写在前面:经常做转录组分析,就是把差异基因搞个火山图和Venn图看各组差异基因的共有和特有情况。看见有个比较好的选择,能直观比较各种处理带来的影响,如下:image.png来自Natureplants的一篇文章Ref:https://github.com/YulongNiu/MPIPZ_microbe-host_homeostasishttps://www.nature.com/articles/s41477-021-00920-2这个图很牛逼啊,表示的信息量很全,值得学习。去扒作者的代码,复现出了大部分所需文件:总的基因丰度表,即各个基因在每个样品中的丰度image.png各个样品的基因差异