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2021.05.17【R语言】丨clusterProfiler注释表——KEGG/GO enrich富集图专用

摘要  刚开始接触项目的时候一直用公司搭建好的流程分析项目,慢慢学习后,发现有些地方的注释除了靠参考基因组相关的注释文档,还需要对应物种。在R中绘制KEGG.GOenrich富集图就需要根据物种来读取相应注释包,这里记录一份常用物种及对应注释包表,方便以后使用。注释表packagesorganismorg.Ag.eg.dbAnophelesorg.At.tair.dbArabidopsisorg.Bt.eg.dbBovineorg.Ce.eg.dbWormorg.Cf.eg.dbCanineorg.Dm.eg.dbFlyorg.Dr.eg.dbZebrafishorg.EcK12.eg.dbE

2021.05.17【R语言】丨clusterProfiler注释表——KEGG/GO enrich富集图专用

摘要  刚开始接触项目的时候一直用公司搭建好的流程分析项目,慢慢学习后,发现有些地方的注释除了靠参考基因组相关的注释文档,还需要对应物种。在R中绘制KEGG.GOenrich富集图就需要根据物种来读取相应注释包,这里记录一份常用物种及对应注释包表,方便以后使用。注释表packagesorganismorg.Ag.eg.dbAnophelesorg.At.tair.dbArabidopsisorg.Bt.eg.dbBovineorg.Ce.eg.dbWormorg.Cf.eg.dbCanineorg.Dm.eg.dbFlyorg.Dr.eg.dbZebrafishorg.EcK12.eg.dbE

Java基础---数据类型

数据类型Java的两大数据类型:内置数据类型、引用数据类型内置数据类型Java语言提供了八种基本类型。六种数字类型(四个整数型,两个浮点型),一种字符类型,还有一种布尔型。byte、short、int、long、float、double、char、boolean基本类型范围byte:(8位)-128~127short:(26位)一个short变量是int型变量所占空间的二分之一int:(32位)-2^31~2^31-1long:(64位)、默认值是0Lfloat:(32位)、默认值是0.0fdouble:(64位)、默认值是0.0dboolean:默认值是falsechar:(16位)、【\u

Java基础---数据类型

数据类型Java的两大数据类型:内置数据类型、引用数据类型内置数据类型Java语言提供了八种基本类型。六种数字类型(四个整数型,两个浮点型),一种字符类型,还有一种布尔型。byte、short、int、long、float、double、char、boolean基本类型范围byte:(8位)-128~127short:(26位)一个short变量是int型变量所占空间的二分之一int:(32位)-2^31~2^31-1long:(64位)、默认值是0Lfloat:(32位)、默认值是0.0fdouble:(64位)、默认值是0.0dboolean:默认值是falsechar:(16位)、【\u

Python - logging.Formatter 的常用格式字符串

格式字符串作用%(name)s日志记录器的名称(记录通道)%(levelno)s日志记录级别的数字DEBUG=10、INFO=20、WARNING=30、ERROR=40、CRITICAL=50%(levelname)s日志记录级别的文本“DEBUG”、“INFO”、“WARNING”、“ERROR”、“CRITICAL”%(pathname)s日志调用的源文件的完整路径名%(filename)s日志调用的源文件的文件名部分%(module)s日志调用的源文件的文件名的名称部分%(lineno)d日志调用的源行号%(funcName)s日志调用的函数名%(created)f打印日志的时间tim

Python - logging.Formatter 的常用格式字符串

格式字符串作用%(name)s日志记录器的名称(记录通道)%(levelno)s日志记录级别的数字DEBUG=10、INFO=20、WARNING=30、ERROR=40、CRITICAL=50%(levelname)s日志记录级别的文本“DEBUG”、“INFO”、“WARNING”、“ERROR”、“CRITICAL”%(pathname)s日志调用的源文件的完整路径名%(filename)s日志调用的源文件的文件名部分%(module)s日志调用的源文件的文件名的名称部分%(lineno)d日志调用的源行号%(funcName)s日志调用的函数名%(created)f打印日志的时间tim

快速了解NSL-KDD数据集

NSL-KDD数据集是著名的KDD’99数据集的修订版本,该数据集由四个子数据集组成:KDDTest+、KDDTest-21、KDDTrain+、KDDTrain+_20Percent。其中KDDTest-21和KDDTrain+_20Percent是KDDTrain+和KDDTest+的子集。数据集每条记录包含43个特征,其中41个特征指的是流量输入本身,最后两个是标签(正常或攻击)和分数(流量输入本身的严重性)。数据集中存在4种不同类型的攻击:拒绝服务(DoS)、探测、用户到根(U2R)和远程到本地(R2L)。每种攻击的简要说明如下:DoS是一种尝试关闭进出目标系统的流量的攻击。IDS被系

快速了解NSL-KDD数据集

NSL-KDD数据集是著名的KDD’99数据集的修订版本,该数据集由四个子数据集组成:KDDTest+、KDDTest-21、KDDTrain+、KDDTrain+_20Percent。其中KDDTest-21和KDDTrain+_20Percent是KDDTrain+和KDDTest+的子集。数据集每条记录包含43个特征,其中41个特征指的是流量输入本身,最后两个是标签(正常或攻击)和分数(流量输入本身的严重性)。数据集中存在4种不同类型的攻击:拒绝服务(DoS)、探测、用户到根(U2R)和远程到本地(R2L)。每种攻击的简要说明如下:DoS是一种尝试关闭进出目标系统的流量的攻击。IDS被系

Python urllib2、基本 HTTP 身份验证和 tr.im

我在玩,试图写一些代码来使用tr.im用于缩短URL的API。看完http://docs.python.org/library/urllib2.html,我试过了:TRIM_API_URL='http://api.tr.im/api'auth_handler=urllib2.HTTPBasicAuthHandler()auth_handler.add_password(realm='tr.im',uri=TRIM_API_URL,user=USERNAME,passwd=PASSWORD)opener=urllib2.build_opener(auth_handler)urllib2.

Python urllib2、基本 HTTP 身份验证和 tr.im

我在玩,试图写一些代码来使用tr.im用于缩短URL的API。看完http://docs.python.org/library/urllib2.html,我试过了:TRIM_API_URL='http://api.tr.im/api'auth_handler=urllib2.HTTPBasicAuthHandler()auth_handler.add_password(realm='tr.im',uri=TRIM_API_URL,user=USERNAME,passwd=PASSWORD)opener=urllib2.build_opener(auth_handler)urllib2.