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GTF处理脚本 - GTFtools

image.png主要功能及示例:1)计算merged外显子合并同一个基因的所有spliceisoforms的外显子,并生成bed格式文件,可以用来计算具有多个isoforms的基因的非重叠外显子长度pythongtftools.py-mmerged_exons.beddemo.gtf2)计算independentintronspythongtftools.py-dindependent_introns.beddemo.gtf3)计算基因长度由于一个基因可能有多个isoforms,因此作者提供了4种基因长度计算方法:mean,median,max及mergedexons,其中mergedexo