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JupiterPlot

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「基因组」JupiterPlot评估基因组

JupiterPlot下载地址:https://github.com/JustinChu/JupiterPlot一种基于Circos的工具,与参考基因组相比,可以可视化基因组组装的一致性。依赖软件circos,minimap2,samtools。JupiterPlot安装直接github下载,下载方式很多,下载解压即可。接着需要将minimap2加入当前环境:exportPATH=/share/nas2/genome/biosoft/minimap2/current/:$PATH参考命令如下:分析前,建议提取两个物种染色体序列进行比较画图。exportPATH=/share/nas2/geno