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GenomeScope

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GenomeScope 2.0 评估基因组大小、杂合度和重复序列

GenomeScope是2017年发表在bioinformatic的一个工具,这个工具的目的就是处理一些高复杂度的基因组,比如说高杂合度或者基因组非常大的物种。GenomeScope只能预测二倍体基因组,GenomeScope2.0可以预测多倍体物种。安装$gitclonehttps://github.com/tbenavi1/genomescope2.0.git$cdgenomescope2.0/$Rscriptinstall.R在软件的安装目录下,genomescopre.R文件是核心的运行脚本,用法如下$Rscriptgenomescope.R\-ihistogram_file\-oou