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python - 表现各种numpy花式索引方法,也与numba

因为对于我的程序来说,快速索引Numpy数组是非常必要的,考虑到性能,花哨的索引没有良好的声誉,所以我决定做一些测试。尤其是当Numba发展得很快时,我尝试了哪些方法与numba一起工作得很好。作为输入,我一直在使用以下数组进行小数组测试:importnumpyasnpimportnumbaasnbx=np.arange(0,100,dtype=np.float64)#arraytobeindexedidx=np.array((0,4,55,-1),dtype=np.int32)#fancyindexingarraybool_mask=np.zeros(x.shape,dtype=np

python - 如何将附加参数传递给 numba cfunc 作为 LowLevelCallable 传递给 scipy.integrate.quad

文档discusses使用numba的cfunc作为scipy.integrate.quad的LowLevelCallable参数。我需要同样的东西和额外的参数。我基本上是想做这样的事情:importnumpyasnpfromnumbaimportcfuncimportnumba.typesvoidp=numba.types.voidptrdefintegrand(t,params):a=params[0]#thisisadditionalparameterreturnnp.exp(-t/a)/t**2nb_integrand=cfunc(numba.float32(numba.flo

python - 使用 numba 加速 for 循环

据我所知,numba可以显着加快python程序的速度。使用numba可以提高我程序的时间效率吗?importnumpyasnpdeff_big(A,k,std_A,std_k,mean_A=10,mean_k=0.2,hh=100):return(1/(std_A*std_k*2*np.pi))*A*(hh/50)**k*np.exp(-1*(k-mean_k)**2/(2*std_k**2)-(A-mean_A)**2/(2*std_A**2))outer_sum=0dk=0.000001forkinnp.arange(dk,0.4,dk):inner_sum=0forAinnp.

python - Julia 性能与 Python+Numba LLVM/JIT 编译代码的比较

目前为止我看到的Julia性能基准,例如http://julialang.org/,将Julia与纯Python或Python+NumPy进行比较。与NumPy不同,SciPy使用BLAS和LAPACK库,我们在其中获得了最佳的多线程SIMD实现。如果我们假设在调用BLAS和LAPACK函数(底层)时Julia和Python的性能相同,那么在将Numba或NumbaPro用于不调用BLAS或LAPACK函数的代码时,Julia的性能与CPython相比如何?我注意到的一件事是Julia使用的是LLVMv3.3,而Numba使用的是llvmlite,后者构建于LLVMv3.5之上。Jul

python - Numba 代码比纯 python 慢

我一直致力于加速粒子过滤器的重采样计算。由于python有很多加速它的方法,我想我会尝试所有的方法。不幸的是,numba版本非常慢。由于Numba应该会导致加速,我认为这是我的错误。我尝试了4个不同的版本:努巴pythonNumPy赛通每个的代码如下:importnumpyasnpimportscipyasspimportnumbaasnbfromcython_resampleimportcython_resample@nb.autojitdefnumba_resample(qs,xs,rands):n=qs.shape[0]lookup=np.cumsum(qs)results=np

python - 为什么这个 numba 代码比 numpy 代码慢 6 倍?

下面的代码跑2s有什么原因吗,defeuclidean_distance_square(x1,x2):return-2*np.dot(x1,x2.T)+np.expand_dims(np.sum(np.square(x1),axis=1),axis=1)+np.sum(np.square(x2),axis=1)而下面的numba代码在12秒内运行?@jit(nopython=True)defeuclidean_distance_square(x1,x2):return-2*np.dot(x1,x2.T)+np.expand_dims(np.sum(np.square(x1),axis=

python - 使用 Numba 时如何并行化此 Python for 循环

我正在使用Python的Anaconda发行版和Numba,我编写了以下Python函数来乘以稀疏矩阵A(存储在CSR格式)通过密集向量x:@jitdefcsrMult(x,Adata,Aindices,Aindptr,Ashape):numRowsA=Ashape[0]Ax=numpy.zeros(numRowsA)foriinrange(numRowsA):Ax_i=0.0fordataIdxinrange(Aindptr[i],Aindptr[i+1]):j=Aindices[dataIdx]Ax_i+=Adata[dataIdx]*x[j]Ax[i]=Ax_ireturnAx这

python - 与 CPython 相比,Numba 和 Cython 没有显着提高性能,也许我使用不正确?

大编辑:================为了清楚起见,我删除了旧结果并用更新的结果替换它。问题还是一样:我是否正确地同时使用了Cython和Numba,以及可以对代码进行哪些改进?(我有一个更新更简单的临时IPython笔记本,其中包含所有代码和结果here)1)我想我明白了为什么最初Cython、Numba和CPython之间没有区别:这是因为我喂了它们numpy数组作为输入:x=np.asarray([x_i*np.random.randint(8,12)/10forx_iinrange(n)])代替列表:x=[x_i*random.randint(8,12)/10forx_iin

python - 如何在类的成员函数上使用 numba?

我使用的是稳定版Numba0.30.1。我能做到:importnumbaasnb@nb.jit("void(f8[:])",nopython=True)defcomplicated(x):forainx:b=a**2.+a**3.作为测试用例,加速是巨大的。但是如果我需要加速类中的函数,我不知道如何进行。importnumbaasnbdefmyClass(object):def__init__(self):self.k=1#@nb.jit(???,nopython=True)defcomplicated(self,x):forainx:b=a**2.+a**3.+self.k我为sel

python - 多个输出和 numba 签名

也许这是微不足道的,但我想知道当有多个输出时如何在jit装饰器中编写签名。例如:importnumbaasnb@nb.jit(['???(int32,int32,float(:,:),float(:,:))'],nopython=True)deffoo(nx,ny,a,b):foriinrange(nx):foriinrange(ny):dostuffwitha&breturna,b表演怎么样?编写两个不同的函数是否更好? 最佳答案 您可以使用显式声明或字符串声明:具有同类类型的元组:@nb.jit(nb.types.UniTupl