在基因家族分析中，通过pfam数据库检索获得已知基因家族的hmm模型(隐马模型)是必不可少的一步，最近发现pfam数据库有变动，和大家分享一下。1.pfam数据库pfam数据库是一个很常用的蛋白家族数据库，以UniProt数据库收录的蛋白数据为依据创建，目前更新至35.0版本(November2021,19632条数据)。在该数据库可以下载某个基因家族对应的hmm模型文件、比对序列、物种信息、HMMlogo等数据。pfam-data.png其中hmm模型文件包含基因家族序列特征信息，可以搭配hmmer软件，进行基因家族成员的鉴定。示例如下。HMMER3/f[3.1b2|February2015