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生信log34|dbNSFP的phyloP30_score的来源-以提取hg38_phyloP30way.bw(bigwig)数据为例

dbNSFP数据库收录了PhyloP值的数据,并且是tsv格式的,为了对一下数据库,就去官网找了相关的数据,但是看了一圈并没有现成的tsv。看了一圈资料也没看出怎么得出dbNSFP里面的phyloP这个唯一值怎么来的。后面尝试了很多,才发现原来如此简单:就是把官网上的bw文件转成bedGraph文件即可,但是这个做法会把7.9G的数据拓展至50G左右,转换数据需慎重。1、工具准备及其用法下载ucsc上的工具bigWigToBedGraph(转换bigwig到bedGraphformat)下载bigWigToWig(非必需)#bigWigToBedGraphwgethttps://hgdownl

swift 3.0 : What is the neatest way to tackle this scenario with enums?

比如说,我有一堆对象。我想根据形状或颜色过滤它们。形状可以是正方形或三角形enumShape{caseSquare,Triangle}颜色可能是红色或绿色enumColor{caseRed,Green}我想要的是一个如下的方法,它接受一个过滤器数组,可以是Shape或Color,或者两者兼而有之。funcapply(_filters:[Filter]){forfilterinfilters{ifit'saShapefilter,applythatifit'saColorfilter,applythat}}然后我可以按如下方式填充数组并将其传递给上面的方法:letfilters=[Sha

swift - 基本 : Connecting multiple (View-)Controllers the right way

我正在尝试设置一个登录屏幕(ViewController),它会在成功登录后引导至一个用户列表(UserTableViewController),它本身就是导航Controller。在UserTableViewController等后续屏幕上,应该可以注销。这会将用户带回到初始登录屏幕ViewController。我真的很难以正确的方式连接这些屏幕。必须要说的是,我对不同类型的转场和/或委托(delegate)没有太多经验,所以在完成一些研究后,我进行了一些试验:在ViewController上成功登录会触发导航Controller的模式转接(它本身会导致UserTableViewCo

iOS/WatchKit : Is there a way for the watch kit app(swift) to use the iOS code (Objective C)?

我考虑过使用桥接头,但我总是无法导入桥接接头。watch扩展(用swift编写)是否可以使用来自iOSApp(用ObjectiveC编写)的代码?我需要确保我这样做是正确和专业的。如果我可以使用桥接头,为什么会出现以下错误?:0:error:failedtoimportbridgingheader 最佳答案 它可能像路径问题一样简单。但我通常做的是创建一个虚拟的Objective-C文件,这样Xcode就会为我创建那个桥接header,然后我只需将路径复制并粘贴到扩展的build设置中。我已经包含了一个演示项目,该项目从桥接head

swift - 苹果操作系统 : Any way to hide window title and not toolbar item labels?

我正在尝试制作一个与Apple的MacOSAppStore非常相似的应用程序,其中窗口的标题不可见,但它有一个带有图标和标签的工具栏。问题是,当我在我的窗口Controller中将窗口的标题可见性设置为隐藏时,它也会隐藏toolbarItem标签。window?.titleVisibility=.hidden我尝试明确设置工具栏以同时显示图标和标签,但它似乎忽略了这一点。toolbar.displayMode=.iconAndLabel这是设置标题可见性和未设置标题可见性的我的应用程序的屏幕截图: 最佳答案 你可以代替self.wi

ios - swift 3 : What's the safest way to unwrap optional values coming from an array?

首先,我初始化变量以保存股票数据varapplePrice:String?vargooglePrice:String?vartwitterPrice:String?varteslaPrice:String?varsamsungPrice:String?varstockPrices=[String]()我从YQL中获取当前股票价格,并将这些值放入一个数组中funcstockFetcher(){Alamofire.request(stockUrl).responseJSON{(responseData)->Voidinif((responseData.result.value)!=nil)

swift - Swift 中的动态/运行时调度,或 "the strange way structs behave in one man' 的意见”

我对Swift和Objective-C都不是很陌生,但我今天在处理Error子类型时看到了一些奇怪的行为,这让我进行了更深入的研究。当使用NSString子类时(是的,下面的示例对于not基于NSObject的类的功能类似):importFoundation//ClassversionclassOddString:NSString{overridevardescription:String{return"Noway,José"}}letodd=OddString()funcprintIt(_string:NSString){print(string.description)}print

ios - swift 3 : best way to validate the text entered by the user in a UITextField

晚上,在我的应用程序中有几个UITextfield。每个人都必须确认不同的限制。例如,我有日期字段、邮政编码字段、SSN字段等。从我找到的Apple文档中:Assignadelegateobjecttohandleimportanttasks,suchas:Determiningwhethertheusershouldbeallowedtoeditthetextfield’scontents.Validatingthetextenteredbytheuser.Respondingtotapsinthekeyboard’sreturnbutton.Forwardingtheuser-en

swift - 从 Swift 中的大文本文件中读取行,直到新行为空 : the Swift way

我有以下文本文件结构(文本文件很大,大约100,000行):A|a1|111|111|111B|111|111|111|111A|a2|222|222|222B|222|222|222|222B|222|222|222|222A|a3|333|333|333B|333|333|333|333...我需要提取一段与给定键相关的文本。例如,如果我的key是A|a2,我需要将以下内容保存为字符串:A|a2|222|222|222B|222|222|222|222B|222|222|222|222对于我的C++和ObjectiveC项目,我使用了C++getline函数,如下所示:std::i

Java/JVM(热点): Is there a way to save JIT performance gains at compile time?

当我测量我的Java应用程序的吞吐量时,我发现随着时间的推移性能提高了50%:对于前10万条消息,我每秒收到约3,000条消息对于第二个10万条消息,我每秒收到约4,500条消息。我相信性能会随着JIT优化执行路径而提高。不保存JIT编译的原因是“JVM执行的优化不是静态的,而是动态的,基于数据模式和代码模式。很可能这些数据模式将在应用程序的生命周期内发生变化,从而导致缓存优化达不到最佳效果。”但是,我知道这些数据模式在我的应用程序生命周期内不会改变,甚至在多个应用程序生命周期内也不会改变。那么我怎样才能在HotSpotJVM中“保存”这些性能提升呢?另请参阅相关的question和d