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深度学习三维图像数据增强——Monai实现

深度学习三维图像数据增强——Monai实现一、前言二、数据类型三、Compose四、OneOf五、常见转换类型5.1裁减和填充5.2强度增强5.3空间增强六、注意(记录坑)6.1RandRotate90一、前言笔者接触深度学习不久,跑过一些二维图像的深度学习代码,对于二维图像,深度学习数据增强可借助skimage、opencv、imgaug、Albumentations、Augmentor等多数主流的库实现,在这里放一个大神的链接,可供参考。但对于三维数据,能够借助的库便少了起来,常用的有TorchIO和Monai,而针对于医学领域,Monai是一个不错的选择。笔者通过自学,将Monia库总结

使用 Monai 和 PyTorch 预处理 3D Volumes以进行肿瘤分割

1.介绍针对在使用传统图像处理工具时可能遇到的困难,深度学习已成为医疗保健领域的主要解决方案。因为医学图像比标准图像更难处理(高对比度、人体的广泛变化……)深度学习用于分类、对象检测,尤其是分割任务。在分割方面,深度学习用于分割人体器官,如肝脏、肺和……或分割来自身体不同部位的肿瘤。医学图像有很多不同的类型,例如MRI(主要用于脑肿瘤分割)、CT扫描、PET扫描等。本文将重点介绍CT扫描,但同样的操作也适用于其他类型。所以我们知道执行深度学习任务需要许多步骤,其中一个是数据预处理,这是我们在开始训练之前必须做的第一件事。这是本文的主题;我们将讨论可用于执行此预处理的工具。准备数据因任务而异;例

基于MONAI模型生成医学图像

译者|朱先忠审校|重楼大家好!在这篇文章中,我们将使用MONAI最新的开源扩展——MONAI生成式模型来创建一个潜在扩散模型(LatentDiffusionModel),并通过此模型生成胸部X射线图像!简介生成式人工智能在医疗保健方面展现出巨大的潜力,因为它允许我们创建模型来学习训练数据集的基本模式和结构。通过这种方式,我们可以使用这些生成式模型来创建无数的合成数据,这些数据具有与真实数据相同的细节和特征,并且不受到这些内容的具体限制。鉴于其重要性,我们创建了MONAI生成模型,这是包含时下众多最新模型(如扩散模型、自回归转换器和生成对抗性网络)和有助于训练和评估生成模型相应组件的MONAI平