HTSeq作为一款可以处理高通量数据的python包，由SimonAnders,PaulTheodorPyl,WolfgangHuber等人携手推出HTSeq—APythonframeworktoworkwithhigh-throughputsequencingdata。自发布以来就备受广大分析人员青睐，其提供了许多功能给那些熟悉python的大佬们去自信修改使用，同时也兼顾着给小白们提供了两个可以拿来可用的可执行文件htseq-count（计数）和htseq-qa（质量分析）。这里需要注意的是HTSeq作为readcounts的计数软件，承接的是上游比对软件对于cleandata给出的比对结