java.io.BufferedOutputStream.flushBuffer(BufferedOutputStream.java:65)
    at java.io.BufferedOutputStream.flush(BufferedOutputStream.java:123)
    at java.io.DataOutputStream.flush(DataOutputStream.java:106)
    at org.apache.hadoop.streaming.PipeMapRed.mapRedFinished(PipeMapRed.java:579)
    at org.apache.hadoop.streaming.PipeMapper.close(PipeMapper.java:135)
    at org.apache.hadoop.mapred.MapRunner.run(MapRunner.java:57)
    at org.apache.hadoop.streaming.PipeMapRunner.run(PipeMapRunner.java:36)
    at org.apache.hadoop.mapred.MapTask.runOldMapper(MapTask.java:441)
    at org.apache.hadoop.mapred.MapTask.run(MapTask.java:377)
    at org.apache.hadoop.mapred.Child$4.run(Child.java:255)
    at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method)
    at javax.security.auth.Subject.doAs(Subject.java:396)
    at org.apache.hadoop.security.UserGroupInformation.doAs(UserGroupInformation.java:1059)
    at org.apache.hadoop.mapred.Child.main(Child.java:249)

2012-03-26 07:19:05,400 INFO org.apache.hadoop.streaming.PipeMapRed (main): mapRedFinished
2012-03-26 07:19:05,405 INFO org.apache.hadoop.streaming.PipeMapRed (Thread-13): MRErrorThread done
2012-03-26 07:19:05,408 INFO org.apache.hadoop.mapred.TaskLogsTruncater (main): Initializing logs' truncater with mapRetainSize=-1 and reduceRetainSize=-1
2012-03-26 07:19:05,519 INFO org.apache.hadoop.io.nativeio.NativeIO (main): Initialized cache for UID to User mapping with a cache timeout of 14400 seconds.
2012-03-26 07:19:05,520 INFO org.apache.hadoop.io.nativeio.NativeIO (main): Got UserName hadoop for UID 106 from the native implementation
2012-03-26 07:19:05,522 WARN org.apache.hadoop.mapred.Child (main): Error running child
java.io.IOException: log:null
R/W/S=7018/3/0 in:NA [rec/s] out:NA [rec/s]
minRecWrittenToEnableSkip_=9223372036854775807 LOGNAME=null
HOST=null
USER=hadoop
HADOOP_USER=null
last Hadoop input: |null|
last tool output: |text/html    1|
Date: Mon Mar 26 07:19:05 UTC 2012
java.io.IOException: Broken pipe
    at java.io.FileOutputStream.writeBytes(Native Method)
    at java.io.FileOutputStream.write(FileOutputStream.java:282)
    at java.io.BufferedOutputStream.write(BufferedOutputStream.java:105)
    at java.io.BufferedOutputStream.flushBuffer(BufferedOutputStream.java:65)
    at java.io.BufferedOutputStream.write(BufferedOutputStream.java:109)
    at java.io.DataOutputStream.write(DataOutputStream.java:90)
    at org.apache.hadoop.streaming.io.TextInputWriter.writeUTF8(TextInputWriter.java:72)
    at org.apache.hadoop.streaming.io.TextInputWriter.writeValue(TextInputWriter.java:51)
    at org.apache.hadoop.streaming.PipeMapper.map(PipeMapper.java:109)
    at org.apache.hadoop.mapred.MapRunner.run(MapRunner.java:50)
    at org.apache.hadoop.streaming.PipeMapRunner.run(PipeMapRunner.java:36)
    at org.apache.hadoop.mapred.MapTask.runOldMapper(MapTask.java:441)
    at org.apache.hadoop.mapred.MapTask.run(MapTask.java:377)
    at org.apache.hadoop.mapred.Child$4.run(Child.java:255)
    at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method)
    at javax.security.auth.Subject.doAs(Subject.java:396)
    at org.apache.hadoop.security.UserGroupInformation.doAs(UserGroupInformation.java:1059)
    at org.apache.hadoop.mapred.Child.main(Child.java:249)


    at org.apache.hadoop.streaming.PipeMapper.map(PipeMapper.java:125)
    at org.apache.hadoop.mapred.MapRunner.run(MapRunner.java:50)
    at org.apache.hadoop.streaming.PipeMapRunner.run(PipeMapRunner.java:36)
    at org.apache.hadoop.mapred.MapTask.runOldMapper(MapTask.java:441)
    at org.apache.hadoop.mapred.MapTask.run(MapTask.java:377)
    at org.apache.hadoop.mapred.Child$4.run(Child.java:255)
    at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method)
    at javax.security.auth.Subject.doAs(Subject.java:396)
    at org.apache.hadoop.security.UserGroupInformation.doAs(UserGroupInformation.java:1059)
    at org.apache.hadoop.mapred.Child.main(Child.java:249)
2012-03-26 07:19:05,525 INFO org.apache.hadoop.mapred.Task (main): Runnning cleanup for the task
2012-03-26 07:19:05,526 INFO org.apache.hadoop.mapred.DirectFileOutputCommitter (main): Nothing to clean up on abort since there are no temporary files written

这里是mapper.py。请注意，我写信给 stderr 为自己提供调试信息:

#!/usr/bin/env python

import sys
from warc import ARCFile

def main():
    warc_file = ARCFile(fileobj=sys.stdin)
    for web_page in warc_file:
        print >> sys.stderr, '%s\t%s' % (web_page.header.content_type, 1) #For debugging
        print '%s\t%s' % (web_page.header.content_type, 1)
    print >> sys.stderr, 'done' #For debugging
if __name__ == "__main__":
    main()

这是我在运行 mapper.py 时在任务尝试的标准错误中得到的:

text/html   1
text/html   1
text/html   1

基本上，循环运行了 3 次然后突然停止而 python 没有抛出任何错误。 (注意:它应该输出数千行)。即使是未捕获的异常也应该出现在 stderr 中。

因为 MapReduce 在我的本地计算机上运行完全正常，我猜测这是 Hadoop 如何处理我从 mapper.py 打印的输出的问题。但我不知道问题出在哪里。

最佳答案

您的流式传输进程(您的 Python 脚本)提前终止。这可能是因为它认为输入是完整的(例如解释 EOF)或被吞噬的异常。无论哪种方式，Hadoop 都试图通过 STDIN 将数据输入到您的脚本中，但由于应用程序已终止(因此 STDIN 不再是有效的文件描述符)，您将收到 BrokenPipe 错误。我建议在您的脚本中添加 stderr 跟踪以查看导致问题的输入行。快乐编码，

-杰夫

关于python - 破损管道错误导致 AWS 上的流式 Elastic MapReduce 作业失败，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/9881269/

流式破损javahadoopapachepythonamazon-web-servicesmapreduceelastic-map-reduce

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